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EB病毒感染调控长链非编码RNA H19参与胃癌发生发展的研究

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EB病毒感染调控长链非编码RNA H19参与胃癌发生发展的研究
论文目录
 
中文摘要第1-4页
Abstract第4-9页
第一部分 基于RNA-Seq的EB病毒感染前后胃癌细胞系AGS中差异表达长链非编码RNA(lncRNA)的筛选第9-48页
中文摘要第9-10页
英文摘要第10-12页
引言第12-14页
第一章 材料与方法第14-26页
  1.1 仪器、试剂和耗材第14-15页
  1.2 细胞处理第15页
  1.3 Illumina Hiseq 2000 平台测序流程第15-16页
  1.4 RNA-Seq文库构建及测序数据的生成第16-22页
  1.5 RNA-Seq测序数据的生物信息分析第22-26页
第二章 结果第26-35页
  2.1 RNA质检第26页
  2.2 测序数据预处理结果第26页
  2.3 与参考基因组对比结果第26-27页
  2.4 各组总lncRNA表达情况第27页
  2.5 差异表达的lncRNA第27-30页
  2.6 lncRNA靶基因预测第30页
  2.7 lncRNA靶基因功能富集分析第30-32页
  2.8 mRNA与lnc RNA的表达水平及结构比较分析第32-35页
第三章 讨论第35-41页
研究结论第41-42页
参考文献第42-48页
第二部分EB病毒感染调控长链非编码RNA H19参与胃癌的发生及其机制探讨第48-87页
中文摘要第48-50页
英文摘要第50-52页
引言第52-55页
第一章 材料与方法第55-69页
  1.1 仪器、试剂和耗材第55-56页
  1.2 细胞系及胃癌组织标本第56页
  1.3 原位杂交筛选EBV阳性胃癌标本第56-58页
  1.4 细胞系及新鲜胃癌组织DNA的提取第58页
  1.5 石蜡包埋胃癌组织DNA提取第58-60页
  1.6 RNA提取及qRT-PCR第60-62页
  1.7 H19启动子甲基化检测第62-66页
  1.8 H19印记状态检测第66-68页
  1.9 统计学分析第68-69页
第二章 结果第69-77页
  2.1 EBV阳性细胞系及EBV阴性细胞系中lncRNA H19的表达第69页
  2.2 EBVaGC和EBVn GC组织中lncRNA H19的表达第69-70页
  2.3 EBV阳性细胞系及EBV阴性细胞系H19启动子甲基化分析第70-72页
  2.4 EBVaGC和EBVn GC组织H19启动子甲基化分析第72-73页
  2.5 EBVaGC和EBVn GC组织H19启动子等位基因差异性甲基化第73-74页
  2.6 EBVaGC和EBVn GC组织H19印记状态分析第74-77页
第三章 讨论第77-82页
  3.1 在EBV阳性及阴性胃癌中lncRNA H19的表达第77-78页
  3.2 EBVaGC及EBVn GC组织中H19基因印记状态分析第78-79页
  3.3 H19启动子甲基化在调控lncRNA H19表达中的作用第79-82页
研究结论第82-83页
参考文献第83-87页
综述第87-107页
参考文献第98-107页
攻读学位期间的学术成果第107-108页
致谢第108-109页

本篇论文共109页,点击这进入下载页面
 
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