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上海野生鸟类禽流感流行病学调查与病毒基因的遗传进化分析

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上海野生鸟类禽流感流行病学调查与病毒基因的遗传进化分析
论文目录
 
论文摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
一、引言第11-19页
  1.1 禽流感的概述第11-12页
    1.1.1 禽流感的历史、发生与分布第11页
    1.1.2 禽流感的宿主范围第11-12页
    1.1.3 禽流感的危害第12页
  1.2 禽流感病毒的生物学特性第12-14页
    1.2.1 禽流感病毒的结构组成第12-13页
    1.2.2 血凝素(Hemmagglutinin,HA)蛋白第13页
    1.2.3 神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)蛋白第13页
    1.2.4 聚合酶(Ploymerase,PA、PB1、PB2)蛋白第13-14页
    1.2.5 核(Nucleoprotein,NP)蛋白第14页
    1.2.6 基质(Matrix Protein,M)蛋白第14页
    1.2.7 非结构(Nonstructural Protein,NS)蛋白第14页
  1.3 野生鸟类禽流感的国内外研究进展第14-16页
    1.3.1 野生鸟类禽流感流行病学研究第15页
    1.3.2 禽流感病毒遗传进化分析第15-16页
  1.4 本研究的背景与目标第16-17页
  1.5 研究内容第17-18页
  1.6 研究技术路线第18-19页
二、材料与方法第19-37页
  2.1 实验材料第19-24页
    2.1.1 实验耗材第19-20页
    2.1.2 试剂盒与试剂第20-22页
    2.1.3 实验器具与设备第22-24页
  2.2 实验的分析软件第24页
  2.3 实验方法第24-37页
    2.3.1 样本的来源与采集第24-25页
    2.3.2 禽流感病毒检测第25-29页
    2.3.3 病毒基因核酸序列的扩增第29-33页
    2.3.4 禽流感病毒血清抗体检测第33-35页
    2.3.5 序列的分析与遗传进化树的构建第35-37页
三、结果第37-64页
  3.1 上海野生鸟类禽流感感染与携带状况第37-47页
    3.1.1 禽流感样本采集第37-43页
    3.1.2 禽流感病毒M基因检测结果与病毒亚型鉴定第43-44页
    3.1.3 禽流感病毒血清抗体检测结果第44页
    3.1.4 上海地区野生鸟类禽流感感染状况与趋势分析第44-47页
  3.2 上海野生鸟类禽流感病毒基质蛋白(M)基因的遗传进化分析第47-61页
    3.2.1 基质蛋白(M)基因的进化树构建第47-53页
    3.2.2 M1蛋白与M2蛋白的氨基酸序列分析第53-60页
    3.2.3 病毒M基因选择压力的分析第60-61页
  3.3 上海野生鸟类禽流感病毒血凝素蛋白(H9)基因的遗传进化分析第61-64页
    3.3.1 血凝素蛋白(H9)基因的进化树构建第61-62页
    3.3.2 H9亚型共感染(多重感染)的相关性分析第62-64页
四、讨论第64-69页
  4.1 上海野生鸟类禽流感感染与传播趋势的分析第64-66页
    4.1.1 越冬水鸟是上海地区野生鸟类禽流感病毒携带与传播的主要媒介第64页
    4.1.2 本地区禽流感传播风险与防控对策第64-66页
    4.2. 禽流感病毒基因的遗传进化分析第66-69页
    4.2.1 基质蛋白(M)基因的遗传进化分析第66-67页
    4.2.2 鸭源H9亚型的同亚型共感染(多重感染)与类早期人类流感M基因之间的关系第67-69页
五、结论第69-71页
附录第71-82页
附录1 本研究中所使用引物汇总第71-72页
附录2 H5型流感病毒HA抗体检测试剂盒(酶联免疫法)使用说明书第72-73页
附录3 禽流感病毒M基因遗传进化树(完整)第73-78页
附录4 无样本H9进化树第78-79页
附录5 工作照第79-82页
参考文献第82-90页
在读期间发表论文第90-91页
后记第91页

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