教育论文网

斑点叉尾鮰miRNA系统鉴定与表达特征分析

硕士博士毕业论文站内搜索    
分类:教育论文网→农业科学论文→水产、渔业论文水产基础科学论文水产生物学论文水产动物学论文
斑点叉尾鮰miRNA系统鉴定与表达特征分析
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-14页
第1章 绪论第14-38页
  1.1 我国斑点叉尾鮰产业发展概况第14-16页
    1.1.1 斑点叉尾鮰简介第14-15页
    1.1.2 斑点叉尾鮰的引进与养殖第15页
    1.1.3 我国斑点叉尾鮰繁殖群体种质退化情况第15-16页
  1.2 miRNA研究进展第16-36页
    1.2.1 miRNA的发现第16-17页
    1.2.2 miRNA的形成与加工第17-21页
      1.2.2.1 miRNA基因第17-18页
      1.2.2.2 miRNA前体的转录第18-20页
      1.2.2.3 成熟miRNA的形成过程第20-21页
    1.2.3 miRNA的作用机制与调控功能第21-25页
      1.2.3.1 miRNA的作用机制第21-22页
      1.2.3.2 miRNA的生物学功能研究策略第22-23页
      1.2.3.3 miRNA与siRNA的区别第23-25页
    1.2.4 miRNA基因鉴定方法第25-31页
      1.2.4.1 生物信息学方法预测miRNA第25-27页
      1.2.4.2 实验生物学方法鉴定miRNA第27-31页
        1.2.4.2.1 cDNA克隆测序鉴定miRNA第27-29页
        1.2.4.2.2 深度测序法鉴定miRNA第29-31页
    1.2.5 水产动物miRNA相关研究进展第31-36页
      1.2.5.1 虹鳟(Oncorhynchus mykiss)第31-32页
      1.2.5.2 牙鲆(Paralichthys olivaceus)第32-33页
      1.2.5.3 鳙(Hypophthalmichthys nobilis)与鲢(H. molitrix)第33页
      1.2.5.4 鲤(Cyprinus carpio L.)第33-34页
      1.2.5.5 罗非鱼(Tilapia)第34-35页
      1.2.5.6 中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)第35-36页
  1.3 研究设计第36-38页
第2章 斑点叉尾鮰保守性miRNA的生物信息学预测及鉴定第38-52页
  2.1 前言第38页
  2.2 材料与方法第38-43页
    2.2.1 实验仪器第38-39页
    2.2.2 斑点叉尾鮰miRNA预测所需相关序列来源第39页
      2.2.2.1 其它鱼类相关miRNA序列第39页
      2.2.2.2 斑点叉尾鮰EST和GSS序列第39页
      2.2.2.3 斑点叉尾鮰miRNA预测第39页
    2.2.3 斑点叉尾鮰潜在miRNA验证第39-42页
      2.2.3.1 实验用鱼第40页
      2.2.3.2 斑点叉尾鮰各组织中总RNA提取第40页
      2.2.3.3 斑点叉尾鮰各组织中miRNA逆转录第40-41页
      2.2.3.4 引物设计第41-42页
      2.2.3.5 实时定量PCR反应第42页
    2.2.4 斑点叉尾鮰miRNA靶基因预测第42-43页
  2.3 结果与分析第43-49页
    2.3.1 预测潜在的斑点叉尾鮰miRNA序列第43-46页
    2.3.2 颈-环结构PCR鉴定斑点叉尾鮰miRNA第46-48页
    2.3.3 斑点叉尾鮰miRNA靶基因预测第48-49页
  2.4 讨论第49-52页
第3章 斑点叉尾鮰miRNA Solexa深度测序及其序列特征分析第52-67页
  3.1 前言第52页
  3.2 材料与方法第52-55页
    3.2.1 实验用鱼第52-53页
    3.2.2 斑点叉尾鮰各组织总RNA提取第53页
    3.2.3 斑点叉尾鮰小RNA深度测序第53页
    3.2.4 序列基本分析第53-55页
      3.2.4.1 数据处理及长度分布分析第53页
      3.2.4.2 斑点叉尾鮰深度测序所获得小RNA注释第53-54页
      3.2.4.3 斑点叉尾鮰小RNA与斑马鱼基因组数据比对第54页
      3.2.4.4 保守性miRNA鉴定及其表达分析第54页
      3.2.4.5 新miRNA预测及其表达分析第54-55页
    3.2.5 斑点叉尾鮰miRNA异构体分析及miRNA~*保守性分析第55页
  3.3 结果与分析第55-64页
    3.3.1 测序长度分布情况第55-56页
    3.3.2 斑点叉尾鮰深度测序所获得小RNA注释第56页
    3.3.3 斑点叉尾鮰深度测序Clean序列在斑马鱼基因组上的定位分析第56-57页
    3.3.4 斑点叉尾鮰保守性miRNA鉴定及其表达分析第57-58页
    3.3.5 斑点叉尾鮰新miRNA鉴定及其表达分析第58-59页
    3.3.6 斑点叉尾鮰miRNA异构体分析第59-61页
    3.3.7 斑点叉尾鮰miRNA~*保守性分析第61-64页
  3.4 讨论第64-67页
第4章 新发现斑点叉尾鮰miRNA表达特征及其靶基因预测第67-75页
  4.1 前言第67页
  4.2 材料与方法第67-68页
    4.2.1 实验仪器第67-68页
    4.2.2 实验用鱼第68页
    4.2.3 斑点叉尾鮰各组织总RNA提取第68页
    4.2.4 斑点叉尾鮰表达特征分析第68页
      4.2.4.1 斑点叉尾鮰新发现miRNA在各组织中的表达特征研究第68页
      4.2.4.2 斑点叉尾鮰新发现miRNA在胚胎发育过程中的表达特征研究第68页
    4.2.5 斑点叉尾鮰新发现miRNA靶基因预测第68页
  4.3 结果与分析第68-72页
    4.3.1 斑点叉尾鮰新发现miRNA在各组织中的表达特征研究第68-70页
    4.3.2 斑点叉尾鮰新发现miRNA在胚胎发育过程中的表达特征研究第70-71页
    4.3.3 斑点叉尾鮰新发现miRNA靶基因预测第71-72页
  4.4 讨论第72-75页
第5章 感染嗜水气单胞菌后斑点叉尾鮰肝组织中miRNA的表达变化研究第75-86页
  5.1 前言第75页
  5.2 材料与方法第75-77页
    5.2.1 斑点叉尾鮰实验用鱼及分组第75页
    5.2.2 攻毒用致病微生物第75-76页
    5.2.3 实验仪器第76页
    5.2.4 实验方法第76-77页
      5.2.4.1 注射感染第76页
      5.2.4.2 斑点叉尾鮰肝组织总RNA提取第76页
      5.2.4.3 斑点叉尾鮰肝组织miRNA逆转录第76页
      5.2.4.4 斑点叉尾鮰肝组织miRNA表达变化分析第76-77页
        5.2.4.4.1 引物设计第76-77页
        5.2.4.4.2 实时定量PCR反应第77页
        5.2.4.4.3 数据分析第77页
  5.3 结果与分析第77-83页
    5.3.1 斑点叉尾鮰感染嗜水气单胞菌后症状表现第77页
    5.3.2 斑点叉尾鮰感染嗜水气单胞菌后肝组织中miRNA表达变化第77-81页
    5.3.3 感染嗜水气单胞菌后相关miRNA靶基因分析第81-83页
  5.4 讨论第83-86页
第6章 斑点叉尾鮰ipu-miR-143靶基因EB1的初步鉴定—莹光素酶报告基因法第86-97页
  6.1 前言第86-87页
  6.2 材料与方法第87-91页
    6.2.1 实验仪器第87页
    6.2.2 实验材料第87页
    6.2.3 Ipu-miR-143与EB1基因mRNA结合位点的预测与分析第87页
    6.2.4 双荧光素酶报告基因载体构建第87-90页
      6.2.4.1 斑点叉尾鮰基因组DNA提取第87-88页
      6.2.4.2 斑点叉尾鮰EB1基因mRNA 3'-UTR区的扩增第88-89页
      6.2.4.3 pMIR-EB1表达载体构建第89-90页
    6.2.5 细胞转染第90-91页
    6.2.6 荧光素酶活性检测第91页
  6.3 结果与分析第91-95页
    6.3.1 斑点叉尾鮰miR-143与EB1基因结合位点预测第91-93页
    6.3.2 斑点叉尾鮰pMIR-EB1表达载体构建第93-94页
    6.3.3 斑点叉尾鮰ipu-miR-143靶基因鉴定第94-95页
  6.4 讨论第95-97页
第7章 结论第97-99页
附录 A第99-137页
参考文献第137-148页
在读期间发表的学术论文及研究成果第148-149页
致谢第149页

本篇论文共149页,点击这进入下载页面
 
更多论文
斑点叉尾鮰miRNA系统鉴定与表达特征
G公司工艺创新管理研究
瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachell
产业技术联盟的项目管理绩效评价研
运动训练下多鳞四须鲃(Barbodes s
JY艺术服饰公司生产管理改善研究
隐孔菌抗PRRSV生理活性物质及保肝作
山东省企业科技工作者流动状况及其
氨基酸序列对全长朊蛋白体外纤维化
多部件关键设备系统维修服务合同设
microRNA在果蝇Toll信号免疫响应中
破坏性创新企业行为、消费者偏好与
牛支原体单克隆抗体、核酸适配体的
考虑顾客选择行为的服务产品要素组
牛支原体GAPDH、PDHB和FtsZ蛋白免疫
买方抗衡势力对上游技术创新影响研
基于用户角度的可修复产品预防性维
奇数和支链脂肪酸与奶牛瘤胃微生物
SLP布局方法在F公司的应用
鸡枞菌和云芝中α-半乳糖苷酶的研究
基于Interbrand模型的品牌价值评估
基于多波段多极化SAR数据的草原地表
基于知识创造的可再生能源企业技术
千年桐不同种源生长、生理、营养特
企业技术创新管理方法集成及导入模
白龙江流域泥石流沟刺槐林固土抗蚀
基于网络金融的融资模式与企业创新
多重转录组比较研究胡杨和灰杨耐盐
基于技术吸收能力的出口对我国企业
基于激光雷达数据与多角度遥感模型
企业技术创新持续性的影响因素研究
地质背景条件对光雾山彩叶景观制约
精益生产管理在A集团叶片生产管理中
常绿阔叶林中常绿与落叶树种的多样
供应链中企业地位与自主创新能力关
基于图像和光谱技术的果实识别与病
精益生产在上海凯士比泵有限公司的
转录因子RhERF092的分离及其在月季
我国中小企业知识产权经营管理思考
西洋杜鹃良种选育与园林应用研究
中国企业品牌国际化模式研究——基
响应乙烯的HD-Zip家族成员RhHB2在月
制造企业研发项目管理过程及工具研
菊花干旱响应转录组分析及CmDBBs亚
基于精益生产的嘉茂公司产品交付周
亚侧耳对木质纤维素的降解分析及部
甘肃烟草公司客户经理卷烟品牌培育
茶树杂交F1代儿茶素类、
天水星火机床有限责任公司品牌塑造
丹参基因工程体系创新优化及次生代
伟新公司过程方法改进研究
竹黄的分离鉴定与竹红菌素光动力诱
区域性专业化批零商场品牌延伸影响
水分与光照对活血丹生长及其药材品
考虑安全风险的空间受限项目优化调
东亚跨海间断分布物种—细茎石斛的
创意群体与企业商务交流支持平台机
珍稀铁皮石斛的谱系地理学及保护遗
基于专利分析的产品技术成熟度预测
杭菊品质比较及其影响因子研究
机械制造业质量管理实践要素与绩效
内生菌促进药用植物茅苍术挥发油积
棉花(Gossypium hirsutum)JAZ11-
微孔草γ-亚麻酸在逆境中的生物学功
以纯服装公司销售渠道管理研究
苜蓿含硫氨基酸、木质素代谢调节和
雪花啤酒常州公司营销渠道研究
箭筈豌豆遗传多样性及裂荚生物学特
许氏科技公司供应链管理改进研究
河套地区玉米产区生态环境地球化学
YT公司微信营销策略研究
干旱胁迫下玉米杂交种光合碳代谢日
豪华酒店顾客期望、顾客满意与顾客
普通小麦(Triticum aestivum L.)
重复性国际交易下缔约能力的演化—
旱稻抗旱基因DBL9、OsERF62和OsMYB
基于SNS的服装行业电子商务营销平台
NK公司中国市场营销策略优化研究
水稻植株形态突变体(pad)的基因克
基于4V营销组合理论的X市邮政报刊亭
化感水稻抑草作用中的miRNAs表达模
X公司婚礼用品创业营销研究
红莲型CMS水稻RF5恢复复合体及成员
移动省公司混合库存管理应用研究及
A公司财富管理服务市场营销策略研究
丛枝菌根真菌对稻田系统碳氮元素平
厨具品牌LE CREUSET在中国的市场营
水稻光氧化突变体812HS光合特性及其
国际航运企业EAS公司供应商管理研究
基于拉曼光谱的水果农药残留无损检
中兴通讯创新产品的营销策略研究—
A公司集中采购需求下供应链协同机制
诺华公司佳维乐组合营销策略研究
通过自溶相关基因的敲除提高枯草芽
解密顾客忠诚:个体忠诚如何转化为
小麦田牛繁缕(Myosoton aquaticum
电子商务环境下服务补救质量对关系
番茄青枯病植物疫苗菌株FJAT-1458的
基于行业竞争结构分析的STA公司客户
哈兹木霉及其微生物有机肥对黄瓜土
基于第三方物流运作的VMI应用研究
花生遗传图谱的构建以及番茄斑萎病
品牌微博的成功运作、品牌知识分享
水稻抗病和抗病相关基因启动子表达
家饰用品企业库存管理研究
广宇集团股份有限公司客户关系管理
小麦抗赤霉菌侵染QTL Qfhi.nau-4B近
迅达电梯在沙特市场的营销策略研究
小麦抗白粉病基因Ml3D232的图位克隆
C公司第三方检测业务营销策略改进研
菊花病毒和类病毒病原鉴定及其分子
考虑风险传导情形的供应链风险识别
寄生疫霉菌小RNA多样性及其参与基因
氮肥处理和害虫为害诱导的茄科植物
基于精益生产的产业集群生产协同管
绿色储粮机械通风过程的模型预测控
供应中断下考虑风险态度的四级设施
杂交种与亲本之间基因差异表达模式
考虑提前支付的供应链成员内部融资
气温与CO2浓度升高对作
基于延迟策略的MC汽车企业客户订单
横置差速轴流脱分选系统工作机理及
需求不确定下低碳供应链选址—配送
基于约束的企业订单选择及其排序研
一种带有覆草板的铧式犁对土壤—秸
顾客参与对产品差异性和顾客感知价
基于遥感技术的渍害识别方法及其时
考虑外包和公平偏好的物流服务供应
基于多源数据的黄土高原(重点流失
基于供应链金融的商业银行信用风险
 
斑点叉尾鮰论文 microRNA论文 Solexa测序论文 表达特征论文 靶基因论文
版权申明:目录由用户ptl**提供,www.51papers.com仅收录目录,作者需要删除这篇论文目录请点击这里
| 设为首页||加入收藏||站内搜索引擎||站点地图||在线购卡|
版权所有 教育论文网 Copyright(C) All Rights Reserved