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水稻特有光周期调控开花基因Ehd4的图位克隆与功能分析
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水稻特有光周期调控开花基因Ehd4的图位克隆与功能分析
论文目录
 
摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略语第12-13页
第一章 文献综述第13-43页
1 水稻的感光性、感温性和基本营养生长性第13-14页
　　1.1 感光性第13-14页
　　1.2 感温性第14页
　　1.3 基本营养生长性第14页
2 水稻抽穗期的遗传研究第14-15页
　　2.1 水稻抽穗期的遗传调控第14-15页
　　2.2 杂交稻抽穗期的遗传表现第15页
3 水稻抽穗期基因的发掘第15-18页
　　3.1 水稻光周期不敏感型抽穗基因的定位第16-17页
　　3.2 水稻光周期敏感型抽穗基因的定位第17-18页
4 水稻抽穗期基因的克隆和功能分析第18-36页
　　4.1 光受体类基因的克隆第18-19页
　　　　4.1.1 SE5的克隆第18-19页
　　　　4.1.2 光敏色素类基因的克隆第19页
　　4.2 节律钟基因的克隆第19-21页
　　　　4.2.1 OsGI的克隆第19-20页
　　　　4.2.2 Hd17/Ef7/OsELF3的克隆第20-21页
　　4.3 Hd6的克隆第21页
　　4.4 水稻CO类基因的克隆第21-25页
　　　　4.4.1 Hd1的克隆第22-23页
　　　　4.4.2 OsCO3的克隆第23页
　　　　4.4.3 Ghd7的克隆第23-25页
　　　　4.4.4 OsCOL4的克隆第25页
　　4.5 MADS box类基因的克隆第25-27页
　　4.6 水稻‘成花素’基因Hd3a和RFT1的克隆第27-29页
　　4.7 HD3A互作蛋白的克隆第29-31页
　　4.8 Ehd1的克隆第31-32页
　　4.9 Ehd2/RID1/OsID1的克隆第32-33页
　　4.10 Ehd3的克隆第33-34页
　　4.11 DTH8/Ghd8的克隆第34-35页
　　4.12 PPS的克隆第35页
　　4.13 LVP1的克隆第35-36页
5 水稻抽穗期的光周期调控网络第36-38页
　　5.1 短日照促进途径第37页
　　5.2 长日照促进途径第37-38页
　　5.3 长日照抑制途径第38页
6 存在的问题与展望第38-41页
　　6.1 新基因的发掘第38-39页
　　　　6.1.1 微效基因的发掘第38页
　　　　6.1.2 通过反向遗传学方法克隆新的水稻抽穗期基因第38-39页
　　　　6.1.3 温敏相关抽穗期基因的发掘第39页
　　6.2 水稻抽穗期分子信号调控网络的深入研究第39-40页
　　6.3 杂交稻生育期超亲晚熟问题第40页
　　6.4 抽穗期基因的在育种中的运用第40-41页
　　6.5 水稻抽穗期调控基因的地理分布与演化第41页
7 本研究的目的与意义第41-43页
第二章 水稻抽穗期基因Ehd4的图位克隆第43-53页
1 材料与方法第44-47页
　　1.1 试验材料第44页
　　1.2 田间实验第44页
　　1.3 性状考查第44-45页
　　1.4 DNA样品备制第45页
　　1.5 InDel与dCAPS标记的开发第45-46页
　　1.6 标记分析第46页
　　1.7 连锁图谱构建与精细定位第46-47页
　　1.8 候选基因的预测与分析第47页
2 结果与分析第47-52页
　　2.1 亲本材料的选择与初步分析第47-48页
　　2.2 ehd4突变体的表型鉴定与遗传分析第48-49页
　　2.3 ehd4的遗传分析第49-50页
　　2.4 抽穗期基因EHD4的精细定位第50-51页
　　2.5 目标区域候选基因预测与序列分析第51页
　　2.6 转基因互补实验第51-52页
3 小结第52-53页
第三章 水稻抽穗期基因EHD4的初步功能分析第53-79页
1 材料与方法第53-58页
　　1.1 供试材料第53页
　　1.2 试剂、质粒与菌株第53页
　　1.3 大肠杆菌、农杆菌与酵母感受态细胞的制备及转化第53-54页
　　1.4 Ehd4基因结构分析第54页
　　1.5 基因植物转化载体的构建第54页
　　1.6 基因的遗传转化第54-55页
　　1.7 转基因植株的PCR鉴定第55页
　　1.8 总RNA的提取与qRT-PCR第55页
　　1.9 组织GUS染色及细胞学观察第55-56页
　　1.10 亚细胞定位第56页
　　1.11 EHD4的酵母转录自激活实验第56页
　　1.12 EHD4的原核表达及核酸体外结合实验第56页
　　1.13 ehd4突变体的RNA重测序第56页
　　1.14 酵母单、三杂交载体构建与互作验证第56-57页
　　1.15 瞬时转录激活实验第57-58页
2 结果与分析第58-77页
　　2.1 Ehd4的组织表达第58页
　　2.2 Ehd4的节律及生长周期表达第58页
　　2.3 EHD4蛋白的亚细胞定位第58-59页
　　2.4 EHD4蛋白全长及不同截断的转录活性测定第59页
　　2.5 EHD4蛋白核酸体外结合实验第59-60页
　　2.6 Ehd4与水稻光周期开花途径第60-64页
　　2.7 酵母单、双、三杂交实验第64-66页
　　2.8 ehd4突变体的转录谱分析第66-73页
　　2.9 Ehd4在不同水稻品种间的差异第73-77页
3 小结第77-79页
第四章 全文总结第79-85页
1 全文结论与讨论第79-82页
　　1.1 Ehd4是促进水稻抽穗的关键基因第79-80页
　　1.2 Ehd4的精细定位与克隆第80页
　　1.3 Ehd4在水稻呈现组成型和节律表达第80页
　　1.4 EHD4可能发挥着转录调节因子的功能第80-81页
　　1.5 Ehd4通过Ehd1来调节‘成花素’基因的表达第81-82页
　　1.6 ehd4突变体基因组水平的转录谱分析第82页
　　1.7 Ehd4是一个稻属特有的并高度保守的基因第82页
2 本研究的创新点第82-83页
　　2.1 研究材料的选择第82-83页
　　2.2 夯实的遗传分析第83页
　　2.3 Ehd4的独特性第83页
　　2.4 Ehd4在育种中利用的潜在前景第83页
3 水稻抽穗期研究展望第83-85页
参考文献第85-93页
附录第93-105页
1 附表第93-100页
2 常用试剂配制第100-105页
在读期间发表的论文第105-107页
致谢第107页

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