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铅胁迫对悬铃木转录组和miRNA表达影响研究

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铅胁迫对悬铃木转录组和miRNA表达影响研究
论文目录
 
致谢第1-5页
摘要第5-11页
第一章 文献综述第11-31页
1 悬铃木的研究进展第11-15页
  1.1 悬铃木的特性第11-13页
  1.2 悬铃木新品种的培育第13-14页
  1.3 悬铃木的抗逆性第14-15页
  1.4 悬铃木的价值第15页
2 转录组学的研究进展第15-19页
  2.1 转录组学的定义第15页
  2.2 转录组学的研究方法第15-17页
    2.2.1 新一代测序技术第16-17页
    2.2.2 新一代测序下数字化基因表达谱技术第17页
  2.3 转录组学的研究应用第17-19页
    2.3.1 转录组学在植物研究领域中的应用第17-18页
    2.3.2 转录组学在植物抗逆分子生物学中应用第18-19页
3 miRNA研究进展第19-24页
  3.1 miRNA的特点及作用机理第19-21页
    3.1.1 miRNA的特点第19-20页
    3.1.2 miRNA的作用机理第20-21页
  3.2 miRNA调控功能第21-22页
    3.2.1 miRNA调控植物生长发育第21页
    3.2.2 miRNA调节植物激素及调控信号传导过程第21-22页
    3.2.3 miRNA与逆境胁迫第22页
  3.3 miRNA研究方法第22-23页
    3.3.1 miRNA的鉴定第22-23页
    3.3.2 miRNA的表达检测技术第23页
  3.4 miRNA靶基因的预测和验证第23-24页
4 植物铅胁迫的研究进展第24-28页
  4.1 铅(Pb)污染的现状第24页
  4.2 重金属铅胁迫对植物生长的影响及生理生化效应第24-26页
    4.2.1 铅胁迫对植物生长的影响第24-25页
    4.2.2 铅胁迫对植物光合作用的影响第25页
    4.2.3 铅胁迫对植物细胞膜透性的影响第25-26页
    4.2.4 铅胁迫对植物抗氧化酶系统的影响第26页
    4.2.5 铅胁迫下植物渗透调节第26页
  4.3 植物对铅的抗性第26-28页
    4.3.1 抑制重金属离子的跨膜转送第27页
    4.3.2 增强抗氧化系统对重金属的抗性第27页
    4.3.3 与植物细胞壁结合第27页
    4.3.4 液泡的区域化作用第27-28页
    4.3.5 根部富集第28页
    4.3.6 体外分泌物的作用第28页
    4.3.7 菌根作用第28页
5 本研究的目的与意义第28-31页
第二章 铅胁迫下悬铃木转录组研究第31-51页
1 引言第31页
2 材料与方法第31-37页
  2.1 材料第31-32页
    2.1.1 植物材料第31页
    2.1.2 主要试剂第31-32页
    2.1.3 主要仪器设备第32页
  2.2 方法第32-37页
    2.2.1 悬铃木总RNA的提取与检测第32页
    2.2.2 悬铃木转录组建库测序第32-34页
    2.2.3 悬铃木转录组信息分析第34-37页
3 结果与分析第37-50页
  3.1 铅胁迫处理预试验第37-38页
  3.2 RNA的检测结果第38页
  3.3 悬铃木转录组信息分析第38-42页
    3.3.1 数据产出第38-39页
    3.3.2 Contig组装第39页
    3.3.3 Unigene组装第39-40页
    3.3.4 All-Unigene组装第40-42页
  3.4 All-Unigene功能分析第42-50页
    3.4.1 同源性比较第42-43页
    3.4.2 COG功能分类第43-44页
    3.4.3 GO功能分类第44-45页
    3.4.4 All-Unigene代谢通路分析第45-49页
    3.4.5 预测编码蛋白框(CDS)第49-50页
4 结论与讨论第50-51页
第三章 铅胁迫悬铃木转录组的差异表达基因分析第51-80页
1 引言第51页
2 材料和生物信息学分析方法第51-54页
  2.1 材料第51页
  2.2 Unigene的表达量注释第51页
  2.3 差异表达基因的筛选第51-52页
  2.4 差异表达基因的qRT-PCR验证第52-53页
  2.5 差异Unigene的GO功能及显著性富集分析第53页
  2.6 差异表达Unigene的Pathway分析及其显著性富集分析第53-54页
3 结果与分析第54-76页
  3.1 Unigene的表达量注释和差异表达基因的筛选第54-59页
  3.2 差异表达基因的qRT-PCR验证分析第59页
  3.3 差异表达Unigene GO功能显著性富集分析第59-62页
  3.4 差异表达基因的代谢途径富集分析第62-65页
  3.5 响应铅胁迫关键基因的候选第65-76页
4 结论和讨论第76-80页
第四章 铅胁迫对悬铃木miRNA变化的影响第80-119页
1 引言第80页
2 材料与方法第80-85页
  2.1 材料第80页
  2.2 方法第80-85页
    2.2.1 总RNA提取与检测第80页
    2.2.2 悬铃木sRNA建库测序第80-81页
    2.2.3 悬铃木sRNA信息分析第81-83页
    2.2.4 已知miRNA鉴定第83页
    2.2.5 新miRNA鉴定第83页
    2.2.6 miRNA差异表达分析第83页
    2.2.7 差异表达miRNA qRT-PCR验证第83-85页
    2.2.8 miRNA靶基因预测第85页
3 结果与分析第85-116页
  3.1 sRNA库构建第85-86页
  3.2 sRNA文库的分类注释分析第86-88页
  3.3 已知miRNA的鉴定第88页
  3.4 新miRNA的鉴定第88-102页
  3.5 铅胁迫相关miRNA的表达量差异分析第102页
  3.6 响应铅胁迫的miRNA的qRT-PCR验证分析第102-106页
  3.7 铅胁迫响应的miRNA靶基因预测第106-114页
  3.8 靶基因GO功能分类第114-116页
4 结论与讨论第116-119页
  4.1 sRNA库构建第116页
  4.2 铅胁迫响应的miRNA及其靶基因主要功能分析第116-119页
第五章 主要研究结论、创新点及展望第119-122页
1 主要研究结论第119-120页
2 主要创新点第120页
3 展望第120-122页
参考文献第122-137页
Abstract第137-140页
作者简历第140页

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