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棉花COL家族基因的鉴定、表达与进化分析

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棉花COL家族基因的鉴定、表达与进化分析
论文目录
 
摘要第1-10页
ABSTRACT第10-14页
本文所用主要缩略词第14-15页
第一部分 文献综述第15-39页
第一章 棉属的分类、起源及系统进化第15-25页
1 棉属的分类第16-21页
  1.1 根据染色体组进行棉种分类第18-19页
  1.2 根据地理分布进行棉种分类第19-21页
    1.2.1 二倍体棉种的分布第19-20页
    1.2.2 异源四倍体棉种的分布第20-21页
2 异源四倍体棉种的起源第21-23页
  2.1 异源多倍体形成时间第21-22页
  2.2 异源多倍体供体种第22-23页
3 多倍体的后果第23-25页
第二章 控制植物开花的研究进展第25-37页
1 调控高等植物开花的途径第25-28页
  1.1 春化途径第25-26页
  1.2 赤霉素途径第26页
  1.3 自主开花途径第26-27页
  1.4 光周期信号途径第27-28页
2 光周期信号途径中的开花机理研究第28-33页
3 COL家族基因研究进展第33-37页
  3.1 COL家族基因的结构特点及分类第33-34页
  3.2 COL家族基因的功能研究第34-37页
本研究的目的和意义第37-39页
第二部分 研究报告第39-95页
第三章 棉花CONSTANS Like转录因子家族全基因组鉴定第39-67页
1 材料与方法第41-47页
  1.1 植物材料第41页
  1.2 昼夜节律表达材料的光照处理及取样第41页
  1.3 棉花RNA提取第41-42页
  1.4 cDNA第一链合成第42页
  1.5 棉花数据库中COL家族基因的生物信息学分析第42-44页
    1.5.1 棉花COL家族基因的全基因组搜索第42-43页
    1.5.2 棉花COL家族基因序列分析、系统进化树的构建及保守基序的识别第43页
    1.5.3 棉花COL家族基因的染色体定位及共线性分析第43-44页
    1.5.4 棉花COL家族基因的结构分析第44页
  1.6 RT-PCR分析第44-46页
  1.7 棉花COL家族基因的荧光定量PCR分析第46-47页
2 结果与分析第47-61页
  2.1 棉花COL家族基因的查找及候选基因的获得第47-49页
  2.2 棉花COL家族基因的系统进化分析及保守基序的识别第49-52页
  2.3 棉花COL家族基因的结构分析第52-53页
  2.4 棉花COL家族基因的染色体定位第53-57页
  2.5 陆地棉中COL家族基因的组织特异性表达第57-60页
  2.6 陆地棉及海岛棉中COL家族基因的昼夜节律表达第60-61页
3 讨论第61-67页
  3.1 不同物种中COL转录因子在调控开花期中功能保守第61-63页
  3.2 棉花COL家族基因的进化第63-64页
  3.3 棉花COL家族基因的组织表达及叶片中昼夜节律表达模式分化第64-67页
第四章 野生棉及栽培棉中COL Ⅰ类家族基因的系统进化分析第67-95页
1 材料与方法第68-75页
  1.1 植物材料第68-69页
  1.2 棉花8个COL家族基因引物的设计第69-71页
  1.3 DNA提取第71-72页
  1.4 棉花8个COL家族基因的克隆第72-74页
    1.4.1 PCR扩增及检测第72-73页
    1.4.2 DNA片段的回收及克隆载体的连接第73页
    1.4.3 DNA回收片段的转化及测序第73-74页
  1.5 序列分析第74-75页
2 结果与分析第75-88页
  2.1 供试棉种中8个COL家族基因的克隆第75-76页
  2.2 8个COL家族基因的结构分析第76-79页
  2.3 异源四倍体中8个COL家族基因在A-及D-亚组之间表现独立进化第79-84页
  2.4 异源四倍体中8个COL家族基因其A-亚组和D亚组进化速率不同第84-85页
  2.5 8个COL基因核酸多样性分析揭示不同棉种间及不同结构域的进化速率第85-88页
  2.6 8个COL家族基因的中性检验揭示3个COL基因受到选择作用第88页
3 讨论第88-95页
  3.1 Ⅰ类中8个COL基因揭示异源四倍体棉种中两个亚组是独立进化的第88-89页
  3.2 Ⅰ类的8个COL家族基因及不同结构域受驯化或选择的信号第89-91页
  3.3 Ⅰ类中8个COL家族基因不同结构域的进化速率分析第91-95页
全文结论第95-97页
本研究的主要创新点第97-99页
参考文献第99-115页
附录第115-125页
致谢第125-127页
攻读学位期间发表及待发表学术论文第127页

本篇论文共127页,点击这进入下载页面
 
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