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板栗疫病菌突变体UV57蛋白组学研究及prb1与sahh基因的功能研究

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板栗疫病菌突变体UV57蛋白组学研究及prb1与sahh基因的功能研究
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 前言第12-25页
1 板栗疫病菌第12页
2 低毒病毒第12-13页
3 低毒病毒调控板栗疫病菌致病力和相关性状的机理第13-14页
4 蛋白组学研究基础第14-15页
5 类枯草杆菌蛋白酶第15-19页
  5.1 类枯草杆菌蛋白酶在生物中的分布概况第15-16页
  5.2 类枯草杆菌蛋白酶与真菌表型、致病性相关第16-18页
  5.3 类枯草杆菌蛋白酶参与自噬过程第18-19页
6 S-腺苷高半胱氨酸水解酶第19-23页
  6.1 S-腺苷高半胱氨酸水解酶在生物中的分布第19-20页
  6.2 S-腺苷高半胱氨酸水解酶参与细胞甲基代谢途径第20-22页
  6.3 S-腺苷高半胱氨酸水解酶与动植物病毒复制相关第22页
  6.4 S-腺苷高半胱氨酸水解酶与疾病相关第22-23页
7 本研究的主要内容、目的和意义第23-25页
第二章 材料与方法第25-41页
8 菌种及培养方法第25-26页
  8.1 细菌第25页
    8.1.1 细菌菌种第25页
    8.1.2 大肠杆菌培养基及培养条件第25页
  8.2 真菌第25-26页
    8.2.1 真菌菌种第25页
    8.2.2 板栗疫病菌培养基第25-26页
    8.2.3 板栗疫病菌培养条件第26页
    8.2.4 板栗疫病菌致病性实验第26页
    8.2.5 板栗疫病菌分生孢子定量第26页
9 引物第26-28页
10 核酸工程实验技术第28-36页
  10.1 大量提取真菌总DNA第28页
  10.2 基因突变体的构建第28-30页
    10.2.1 基因缺失片段的构建策略第28-29页
    10.2.3 DNA片段的纯化第29页
    10.2.4 融合PCR第29页
    10.2.5 PCR扩增融合PCR的产物第29页
    10.2.6 PCR产物沉淀浓缩第29-30页
  10.3 DNA克隆第30-31页
    10.3.1 氯化铷法制备大肠杆菌感受态细胞第30页
    10.3.2 DNA连接反应第30页
    10.3.3 质粒DNA的热击转化第30页
    10.3.4 质粒DNA的小规模提取第30-31页
  10.4 互补重组质粒的构建第31页
    10.4.1 PCR扩增互补基因片段第31页
    10.4.2 构建重组载体第31页
  10.5 真菌原生质体的制备、再生和转化第31-33页
    10.5.1 真菌原生质体的制备第32-33页
    10.5.2 真菌原生质体的再生第33页
    10.5.3 真菌原生质体的转化第33页
  10.6 DNA杂交(Southern)第33-35页
  10.7 丝状真菌RNA的提取和纯化第35页
  10.8 荧光定量PCR第35-36页
11 蛋白质工程实验技术第36-40页
  11.1 板栗疫病菌可溶性总蛋白的提取第36-37页
  11.2 蛋白质定量第37页
  11.3 双向凝胶电泳第37-39页
    11.3.1 第一向pH梯度等电聚焦第37页
    11.3.2 平衡第37页
    11.3.3 第二向SDS-PAGE电泳第37页
    11.3.4 硝酸银染色第37-38页
    11.3.5 凝胶电泳图像处理第38页
    11.3.6 蛋白质酶解第38-39页
    11.3.7 质谱鉴定第39页
  11.4 sahh基因编码蛋白质的表达和纯化第39页
    11.4.1 表达质粒的构建第39页
    11.4.2 蛋白表达、纯化和定量第39页
  11.5 蛋白酶活性测定第39-40页
12 固相萃取-反相液相色谱(SPE-HPLC)测胞内SAM、SAH和ADO浓度第40-41页
  12.1 样品的准备和固相萃取第40页
  12.2 反相高效液相色谱法(HPLC)分析胞内SAM、SAH和ADO浓度第40-41页
第三章 结果第41-65页
13 板栗疫病菌突变体UV57第41-50页
  13.1 突变体UV57的生物学特性第41-43页
  13.2 突变体UV57与野生型菌株EP155的差异蛋白组学第43-47页
  13.3 突变体UV57差异表达蛋白的转录水平第47-49页
  13.4 突变体UV57差异表达蛋白的功能分类第49-50页
14 Prb1基因功能研究第50-57页
  14.1 Prb1基因转录水平和蛋白水平的差异分析第50页
  14.2 Prb1基因全长DNA序列和推导的蛋白质分析第50-53页
  14.3 Prb1基因缺失突变体的验证及生物学特征第53-55页
  14.4 Prb1基因的缺失影响板栗疫病菌低毒病毒的累积量第55-57页
15 Sahh基因功能研究第57-65页
  15.1 Sahh基因的转录受低毒病毒调控第57页
  15.2 Sahh基因全长DNA序列和推导的蛋白分析第57页
  15.3 SAHH蛋白的表达、纯化和鉴定第57-59页
  15.4 Sahh基因与板栗疫病菌表型相关第59-61页
  15.5 Sahh基因的缺失导致板栗疫病菌致病力明显下降第61页
  15.6 Sahh基因的缺失影响细胞内ADO、SAH和SAM的浓度第61-63页
  15.7 Sahh基因突变影响甲基代谢途径和G蛋白信号传导途径关键基因的表达第63-65页
第四章 讨论第65-70页
16 突变体UV57蛋白组学研究第65-66页
  16.1 蛋白组学与转录组学研究分析第65页
  16.2 甲基代谢途径相关基因的差异表达分析第65-66页
17 prb1基因功能研究第66-67页
  17.1 Prb1与低毒病毒复制相关分析第66页
  17.2 Prb1的缺失改变真菌表型和毒力分析第66-67页
18 Sahh基因功能研究第67-69页
  18.1 SAHH是生物体内甲基代谢途径的关键元件第67页
  18.2 生物休内DNA甲基化影响基因转录水平第67页
  18.3 SAHH参与细胞内转录后基因沉默第67-68页
  18.4 Sahh通过调节G蛋白信号传导途调节真菌的表型和毒力分析第68-69页
  18.5 SAHH与病毒复制相关分析第69页
19 本研究的不足和今后改进的方向第69-70页
第五章 结论第70-71页
20 本文的主要结论第70页
21 创新点第70-71页
参考文献第71-82页
致谢第82-83页
攻读博士学位期间发表的学术论文第83页

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