论文目录 | |
摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-15页 |
1 绪论 | 第15-28页 |
1.1 木霉菌分类地位及特点 | 第15-16页 |
1.1.1 木霉菌分类地位 | 第15页 |
1.1.2 木霉菌特点 | 第15-16页 |
1.2 木霉菌生物防治机制 | 第16-19页 |
1.2.1 与病原真菌竞争营养和空间 | 第16-17页 |
1.2.2 重寄生 | 第17页 |
1.2.3 抗生作用 | 第17-18页 |
1.2.4 诱导植物抗病性 | 第18-19页 |
1.3 转录组学及生防木霉菌转录组研究 | 第19-24页 |
1.3.1 转录组与转录组学 | 第19-20页 |
1.3.2 转录组学研究方法 | 第20-22页 |
1.3.3 生防木霉菌转录组研究动态 | 第22-24页 |
1.4 木霉刺激植物响应蛋白Epl1研究现状 | 第24-25页 |
1.4.1 Epl1诱导植物系统抗病性特点 | 第24页 |
1.4.2 Epl1研究进展 | 第24-25页 |
1.5 木霉菌蛋白酶研究动态 | 第25-26页 |
1.5.1 木霉蛋白酶的分类 | 第25-26页 |
1.5.2 木霉蛋白酶生物防治特性 | 第26页 |
1.5.3 木霉蛋白酶研究进展 | 第26页 |
1.6 木研究的目的意义 | 第26-28页 |
2 哈茨木霉ACCC30371菌株转录组的构建及分析 | 第28-44页 |
2.1 实验材料 | 第28-29页 |
2.1.1 供试菌株 | 第28页 |
2.1.2 供试试剂 | 第28页 |
2.1.3 仪器设备和材料 | 第28页 |
2.1.4 培养基 | 第28-29页 |
2.2 研究方法 | 第29-33页 |
2.2.1 哈茨木霉ACCC30371菌株的培养 | 第29页 |
2.2.2 哈茨木霉ACCC30371菌株菌丝RNA提取和质量检测 | 第29-30页 |
2.2.3 哈茨木霉ACCC30371菌株转录组构建 | 第30-31页 |
2.2.4 序列拼接 | 第31-32页 |
2.2.5 转录组序列生物信息学分析及注释 | 第32-33页 |
2.3 结果与分析 | 第33-42页 |
2.3.1 哈茨木霉ACCC30371菌株菌丝RNA的提取及消化 | 第33页 |
2.3.2 哈茨木霉ACCC30371菌株RNA的质量检测 | 第33-34页 |
2.3.3 哈茨木霉ACCC30371菌株转录组测序质量分析 | 第34-37页 |
2.3.4 哈茨木霉ACCC30371菌株转录组数据COG分类 | 第37-38页 |
2.3.5 哈茨木霉ACCC30371菌株转录组Unigenes基因GO分类 | 第38-39页 |
2.3.6 哈茨木霉ACCC30371菌株转录组Unigene的KEGG代谢途径分析 | 第39-42页 |
2.4 关于转录组构建及分析的讨论 | 第42页 |
2.5 本章小结 | 第42-44页 |
3 哈茨木霉转录组生防功能基因的筛选及特性分析 | 第44-64页 |
3.1 实验材料 | 第44页 |
3.1.1 材料 | 第44页 |
3.1.2 仪器设备 | 第44页 |
3.1.3 软件和数据库 | 第44页 |
3.2 研究方法 | 第44页 |
3.2.1 生防功能基因的筛选 | 第44页 |
3.3 结果与分析 | 第44-60页 |
3.3.1 哈茨木霉竞争机制相关基因 | 第44-45页 |
3.3.2 哈茨木霉重寄生作用机制相关的生防基因 | 第45-56页 |
3.3.3 哈茨木霉抗生机制相关基因 | 第56-59页 |
3.3.4 哈茨木霉诱导植物系统抗病性机制基因 | 第59-60页 |
3.4 转录组生防基因与生防机制的讨论 | 第60-63页 |
3.4.1 转录组构建方式与数据质量的关系 | 第60-61页 |
3.4.2 哈茨木霉ACCC30371菌株与其它菌株生防机制比较 | 第61-62页 |
3.4.3 哈茨木霉的重寄生机制 | 第62-63页 |
3.5 本章小结 | 第63-64页 |
4 哈茨木霉ACCC30371菌株epl1基因功能研究 | 第64-96页 |
4.1 实验材料 | 第64-65页 |
4.1.1 供试试剂 | 第64页 |
4.1.2 仪器及材料 | 第64页 |
4.1.3 供试菌株和植物 | 第64页 |
4.1.4 培养基 | 第64-65页 |
4.2 研究方法 | 第65-75页 |
4.2.1 刺激植物响应蛋白Epl1的基因克隆与启动子克隆 | 第65-68页 |
4.2.2 刺激植物响应蛋白Epl1的生物信息学分析 | 第68页 |
4.2.3 哈茨木霉ACCC30371菌株epl1基因表达特性研究 | 第68-71页 |
4.2.4 哈茨木霉ACCC30371菌株epl1基因原核表达载体构建 | 第71-74页 |
4.2.5 重组菌株BL21-pGEX-epl1诱导表达 | 第74-75页 |
4.3 结果与分析 | 第75-93页 |
4.3.1 epl1基因及其启动子克隆 | 第75-77页 |
4.3.2 刺激植物响应蛋白Epl1生物信息学分析 | 第77-83页 |
4.3.3 哈茨木霉ACCC30371菌株epl1基因的表达特性研究 | 第83-89页 |
4.3.4 哈茨木霉ACCC30371菌株epl1基因原核表达载体构建 | 第89-92页 |
4.3.5 重组菌株BL21-pGEX-epl1的诱导表达 | 第92-93页 |
4.4 讨论 | 第93-95页 |
4.4.1 哈茨木霉ACCC30371菌株epl1基因的表达特性 | 第93-94页 |
4.4.2 刺激植物响应蛋白Epl1原核表达诱导条件的优化 | 第94-95页 |
4.5 本章小结 | 第95-96页 |
5 哈茨木霉ACCC30371菌株蛋白酶基因功能研究 | 第96-122页 |
5.1 实验材料 | 第96页 |
5.1.1 实验试剂 | 第96页 |
5.1.2 仪器及材料 | 第96页 |
5.1.3 供试菌株和植物 | 第96页 |
5.1.4 培养基 | 第96页 |
5.2 研究方法 | 第96-98页 |
5.2.1 蛋白酶基因ss的克隆 | 第96页 |
5.2.2 蛋白酶SS的生物信息学分析 | 第96-97页 |
5.2.3 蛋白酶基因ss表达特性研究 | 第97页 |
5.2.4 蛋白酶基因ss原核表达载体的构建 | 第97-98页 |
5.2.5 重组菌株BL21-pGEX-ss诱导表达 | 第98页 |
5.3 结果与分析 | 第98-118页 |
5.3.1 蛋白酶基因ss的cDNA序列与氨基酸序列分析 | 第98-100页 |
5.3.2 蛋白酶SS生物信息学分析 | 第100-108页 |
5.3.3 哈茨木霉ACCC30371菌株蛋白酶基因ss表达特性 | 第108-113页 |
5.3.4 蛋白酶基因ss原核表达载体的构建 | 第113-116页 |
5.3.5 重组菌株BL21-pGEX-ss诱导表达 | 第116-118页 |
5.4 讨论 | 第118-121页 |
5.4.1 关于生物信息学分析的应用 | 第118-119页 |
5.4.2 蛋白酶基因ss的表达特性 | 第119页 |
5.4.3 包涵体与蛋白复性 | 第119-121页 |
5.5 本章小结 | 第121-122页 |
结论 | 第122-124页 |
参考文献 | 第124-133页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第133-134页 |
致谢 | 第134-135页 |