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棉花棕色纤维基因Lc1的图位克隆及原花色素合成和纤维棕色呈色的调控

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棉花棕色纤维基因Lc1的图位克隆及原花色素合成和纤维棕色呈色的调控
论文目录
 
摘要第11-16页
Abstract第16-21页
第一章 文献综述第21-31页
  1.1 天然彩色棉的现状第21-22页
    1.1.1 彩色棉的产业重要地位和意义第21页
    1.1.2 彩色棉产业的发展和制约因素第21-22页
  1.2 棕色棉的遗传定位及色素成分鉴定第22-24页
    1.2.1 棕色棉的遗传控制第22页
    1.2.2 棕色棉纤维基因Lc_1遗传定位第22-23页
    1.2.3 棕色棉纤维颜色与品质关系及纤维色素鉴定第23-24页
  1.3 原花色素的合成与调控第24-28页
    1.3.1 原花色素的单体与合成第24-26页
    1.3.2 原花色素的调控第26-28页
  1.4 bHLH的功能和分类研究进展第28-31页
    1.4.1 bHLH的相关功能研究第28-29页
    1.4.2 bHLH的分类与鉴定第29-31页
第二章 引言第31-35页
  2.1 研究意义及立题依据第31-33页
  2.2 技术路线第33-35页
第三章 棉花TT2同源基因的克隆、转基因功能验证和表达分析第35-51页
  3.1 材料第35-37页
    3.1.1 植物材料第35页
    3.1.2 菌株和载体第35页
    3.1.3 主要药品试剂第35-36页
    3.1.4 主要仪器设备第36页
    3.1.5 主要试剂和缓冲液配方第36页
    3.1.6 主要培养基配方第36-37页
  3.2 方法第37-41页
    3.2.1 DNA提取第37页
    3.2.2 RNA提取、c DNA合成第37页
    3.2.3 棉花TT2同源序列的鉴定、扩增及进化分析第37-38页
    3.2.4 DNA片段的酶切、回收、连接、测序第38页
    3.2.5 定量qRT-PCR分析第38-39页
    3.2.6 载体构建第39-40页
    3.2.7 棉花的遗传转化第40-41页
  3.3 结果分析第41-49页
    3.3.1 棉花TT2同源基因的克隆第41-44页
    3.3.2 陆地棉GhTT2同源基因的功能验证第44-45页
    3.3.3 陆地棉GhTT2同源基因的表达分析第45-48页
    3.3.4 GhTT2同源基因在RIL群体的白色纤维和棕色纤维中的表达第48-49页
  3.5 小结第49-51页
第四章 棕色纤维基因Lc_1的精细定位第51-63页
  4.1 材料第51-52页
    4.1.1 植物材料第51页
    4.1.2 主要药品试剂第51页
    4.1.3 主要仪器设备第51页
    4.1.4 主要缓冲液配方第51-52页
  4.2 方法第52-55页
    4.2.1 Lc_1遗传群体构建与表型统计第52页
    4.2.2 GhTT2-3A连锁的SSR和SNP标记引物的获得第52-53页
    4.2.3 SSR和SNP标记引物的反应体系与PCR扩增第53页
    4.2.4 SSR引物的PCR产物的电泳及显色第53-54页
    4.2.5 遗传连锁图谱构建第54-55页
  4.3 结果分析第55-61页
    4.3.1 GhTT2-3A-BAC的筛选、测序、分析第55-56页
    4.3.2 GhTT2-3A和Lc_1连锁标记的筛选第56-58页
    4.3.3 Lc_1和GhTT2-3A在RIL和F2代群体中遗传图谱的构建第58-61页
  4.4 小结第61-63页
第五章 GhTT2-3A的功能分析第63-87页
  5.1 材料第63-65页
    5.1.1 植物材料第63页
    5.1.2 载体和菌株第63-64页
    5.1.3 主要药品和试剂第64页
    5.1.4 主要仪器设备第64页
    5.1.5 主要试剂、缓冲液及培养基配方第64-65页
  5.2 方法第65-67页
    5.2.1 GhTT2-3A纤维特异表达载体的构建第65页
    5.2.2 棉花的遗传转化第65页
    5.2.3 转基因棉花的鉴定第65-66页
    5.2.4 Southern blot分析第66-67页
    5.2.5 Fb LA2::GhTT2-3A转基因材料的数字表达谱分析第67页
  5.3 结果与分析第67-85页
    5.3.1 纤维中特异启动GhTT2-3A的转基因材料的获得与筛选第67-69页
    5.3.2 35S::GhTT2-3A和E6::GhTT2-3A转基因材料的分析第69-70页
    5.3.3 Fb L2A::GhTT-3A转基因棉花的分子鉴定及表型分析第70-73页
    5.3.4 GhTT2-3A在纤维发育中的表达与成熟纤维呈色的关系第73-75页
    5.3.5 Fb L2A::GhTT2-3A转基因棉花 22DPA纤维的基因数字表达谱比较分析第75-81页
    5.3.6 Fb L2A:: GhTT2-3A转基因棉花的衣分统计第81页
    5.3.7 Fb L2A::GhTT2-3A转基因棉花纤维品质分析第81-85页
  5.4 小结第85-87页
第六章 棉花TT8同源基因的鉴定、克隆及在PA合成中的调控作用第87-103页
  6.1 材料第87-88页
    6.1.1 植物材料第87页
    6.1.2 载体和菌株第87页
    6.1.3 主要药品试剂第87页
    6.1.4 主要仪器设备第87页
    6.1.5 主要缓冲液配方第87-88页
  6.2 方法第88-92页
    6.2.1 棉花bHLH的序列来源第88页
    6.2.2 bHLH蛋白和相关的bHLH结构域的鉴定第88-89页
    6.2.3 棉花bHLHs的进化分析和分类第89页
    6.2.4 棉花S5a和S5b亚家族bHLH基因的克隆和序列分析第89-90页
    6.2.5 烟草瞬时表达第90-92页
  6.3 结果与分析第92-100页
    6.3.1 棉花基因组中bHLH基因的鉴定第92-94页
    6.3.2 棉花bHLH家族的进化分析和分类第94页
    6.3.3 四倍体棉花中S5a和S5b亚家族的bHLH的克隆和序列分析第94-99页
    6.3.4 GhTT-3A和GhbHLH110A协同激活PA合成途径第99-100页
  6.4 小结第100-103页
第七章 讨论第103-113页
  7.1 陆地棉中有5对R2R3-MYB家族的GhTT2同源蛋白第103-104页
  7.2 GhTT2同源基因的表达模式在棉花各组织中不同第104-105页
  7.3 GhTT2-3A是棕色纤维基因Lc_1的候选基因第105-106页
  7.4 GhTT2-3A促进PA在纤维中合成和积累第106-107页
  7.5 GhTT2-3A和bHLH在棉花PA合成途径中的调控作用第107-109页
  7.6 PA影响转基因纤维产量和品质第109页
  7.7 bHLH的鉴定分类和进化分析第109-113页
第八章 主要结论和创新点及后续工作展望第113-115页
  8.1 主要结论第113页
  8.2 创新点第113页
  8.3 后续工作展望第113-115页
参考文献第115-123页
附录第123-159页
附录一 缩略词第123-124页
附录二 GhTT2-1D~5D的载体构建流程第124-125页
附录三 棉花PA合成途径RT-RCR引物第125页
附录四 来自其它植物中用于进化分析的bHLH蛋白第125-134页
附录五 搜索bHLH蛋白网址第134页
附录六 bHLH探针序列第134-136页
附录七 棉花bHLH的相关编码序列在不同来源中的对应序列第136-148页
附录八 拟南芥、可可和棉花的bHLH的进化分类、保守区域和已知生物学功能注释第148-157页
附录九 参研课题第157页
附录十 博士期间发表论文第157-159页
致谢第159-160页

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