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细菌与甲烷菌在牦牛瘤胃中的时间动态及其在消化道的空间分布

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细菌与甲烷菌在牦牛瘤胃中的时间动态及其在消化道的空间分布
论文目录
 
中文摘要第1-6页
Abstract第6-13页
第一章 绪论第13-31页
  1.1 研究背景第13-14页
    1.1.1 青藏高原的特点及面临的威胁第13页
    1.1.2 青藏高原畜牧业现状第13页
    1.1.3 反刍动物甲烷排放及减排措施第13-14页
  1.2 文献综述第14-27页
    1.2.1 肠道微生态研究进展第14-15页
    1.2.2 甲烷菌研究进展第15-19页
    1.2.3 反刍动物肠道细菌的功能第19-21页
    1.2.4 不同年龄瘤胃细菌/甲烷菌的定植过程第21-24页
    1.2.5 瘤胃细菌/甲烷菌对于季节响应模式的研究现状第24-25页
    1.2.6 不同肠道部位细菌的分布第25-27页
  1.3 本研究的意义与目的第27-28页
  1.4 研究内容第28-30页
    1.4.1 不同年龄牦牛瘤胃细菌/甲烷菌的定植过程第28页
    1.4.2 牦牛瘤胃细菌/甲烷菌的季节动态第28页
    1.4.3 相同日粮下不同肠道部位牦牛和黄牛细菌/甲烷菌的空间分布第28-30页
  1.5 技术路线第30-31页
第二章 不同年龄牦牛瘤胃细菌/甲烷菌的定植过程第31-70页
  2.1 前言第31页
  2.2 材料和方法第31-46页
    2.2.1 试验地点第31-32页
    2.2.3 试验动物及管理方式第32页
    2.2.4 基因组DNA的提取第32-34页
    2.2.5 基因组DNA的测序分析第34-36页
    2.2.6 测序结果分析第36-38页
    2.2.7 功能基因预测第38-39页
    2.2.8 实时定量PCR分析功能菌的绝对数量第39-46页
  2.3 结果第46-60页
    2.3.1 瘤胃细菌/古菌Alpha多样性第46-47页
    2.3.2 不同年龄瘤胃细菌/古菌Beta多样性分析第47-48页
    2.3.3 门水平的细菌/甲烷菌组成第48-49页
    2.3.4 属水平的细菌/甲烷菌组成第49-54页
    2.3.5 基于 16S的功能预测第54-58页
    2.3.6 代表性功能菌的实时定量分析第58页
    2.3.7 瘤胃微生物定植来源第58-60页
  2.4 讨论第60-69页
    2.4.1 不同年龄牦牛瘤胃细菌/甲烷菌的多样性第60-62页
    2.4.2 不同年龄牦牛瘤胃细菌/甲烷菌门水平的变化第62-64页
    2.4.3 不同年龄牦牛瘤胃细菌/甲烷菌属水平的变化第64-66页
    2.4.4 细菌/甲烷菌功能基因家族预测第66-67页
    2.4.5 代表性功能菌的定量分析第67-68页
    2.4.6 瘤胃微生物定植来源第68-69页
  2.5 小结第69-70页
第三章 牦牛瘤胃细菌/甲烷菌的季节动态第70-87页
  3.1 前言第70-71页
  3.2 材料和方法第71-72页
    3.2.1 试验地点第71页
    3.2.2 试验动物第71页
    3.2.3 基因组DNA的提取第71页
    3.2.4 基因组DNA的测序分析第71-72页
    3.2.5 测序结果分析第72页
    3.2.6 实时定量PCR分析功能菌的绝对数量第72页
  3.3 结果第72-82页
    3.3.1 不同季节瘤胃细菌/甲烷菌的多样性第72-74页
    3.3.2 不同季节瘤胃细菌/甲烷菌门水平的变化第74-75页
    3.3.3 不同季节瘤胃细菌/甲烷菌属水平的变化第75-79页
    3.3.4 不同季节细菌/甲烷菌功能预测第79-81页
    3.3.5 不同季节代表性功能菌的实时定量分析第81-82页
  3.4 讨论第82-86页
    3.4.1 不同季节瘤胃细菌/甲烷菌多样性第82-84页
    3.4.2 不同季节瘤胃细菌/甲烷菌门水平的变化第84页
    3.4.3 不同季节瘤胃细菌/甲烷菌属水平的变化第84-85页
    3.4.4 不同季节细菌/甲烷菌功能预测第85-86页
    3.4.5 不同季节代表性功能菌的实时定量分析第86页
  3.5 小结第86-87页
第四章 相同日粮下不同肠道部位牦牛和黄牛细菌/甲烷菌的空间分布第87-108页
  4.1 前言第87-88页
  4.2 材料和方法第88-92页
    4.2.1 试验地点第88页
    4.2.2 试验动物与管理第88-89页
    4.2.3 日粮配比第89页
    4.2.4 样品采集第89-91页
    4.2.5 基因组DNA的测序分析第91页
    4.2.6 测序结果分析第91页
    4.2.7 实时定量PCR分析功能菌的数量第91-92页
  4.3 结果第92-101页
    4.3.1 相同低氮日粮下牦牛细菌/甲烷菌多样性随着不同肠道部位的变化第92-93页
    4.3.2 相同低氮日粮下牦牛不同肠道部位细菌/甲烷菌Beta多样性分析第93页
    4.3.3 相同低氮日粮下牦牛门水平不同肠道部位细菌/甲烷菌的组成第93-94页
    4.3.4 相同低氮日粮下牦牛不同肠道部位属水平的细菌/甲烷菌变化第94-95页
    4.3.5 不同肠道部位细菌/甲烷菌功能预测第95-96页
    4.3.6 相同低氮日粮下牦牛代表性功能菌在肠道不同部位的数量变化第96-101页
  4.4 讨论第101-106页
    4.4.1 不同肠道部位细菌/甲烷菌的多样性第101-102页
    4.4.2 不同肠道部位细菌/甲烷菌门水平的变化第102-103页
    4.4.3 不同肠道部位细菌/甲烷菌属水平的变化第103-105页
    4.4.4 不同肠道部位细菌/甲烷菌功能预测第105-106页
    4.4.5 不同肠道部位功能菌的实时定量分析第106页
  4.5 小结第106-108页
第五章 结论与展望第108-111页
  5.1 结论第108-110页
  5.2 展望第110-111页
创新点第111-112页
参考文献第112-121页
个人简历及在学期间科研成果第121-123页
致谢第123-124页
附录第124-131页

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