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中国荷斯坦公牛KATNAL1和GSK3α/β基因的遗传变异及其与精液品质的相关性分析

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中国荷斯坦公牛KATNAL1和GSK3α/β基因的遗传变异及其与精液品质的相关性分析
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摘要第11-15页
ABSTRACT第15-21页
缩写符号(ABBREVIATION)第21-23页
第一部分 文献综述第23-67页
第一章 公牛精液品质性状选育研究进展第23-31页
1 公牛精液品质的主要指标第23页
2 影响公牛精液品质性状的主要因素第23页
3 我国公牛繁殖产业现状第23-24页
  3.1 种公牛优质冻精的产能低第23-24页
  3.2 种公牛冻精在奶业发展上的作用有待提高第24页
  3.3 种公牛“自主培育”能力差第24页
4 公牛精液品质性状分子选育研究策略第24-27页
  4.1 公牛精液品质性状基因的克隆与功能验证第24-26页
  4.2 测序和芯片技术的应用第26-27页
参考文献第27-31页
第二章 公牛精液品质性状选育的分子基础第31-59页
1 单核苷酸多态性第31-35页
  1.1 SNP概念及分类第31页
  1.2 SNPs特点第31页
  1.3 SNPs检测方法第31-32页
  1.4 SNP应用第32页
  1.5 SNP与生精障碍第32-35页
2 可变剪切第35-42页
  2.1 可变剪切的定义第35页
  2.2 可变剪切的分类第35页
  2.3 可变剪切的作用第35-37页
  2.4 可变剪切的调控第37-38页
  2.5 睾丸中发生的可变剪切事件第38-42页
  2.6 可变剪切与SNP第42页
3 启动子第42-44页
  3.1 概念第42页
  3.2 真核启动子类型第42-43页
  3.3 启动子研究方法第43页
  3.4 牛基因启动子与SNP第43-44页
4 MIRNA第44-48页
  4.1 miRNA定义及特征第44页
  4.2 miRNA的生物合成第44-45页
  4.3 miRNA靶基因的预测第45-46页
  4.4 miRNA的功能第46页
  4.5 miRNA与睾丸第46-47页
  4.6 miRNA相关单核苷酸多态性第47-48页
参考文献第48-59页
第三章 KATNAL1和GSK3α/β基因研究进展第59-67页
1 类剑蛋白P60亚基A1第59-60页
2 糖原合成酶激酶3(GSK3)的研究进展第60-62页
  2.1 GSK3发现与分类第60页
  2.2 GSK3亚细胞定位第60-61页
  2.3 GSK3作用底物第61页
  2.4 参与的信号通路第61页
  2.5 GSK3与抑制剂第61页
  2.6 GSK3与精子第61-62页
3 研究目的及意义第62-63页
  3.1 研究问题和假设的提出第62页
  3.2 研究目的和意义第62-63页
参考文献第63-67页
第二部分 试验研究第67-177页
第四章 中国荷斯坦公牛KATNAL1基因可变剪切体鉴定与表达分析第67-87页
1 材料与方法第67-72页
  1.1 材料第67-68页
  1.2 试验方法第68-71页
  1.3 数据统计第71-72页
2 试验结果第72-82页
  2.1 RNA检测结果第72-73页
  2.2 可变剪切体的鉴定第73页
  2.3 两种剪切体基因结构的比对第73-75页
  2.4 牛KATNAL1基因及不同转录本相对定量第75-76页
  2.5 生物信息学分析第76-82页
3 讨论第82-84页
4 小结第84页
参考文献第84-87页
第五章 中国荷斯坦公牛KATNAL1基因启动子活性分析与功能SNPS鉴定第87-109页
1 材料与方法第87-97页
  1.1 材料第87-88页
  1.2 试验方法第88-96页
  1.3 数据统计第96-97页
2 结果第97-104页
  2.1 牛KATNAL1基因启动子生物信息学分析第97页
  2.2 牛KATNAL1基因第二启动子和保留的内含子附近区域SNP鉴定第97-98页
  2.3 两个SNPs功能性预测第98页
  2.4 两个SNPs基因分型(Bi-PASA和RFLP)第98-99页
  2.5 牛KATNAL1基因遗传参数统计分析第99-100页
  2.6 三个种公牛站精液品质数据统计第100页
  2.7 牛KATNAL1基因不同基因型与公牛精液性状的相关性分析第100-101页
  2.8 牛KATNAL1基因不同单倍型组合与公牛精液品质性状的相关性分析第101-102页
  2.9 细胞转染与荧光检测的结果第102-103页
  2.10 牛KATNAL1基因缺失启动子活性分析第103-104页
3 讨论第104-105页
4 小结第105-106页
参考文献第106-109页
第六章 牛KATNAL1基因3’UTR靶位点SNP对BTA-MIR-22-5P调控靶基因表达的影响第109-121页
1 材料与方法第109-113页
  1.1 材料第109页
  1.2 方法第109-113页
  1.3 统计分析第113页
2 结果第113-118页
  2.1 SNP的发现及生物信息学分析第113-114页
  2.2 突变位点生物信息学分析第114-115页
  2.3 睾丸miRNA芯片关于bta-miR-3600/22-5p簇表达量分析第115页
  2.4 双荧光素酶活性分析第115-116页
  2.5 不同基因型KATNAL1 mRNA表达量分析第116-117页
  2.6 SNP分型第117页
  2.7 牛KATNAL1基因不同基因型与公牛精液性状的相关性分析第117-118页
3 讨论第118-119页
4 小结第119页
参考文献第119-121页
第七章 中国荷斯坦公牛GSK3β基因可变剪切体鉴定与基因表达分析第121-135页
1 材料与方法第121-124页
  1.1 材料第121-122页
  1.2 方法第122-124页
  1.3 数据统计第124页
2 试验结果第124-131页
  2.1 可变剪切体的鉴定第124-125页
  2.2 牛GSK3β基因及不同转录本的组织表达分析第125-126页
  2.3 生物信息学分析第126-131页
3 讨论第131-133页
4 小结第133页
参考文献第133-135页
第八章 PRE-MIR-320B序列中SNP G12A通过靶向调控GSK3β与中国荷斯坦公牛的鲜精密度存在关联第135-155页
1 材料与方法第135-141页
  1.1 材料第135-136页
  1.2 方法第136-141页
  1.3 统计分析第141页
2 结果第141-149页
  2.1 SNP鉴定与分型第141-142页
  2.2 不同基因型与公牛精液性状的相关性分析第142页
  2.3 bta-miR-320b及其靶基因生物信息学预测第142-143页
  2.4 双荧光素酶活性检测第143-145页
  2.5 颈环法定量miRNA第145-148页
  2.6 两种基因型成年公牛和小公牛的GSK3βmRNA表达比较第148-149页
3 讨论第149-151页
4 小结第151页
参考文献第151-155页
第九章 GSK3α基因核心启动子的克隆和功能性SNPS的鉴定第155-177页
1 材料与方法第155-162页
  1.1 材料第155-156页
  1.2 方法第156-162页
  1.3 统计分析第162页
2 结果第162-171页
  2.1 牛基因cDNA序列、编码氨基酸和蛋白结构域分析第162-163页
  2.2 牛GSK3α基因缺失启动子活性分析第163-165页
  2.3 牛GSK3α基因启动子区域CpG岛预测第165页
  2.4 高、低精子活力牛GSK3α基因核心启动子区甲基化差异分析第165-167页
  2.5 牛GSK3α基因SNP鉴定与分型第167-168页
  2.6 关联性分析第168-171页
3 讨论第171-173页
4 小结第173-174页
参考文献第174-177页
全文结论第177-179页
创新点及下一步研究工作第179-181页
附录第181-185页
致谢第185-187页
攻读博士期间发表论文第187页

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