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转录组测序鉴定EB病毒相关胃癌差异表达基因及基因多态性的研究
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转录组测序鉴定EB病毒相关胃癌差异表达基因及基因多态性的研究
论文目录
中文摘要
第1-5页
Abstract
第5-11页
第一部分 胃癌细胞系AGS感染EB病毒前后转录组测序分析研究
第11-60页
中文摘要
第11-13页
英文摘要
第13-15页
引言
第15-18页
第一章 材料与方法
第18-27页
1.1 仪器、试剂和耗材
第18-19页
1.2 细胞处理
第19页
1.3 RNA测序数据的生成
第19-24页
1.4 RNA测序数据拼接处理
第24-27页
第二章 结果
第27-44页
2.1 样本采集与分组信息
第27页
2.2 测序数据预处理结果
第27-28页
2.3 与参考基因组比对结果
第28-29页
2.4 组间总m RNA和差异m RNA分析
第29页
2.5 基因表达水平分析
第29-32页
2.6 差异m RNA基因GO富集分析
第32-35页
2.7 差异m RNA基因KEGG富集分析
第35-38页
2.8 单核苷酸多态性与插入缺失分析
第38-41页
2.9 可变剪切分析
第41-43页
2.10 EBV表达基因分析
第43-44页
第三章 讨论
第44-53页
研究结论
第53-54页
参考文献
第54-60页
第二部分EBVa GC组织中差异表达基因及基因多态性的研究
第60-105页
中文摘要
第60-62页
英文摘要
第62-64页
引言
第64-66页
第一章 材料与方法
第66-78页
1.1 仪器、试剂和耗材
第66-67页
1.2 标本采集
第67页
1.3 免疫组化检测REG4表达
第67-68页
1.4 细胞系及新鲜胃癌组织DNA提取
第68-69页
1.5 石蜡包埋胃癌组织DNA提取
第69-70页
1.6 原位杂交筛选EBV阳性胃癌标本
第70-71页
1.7 胃癌细胞系RNA提取及q RT-PCR
第71-74页
1.8 基因多态性分析
第74-76页
1.9 统计学分析
第76-78页
第二章 结果
第78-93页
2.1 差异表达基因的验证
第78页
2.2 REG4蛋白在EBVa GC和EBVn GC肿瘤中的表达
第78-79页
2.3 基因多态性在EBVa GC和EBVn GC中的分布
第79-93页
第三章 讨论
第93-99页
3.1 EBV感染后的差异表达基因
第93-95页
3.2 基因多态性在EBVn GC和EBVa GC的分布
第95-99页
研究结论
第99-100页
参考文献
第100-105页
附:英文缩写词索引
第105-107页
综述
第107-119页
综述参考文献
第115-119页
攻读学位期间研究成果
第119-120页
致谢
第120-121页
本篇论文共
121
页,
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。
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