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转录组测序鉴定EB病毒相关胃癌差异表达基因及基因多态性的研究

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转录组测序鉴定EB病毒相关胃癌差异表达基因及基因多态性的研究
论文目录
 
中文摘要第1-5页
Abstract第5-11页
第一部分 胃癌细胞系AGS感染EB病毒前后转录组测序分析研究第11-60页
中文摘要第11-13页
英文摘要第13-15页
引言第15-18页
第一章 材料与方法第18-27页
  1.1 仪器、试剂和耗材第18-19页
  1.2 细胞处理第19页
  1.3 RNA测序数据的生成第19-24页
  1.4 RNA测序数据拼接处理第24-27页
第二章 结果第27-44页
  2.1 样本采集与分组信息第27页
  2.2 测序数据预处理结果第27-28页
  2.3 与参考基因组比对结果第28-29页
  2.4 组间总m RNA和差异m RNA分析第29页
  2.5 基因表达水平分析第29-32页
  2.6 差异m RNA基因GO富集分析第32-35页
  2.7 差异m RNA基因KEGG富集分析第35-38页
  2.8 单核苷酸多态性与插入缺失分析第38-41页
  2.9 可变剪切分析第41-43页
  2.10 EBV表达基因分析第43-44页
第三章 讨论第44-53页
研究结论第53-54页
参考文献第54-60页
第二部分EBVa GC组织中差异表达基因及基因多态性的研究第60-105页
中文摘要第60-62页
英文摘要第62-64页
引言第64-66页
第一章 材料与方法第66-78页
  1.1 仪器、试剂和耗材第66-67页
  1.2 标本采集第67页
  1.3 免疫组化检测REG4表达第67-68页
  1.4 细胞系及新鲜胃癌组织DNA提取第68-69页
  1.5 石蜡包埋胃癌组织DNA提取第69-70页
  1.6 原位杂交筛选EBV阳性胃癌标本第70-71页
  1.7 胃癌细胞系RNA提取及q RT-PCR第71-74页
  1.8 基因多态性分析第74-76页
  1.9 统计学分析第76-78页
第二章 结果第78-93页
  2.1 差异表达基因的验证第78页
  2.2 REG4蛋白在EBVa GC和EBVn GC肿瘤中的表达第78-79页
  2.3 基因多态性在EBVa GC和EBVn GC中的分布第79-93页
第三章 讨论第93-99页
  3.1 EBV感染后的差异表达基因第93-95页
  3.2 基因多态性在EBVn GC和EBVa GC的分布第95-99页
研究结论第99-100页
参考文献第100-105页
附:英文缩写词索引第105-107页
综述第107-119页
综述参考文献第115-119页
攻读学位期间研究成果第119-120页
致谢第120-121页

本篇论文共121页,点击这进入下载页面
 
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