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我国主要石首鱼科鱼类分子系统发育及大黄鱼群体遗传结构的DNA标记研究
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我国主要石首鱼科鱼类分子系统发育及大黄鱼群体遗传结构的DNA标记研究
论文目录
 
摘要第11-15页
ABSTRACT第15-19页
第1章 绪论第19-45页
　　1.1 海洋鱼类的种质资源、遗传育种及种群遗传学的DNA标记分析第19-32页
　　　　1.1.1 海洋鱼类的种质资源第19-20页
　　　　1.1.2 鱼类育种进展第20-29页
　　　　1.1.3 线粒体基因标记(mtDNA)第29-30页
　　　　1.1.4 内含子多态性(EPIC)第30页
　　　　1.1.5 微卫星(SSR)标记第30-31页
　　　　1.1.6 单核苷酸多态性(SNP)第31-32页
　　1.2 石首鱼的种质资源及系统学研究进展第32-36页
　　　　1.2.1 石首鱼科一般形态特征第32-33页
　　　　1.2.2 石首鱼科物种分布情况与生活习性第33-34页
　　　　1.2.3 石首鱼分子系统学研究概况第34-36页
　　1.3 大黄鱼种群划分及群体遗传学研究进展第36-43页
　　　　1.3.1 大黄鱼的形态特征第36-38页
　　　　1.3.2 大黄鱼的地理种群划分第38-42页
　　　　1.3.3 群体遗传多样性分析第42-43页
　　1.4 本研究的目的和意义第43-45页
第2章 基于EPIC核基因DNA序列变异分析石首鱼的系统发育关系第45-60页
　　2.1 材料第45-47页
　　　　2.1.1 实验材料第45-46页
　　　　2.1.2 主要仪器第46-47页
　　　　2.1.3 主要试剂第47页
　　2.2 方法第47-51页
　　　　2.2.1 形态鉴定第47-48页
　　　　2.2.2 利用COI鉴定及检测第48-49页
　　　　2.2.3 利用核基因DNA序列检测第49-51页
　　2.3 结果第51-56页
　　　　2.3.1 DNA提取第51-52页
　　　　2.3.2 序列变异特点第52-53页
　　　　2.3.3 碱基组成及遗传距离第53-54页
　　　　2.3.4 系统发育树第54-56页
　　2.4 讨论第56-60页
第3章 大黄鱼微卫星标记在亲缘物种中的通用性研究第60-73页
　　3.1 材料第60-63页
　　　　3.1.1 实验材料第60-61页
　　　　3.1.2 主要仪器第61页
　　　　3.1.3 主要试剂第61-62页
　　　　3.1.4 溶液配制第62-63页
　　3.2 方法第63-68页
　　　　3.2.1 DNA模板的制备第63-64页
　　　　3.2.2 SSR扩增第64页
　　　　3.2.3 引物筛选第64-66页
　　　　3.2.4 SSR扩增产物检测第66-67页
　　　　3.2.5 数据分析第67-68页
　　3.3 结果第68-72页
　　　　3.3.1 DNA提取第68页
　　　　3.3.2 黄姑鱼多态微卫星标记的筛选第68-69页
　　　　3.3.3 日本银姑鱼多态微卫星标记的筛选第69-70页
　　　　3.3.4 皮氏叫姑鱼多态微卫星标记的筛选第70-72页
　　3.4 讨论第72-73页
第4章 应用核基因DNA序列和线粒体基因标记对大黄地理种群进行划分第73-86页
　　4.1 材料第74-75页
　　　　4.1.1 实验材料第74-75页
　　　　4.1.2 主要仪器第75页
　　　　4.1.3 主要试剂第75页
　　4.2 方法第75-78页
　　　　4.2.1 DNA模板的制备第75页
　　　　4.2.2 PCR扩增和测序第75-78页
　　　　4.2.3 数据分析第78页
　　4.3 结果第78-82页
　　　　4.3.1 序列遗传变异第78-80页
　　　　4.3.2 群体遗传结构第80-81页
　　　　4.3.3 遗传距离第81-82页
　　4.4 讨论第82-86页
第5章 大黄鱼基因组SNP标记的开发与检测第86-112页
　　5.1 材料第86-88页
　　　　5.1.1 实验材料第86-87页
　　　　5.1.2 主要仪器第87-88页
　　　　5.1.3 主要试剂第88页
　　5.2 方法第88-94页
　　　　5.2.1 DNA模板的制备第88-89页
　　　　5.2.2 Sequenom实验操作步骤第89-94页
　　　　5.2.3 数据分析第94页
　　5.3 结果第94-107页
　　　　5.3.1 SNP候选位点的获得第94-97页
　　　　5.3.2 SNP位点的群体基因型分析第97-103页
　　　　5.3.3 SNP位点的群体多态性分析第103-106页
　　　　5.3.4 系统发育树第106-107页
　　5.4 讨论第107-112页
　　　　5.4.1 SNP分型的研究第107-108页
　　　　5.4.2 SNP位点主要遗传学参数估计第108-110页
　　　　5.4.3 大黄鱼SNP基因分型的群体遗传学分析第110-112页
总结与展望第112-114页
参考文献第114-124页
在学期间主持、参与的科研项目及研究论文第124-125页
致谢第125页

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