论文目录 | |
中文摘要 | 第11-17页 |
ABSTRACT | 第17-21页 |
符号说明 | 第21-23页 |
第一章 绪论 | 第23-50页 |
1.1 ABO血型系统 | 第24-30页 |
1.1.1 ABO血型抗原及形成 | 第24-25页 |
1.1.2 人类的ABO天然抗体 | 第25-26页 |
1.1.3 ABO血型与疾病 | 第26-27页 |
1.1.4 寡糖的合成 | 第27-30页 |
1.2 糖核苷酸及其合成 | 第30-37页 |
1.2.1 糖核苷酸的种类及功能 | 第30-31页 |
1.2.2 糖核苷酸的化学合成 | 第31-32页 |
1.2.3 糖核苷酸的酶法合成 | 第32-36页 |
1.2.4 糖核苷酸的发酵法合成 | 第36-37页 |
1.3 细菌表面多糖 | 第37-40页 |
1.3.1 细菌表面多糖的分类 | 第37-39页 |
1.3.2 细菌表面多糖与血型抗体的相互作用 | 第39-40页 |
1.4 肠道菌群与人类的关系 | 第40-48页 |
1.4.1 肠道菌群的组成 | 第40-42页 |
1.4.2 肠道菌的功能 | 第42-44页 |
1.4.3 肠道菌群与疾病 | 第44-48页 |
1.4.3.1 肠道菌群与肠道疾病 | 第44-46页 |
1.4.3.2 肠道菌群与肥胖和2型糖尿病 | 第46-47页 |
1.4.3.3 肠道菌群与免疫系统疾病 | 第47-48页 |
1.4.3.4 肠道菌群与神经精神疾病 | 第48页 |
1.5 论文内容大纲 | 第48-50页 |
第二章 trGlmU-NahK融合酶的性质研究以及在UDP-GlcNAc合成中的应用 | 第50-65页 |
2.0 引言 | 第50-51页 |
2.1 实验材料 | 第51-52页 |
2.1.1 菌株和载体 | 第51页 |
2.1.2 酶、试剂和耗材 | 第51页 |
2.1.3 主要仪器 | 第51-52页 |
2.2 实验方法 | 第52-57页 |
2.2.1 基因克隆与表达载体的构建 | 第52-54页 |
2.2.2 NahK- trGlmU融合酶的表达与纯化 | 第54页 |
2.2.3 酶的活性检测 | 第54-55页 |
2.2.4 定量检测方法 | 第55页 |
2.2.5 最适催化条件的摸索 | 第55-56页 |
2.2.6 酶活的测定方法 | 第56页 |
2.2.7 UDP-GlcNAc的小规模合成 | 第56-57页 |
2.2.8 UDP-GlcNAc的纯化 | 第57页 |
2.3 结果与讨论 | 第57-63页 |
2.3.1 NahK和trGlmU融合片段的克隆 | 第57页 |
2.3.2 NahK、GlmU以及trGlmU-NahK融合酶的表达与纯化 | 第57-58页 |
2.3.3 NahK、GlmU以及trGlmU-NahK的活性检测 | 第58-60页 |
2.3.4 trGlmU-NahK融合酶与NahK和GlmU的生物化学性质比较 | 第60-61页 |
2.3.5 UDP-GlcNAc的小规模制备 | 第61-62页 |
2.3.6 UDP-GlcNAc的纯化 | 第62-63页 |
2.4 本章小结 | 第63-65页 |
第三章 GDP-Fuc的发酵法合成 | 第65-83页 |
3.0 引言 | 第65-67页 |
3.1 实验材料 | 第67页 |
3.1.1 菌株和载体 | 第67页 |
3.1.2 酶、试剂和耗材 | 第67页 |
3.1.3 主要仪器 | 第67页 |
3.2 实验方法 | 第67-72页 |
3.2.1 基因克隆与表达载体的构建 | 第67-70页 |
3.2.2 重组菌株诱导条件的摸索 | 第70页 |
3.2.3 重组菌株的摇瓶发酵 | 第70页 |
3.2.4 重组菌株的分批补料发酵 | 第70-71页 |
3.2.5 菌体干重的测量 | 第71页 |
3.2.6 发酵液中葡萄糖浓度和岩藻糖浓度的检测 | 第71页 |
3.2.7 比生长速率的计算 | 第71-72页 |
3.2.8 细胞内GDP-Fuc、GMP和GTP的提取 | 第72页 |
3.2.9 GDP-Fuc、GMP和GTP的检测方法 | 第72页 |
3.3 结果与讨论 | 第72-81页 |
3.3.1 代谢工程菌株的构建 | 第72-74页 |
3.3.2 重组酶表达条件的确定 | 第74-76页 |
3.3.3 工程菌株生长状况的比较 | 第76-77页 |
3.3.4 重组菌株产生GDP-Fuc的比较 | 第77-79页 |
3.3.5 菌株B的分批补料发酵 | 第79-81页 |
3.3.6 鸟嘌呤核苷酸合成加强的确定 | 第81页 |
3.4 本章小结 | 第81-83页 |
第四章 人类ABO血型与肠道菌群的关系 | 第83-113页 |
4.0 引言 | 第83-84页 |
4.1 实验材料 | 第84-85页 |
4.1.1 实验所用菌株 | 第84页 |
4.1.2 抗体、试剂和耗材 | 第84-85页 |
4.1.3 主要仪器 | 第85页 |
4.2 实验方法 | 第85-92页 |
4.2.0 提供样品志愿者的招募 | 第85页 |
4.2.1 血型的确认 | 第85-86页 |
4.2.2 粪便样品的采集 | 第86页 |
4.2.3 DNA的提取与质量检测 | 第86页 |
4.2.4 DNA样品16S rDNAV3-V5区的454测序 | 第86-88页 |
4.2.5 序列的整理和归并 | 第88-89页 |
4.2.6 OTU的获得 | 第89页 |
4.2.7 OTU及其丰度分析 | 第89页 |
4.2.8 基于OTU的物种组成和丰度分析 | 第89-90页 |
4.2.9 样品Alpha多样性分析 | 第90页 |
4.2.10 肠道菌群的分离提取 | 第90-91页 |
4.2.11 菌体的固定 | 第91页 |
4.2.12 菌体表面多糖血型抗原活性的检测 | 第91-92页 |
4.3 结果与讨论 | 第92-111页 |
4.3.1 收集样品情况 | 第92页 |
4.3.2 序列统计 | 第92-93页 |
4.3.3 OTU统计 | 第93-94页 |
4.3.4 OTU Veen图分析 | 第94-95页 |
4.3.5 不同血型样品共有或特有的OTU分析 | 第95-97页 |
4.3.6 肠道菌群的系统发育分析 | 第97-98页 |
4.3.7 主成分分析 | 第98-99页 |
4.3.8 样品的Alpha多样性分析 | 第99-102页 |
4.3.9 不同血型组肠道菌群组成在门水平上的差异比较 | 第102-104页 |
4.3.10 不同血型组的肠道菌群在钢、目和科水平上的差异比较 | 第104-105页 |
4.3.11 不同分组样品在属水平上的有益菌和有害菌的组成差异比较 | 第105-108页 |
4.3.12 肠道菌群的ABO血型抗原活性 | 第108-110页 |
4.3.13 人类ABO血型与肠道菌群的相互作用 | 第110-111页 |
4.4 本章小结 | 第111-113页 |
全文总结 | 第113-115页 |
一、本论文取得的创新性成果 | 第113-114页 |
二、本论文的不足与改进方法 | 第114-115页 |
附录和附图 | 第115-130页 |
参考文献 | 第130-150页 |
致谢 | 第150-151页 |
攻读学位期间发表论文 | 第151-152页 |
外文论文 | 第152-153页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第153页 |