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肝脏中CRL4DCAF8泛素连接酶调控组蛋白H3泛素化并促进H3K9甲基化

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肝脏中CRL4DCAF8泛素连接酶调控组蛋白H3泛素化并促进H3K9甲基化
论文目录
 
致谢第1-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略词表第11-17页
1 绪论第17-33页
  1.1 核小体结构第17-18页
  1.2 组蛋白修饰是表观遗传学的重要内容第18-22页
  1.3 组蛋白H3泛素化修饰第22-23页
  1.4 蛋白质泛素化系统第23-25页
  1.5 DCAF是CRL4泛素化底物过程中重要的环节第25-26页
  1.6 肝脏内胚胎发育相关基因的表达与调控机制第26-27页
  1.7 肝脏发育调控的研究现状第27-29页
    1.7.1 胚胎时期肝脏发育受多种转录因子和细胞通路调控第27-28页
    1.7.2 个体出生后肝脏的发育调控研究现状第28-29页
  1.8 表观遗传学在肝脏发育调控中的功能第29-30页
  1.9 Crispr/cas9构建基因敲除稳定遗传细胞系第30-31页
  1.10 本课题解决的科学问题第31-33页
2 材料与方法第33-61页
  2.1 实验材料第33-43页
    2.1.1 实验动物第33页
    2.1.2 实验试剂第33-35页
    2.1.3 细胞系第35页
    2.1.4 抗体第35-36页
    2.1.5 质粒和细菌第36页
    2.1.6 实验仪器第36-38页
    2.1.7 相关溶液配制第38-40页
    2.1.8 引物序列第40-43页
  2.2 实验方法第43-61页
    2.2.1 小鼠基因型鉴定第43-44页
    2.2.2 基因表达载体的构建第44页
    2.2.3 细胞培养第44-45页
    2.2.4 细胞转染第45-46页
    2.2.5 RNAi技术第46页
    2.2.6 RNA提取,逆转录以及荧光定量PCR(Q-PCR)技术第46-48页
    2.2.7 Western Blotting第48-51页
    2.2.8 蛋白质免疫共沉淀技术第51页
    2.2.9 细胞染色技术第51-54页
    2.2.10 电子显微镜成像第54页
    2.2.11 原代肝细胞分离及培养第54-55页
    2.2.12 染色质免疫共沉淀分析(ChIP)第55-56页
    2.2.13 组蛋白提取第56页
    2.2.14 质谱分析第56-57页
    2.2.15 核小体占位(nucleosome occupancy)分析第57页
    2.2.16 CpG岛甲基化分析第57页
    2.2.17 病毒包装及稳定细胞系构建第57-58页
    2.2.18 质粒的大规模抽提第58-60页
    2.2.19 统计学处理第60-61页
3 实验结果第61-92页
  3.1 肝脏中组蛋白H3可被泛素化第61-63页
  3.2 组蛋白H3在肝脏中的泛素化过程由CRL4催化第63-65页
  3.3 DCAF8是连接CRL4和组蛋白H3的接头蛋白第65-70页
  3.4 组蛋白H3泛素化发生在H3K79位点第70-73页
  3.5 H3K79泛素化特异性抗体的制备及验证第73-74页
  3.6 CRL4~(DCAF8)的失活重新激活肝脏中发育相关基因的表达第74-77页
  3.7 个体发育过程中,依赖于CRL4~(DCAF8)的组蛋白H3的泛素化逐渐增强,抑制了肝脏发育相关基因的表达第77-79页
  3.8 不同肝癌细胞系中肝脏发育相关基因的表达和组蛋白H3泛素化水平具有相关性第79-81页
  3.9 肝癌细胞系中肝脏发育相关基因的表达受依赖于CRL4~(DCAF8)的H3泛素化调控第81-83页
  3.10 部分临床肝癌肝癌患者的癌组织比癌旁组织组蛋白H3泛素化水平低第83-85页
  3.11 组蛋白H3泛素化通过改变基因启动子区域H3K9甲基化水平调控基因表达第85-88页
  3.12 H3K79泛素化下降导致肝细胞衰老第88-92页
4 结论及意义第92-93页
5 讨论第93-97页
  5.1 CRL4~(DCAF8)泛素化组蛋白H3第93-94页
  5.2 H3K79泛素化与H3K9甲基化的相互影响第94页
  5.3 H3K79泛素化促进肝脏成熟第94-95页
  5.4 DCAF8可能是在细胞中潜在的癌基因第95-97页
参考文献第97-105页
作者简历及在读期间所取得的科研成果第105页

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