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碳青霉烯类耐药菌NDM-1质粒获取的危险因素和周围基因环境研究

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碳青霉烯类耐药菌NDM-1质粒获取的危险因素和周围基因环境研究
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-13页
中英文缩略词表第13-15页
前言第15-18页
第1章 NDM-1 基因流行状况的研究第18-27页
引言第18页
材料与方法第18-21页
1.材料第18-20页
  1.1 临床标本收集第18-19页
  1.2 主要试剂第19页
  1.3 主要仪器设备第19页
  1.4 本研究所用试剂配方方法第19-20页
2 研究方法第20-21页
  2.1 bla_(NDM-1) 基因筛查第20-21页
  2.2 细菌鉴定及药物敏感性试验第21页
结果第21-25页
  1. bla_(NDM-1) 基因筛选结果第21-22页
  2. bla_(NDM-1) 基因阳性菌株药敏实验结果第22-23页
  3. 碳青霉烯酶表型筛选改良Hodge实验结果第23-24页
  4. bla_(NDM-1) 基因阳性菌株患者的临床资料第24-25页
讨论第25-27页
第2章 NDM-1 耐药菌株感染的危险因素和预后分析第27-38页
引言第27页
材料与方法第27-28页
1.材料第27-28页
  1.1 病例组和对照组第27页
  1.2 菌株来源第27-28页
2.方法第28页
结果第28-36页
1 三组患者人群感染菌株的药物敏感性第28-29页
2 三组病例科室、性别及年龄分布第29-30页
3 三组病例的住院时间、基础疾病、危险因素、临床结局等资料的比较第30-36页
讨论第36-38页
第3章 质粒编码NDM-1 酶的传播特征和周围基因环境第38-63页
引言第38页
材料和方法第38-49页
1.实验材料第38-41页
  1.1 菌株来源第38页
  1.2 主要试剂及器材第38-39页
  1.3 主要仪器设备第39页
  1.4 本研究所用试剂配方方法第39-41页
2 研究方法第41-49页
  2.1 运用Southern blot技术对含bla_(NDM-1)基因质粒进行定位分析第41-45页
  2.2 质粒接合试验第45-46页
  2.3 质粒DNA高通量测序第46-47页
  2.4 测序序列质量评价及统计第47页
  2.5 质粒基因组的拼装第47-48页
  2.6 比较基因组分析第48-49页
结果第49-60页
1 含bla_(NDM-1)基因菌株质粒提取情况第49-50页
2 Southern blot对含bla_(NDM-1)质粒进行定位结果第50-51页
3 质粒接合实验结果第51页
4 质粒基因组测序第51-54页
  4.1 质粒基因组建库结果第51-52页
  4.2 质粒测序质量评价第52-53页
  4.3 质粒基因组拼装第53页
  4.4 质粒基因组注释第53-54页
5 质粒基因组比较第54-60页
  5.1 p11106与p12与pNDM-BTR比较第55页
  5.2 p11106和p12与pSARB26_02 比较第55-56页
  5.3 p11106和p12与pKOX105(HM126016)基因组比较第56-57页
  5.4 p11106和p12与pMR3-OXA181(KM660724)基因组比较第57页
  5.5 p11106和p12与pIMP-SH1506(KT989598)基因组比较第57-58页
  5.6 p11106和p12与pIMP-FJ1503(KU051710)基因组比较第58页
  5.7 p11106和p12与pIMP-KP1495(KU051710)基因组比较第58-59页
  5.8 质粒基因组比较总结第59-60页
讨论第60-63页
结论与展望第63-65页
1 结论第63页
2 本研究的主要创新性第63-64页
3 展望第64-65页
致谢第65-66页
参考文献第66-71页
攻读学位期间的研究成果及荣誉第71-74页
综述第74-84页
参考文献第82-84页

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