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肠易激综合征和炎症性肠病患者肠道优势菌群特征及其与疾病发生相关性研究

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肠易激综合征和炎症性肠病患者肠道优势菌群特征及其与疾病发生相关性研究
论文目录
 
缩略词第1-10页
中文摘要第10-13页
Abstract第13-16页
第一部分 文献综述第16-74页
  一. 肠易激综合征第16-36页
  1.1 肠易激综合征概论第16-18页
  1.2 肠易激综合征的流行病学第18-21页
    1.2.1 不同地区人群的肠易激综合征患病率第19-20页
    1.2.2 不同性别的肠易激综合征患病率第20页
    1.2.3 不同年龄人群的肠易激综合征患病率第20-21页
    1.2.4 不同种族的肠易激综合征患病率第21页
  1.3 肠易激综合征的致病因素和发病机制第21-36页
    1.3.1 致病因素第21-25页
    1.3.2 肠易激综合征发病机制第25-36页
  二. 炎症性肠病第36-54页
  2.1 炎症性肠病(溃疡性结肠炎和克罗恩病)概论第36-37页
  2.2 炎症性肠病的致病因素和发病机制第37-54页
    2.2.1 遗传因素第38-42页
    2.2.2 环境因素第42-46页
    2.2.3 免疫病理机制第46-54页
  三. 肠道菌群与肠易激综合征、炎症性肠病第54-68页
  3.1 肠道菌群及其功能第54页
  3.2 肠道菌群与肠易激综合征第54-57页
    3.2.1 肠道菌群参与肠易激综合征发病的可能机制第55-57页
  3.3 肠道菌群与炎症性肠病第57-68页
    3.3.1 肠道细菌参与炎症性肠病发病的可能机制第59-63页
    3.3.2 致病微生物感染与炎症性肠病第63-68页
  四. 肠道微生物常用研究方法第68-74页
  4.1 荧光原位杂交技术第68页
  4.2 16SrDNA指纹技术第68-70页
  4.3 基因芯片技术第70-71页
  4.4 Real-time PCR技术第71-72页
  4.5 16SrDNA克隆文库第72-74页
第二部分 实验研究第74-150页
前言第74-78页
一 肠易激综合征第78-101页
1 肠易激综合征患者和健康人粪便样品中优势菌群的PCR-DGGE分析第78-94页
  1.1 材料与方法第78-84页
    1.1.1 参试者筛选及粪便样品采集第78-79页
    1.1.2 粪便样品预处理及细菌总DNA提取第79-80页
    1.1.3 微生物16S rDNA片段的PCR扩增第80-81页
    1.1.4 16S rDNA片段的DGGE第81-82页
    1.1.5 DGGE切胶后PCR扩增及测序第82-83页
    1.1.5 数据统计与分析方法第83-84页
  1.2 结果与分析第84-91页
    1.2.1 DGGE图谱分析第84页
    1.2.2 粪便样品中优势菌群结构相似度分析第84-87页
    1.2.3 粪便样品中优势菌群多样性分析第87-91页
  1.3 讨论第91-94页
2 粪便样品中特定菌种的相对定量Real-time PCR分析第94-101页
  2.1 材料与方法第94-96页
    2.1.1 模板稀释第94页
    2.1.2 细菌种属特异性引物筛选第94-95页
    2.1.3 Real-time PCR反应体系第95页
    2.1.4 数据分析第95-96页
  2.2 结果与分析第96-99页
    2.2.1 Real-time PCR结果评价第96页
    2.2.2 肠易激综合征患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量第96-99页
  2.3 讨论第99-101页
  二. 溃疡性结肠炎第101-118页
1 溃疡性结肠炎患者和健康人粪便样品中优势菌群的PCR-DGGE分析第101-111页
  1.1 材料与方法第101-103页
    1.1.1 参试者筛选及粪便样品采集第101-102页
    1.1.2 粪便样品预处理及细菌总DNA提取第102页
    1.1.3 微生物16S rDNA片段的PCR扩增第102页
    1.1.4 16S rDNA片段的变性梯度凝胶电泳(DGGE)第102页
    1.1.5 数据处理与分析第102-103页
  1.2 结果与分析第103-109页
    1.2.1 DGGE图谱分析第103页
    1.2.2 粪便样品中优势菌群的结构相似度分析第103-105页
    1.2.3 粪便样品中优势菌群的多样性第105-109页
  1.3 讨论第109-111页
2 溃疡性结肠炎患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量Real-time PCR分析第111-118页
  2.1 材料与方法第111-113页
    2.1.1 模板稀释第111页
    2.1.2 细菌种属特异性引物筛选第111-112页
    2.1.3 Real-time PCR反应体系第112页
    2.1.4 数据分析第112-113页
  2.2 结果与分析第113-116页
    2.2.1 Real-time PCR结果评价第113页
    2.2.2 溃疡性结肠炎患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量第113-116页
  2.3 讨论第116-118页
  三. 克罗恩病第118-136页
1 克罗恩患者和健康人粪便样品中优势菌群的PCR-DGGE分析第118-130页
  1.1 材料与方法第118-120页
    1.1.2 粪便样品预处理及细菌总DNA提取第118-119页
    1.1.3 微生物16S rDNA片段的PCR扩增第119页
    1.1.4 16S rDNA片段的DGGE第119页
    1.1.5 数据处理与分析第119-120页
  1.2 结果与分析第120-127页
    1.2.1 DGGE图谱分析第120页
    1.2.2 粪便样品中优势菌群结构相似度分析第120-122页
    1.2.3 粪便样品中优势菌群的多样性第122-127页
  1.3 讨论第127-130页
2 CD患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量Real-time PCR分析第130-136页
  2.1 材料与方法第130-131页
    2.1.1 模板稀释第130页
    2.1.2 细菌种属特异性引物筛选第130页
    2.1.3 Real-time PCR反应体系第130页
    2.1.4 数据分析第130-131页
  2.2 结果与分析第131-134页
    2.2.1 Real-time PCR结果评价第131页
    2.2.2 克罗恩病患者和健康人粪便样品中特定菌种的相对定量第131-134页
  2.3 讨论第134-136页
  四. 肠易激综合征、炎症性肠病和健康人患者粪便样品中短链脂肪酸测定第136-150页
1 材料与方法第136-138页
  1.1 短链脂肪酸的萃取及气相色谱检测第136页
  1.2 数据分析第136-138页
2 结果与分析第138-147页
  2.1 肠易激综合征患者和健康人粪便样品中短链脂肪酸含量第138-140页
  2.2 溃疡性结肠炎患者和健康人粪便样品中短链脂肪酸含量第140-142页
  2.3 克罗恩病患者和健康人粪便样品中短链脂肪酸含量第142-144页
  2.4 肠易激综合征、炎症性肠病患者和健康人粪便样品中总SCFAs含量第144-147页
3 讨论第147-150页
参考文献第150-184页
全文结论第184-186页
主要创新点第186-187页
发表和待发表的SCI论文及专利申请第187-188页
致谢第188-189页

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