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北京鸭胚胎期胸肌发育相关基因与miRNAs表达模式鉴定及其互作关系研究

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北京鸭胚胎期胸肌发育相关基因与miRNAs表达模式鉴定及其互作关系研究
论文目录
 
摘要第1-8页
ABSTRACT第8-13页
第一章 文献综述第13-27页
  1.1 畜禽骨骼肌结构与生成第13-15页
    1.1.1 骨骼肌的结构第13页
    1.1.2 骨骼肌的生成第13-15页
  1.2 骨骼肌生成相关基因的研究现状第15-17页
  1.3 MIRNAS的生物学合成及功能第17-24页
    1.3.1 mi RNAs的生物学合成第17-19页
    1.3.2 mi RNAs的功能第19-24页
  1.4 鸭骨骼肌相关基因及MIRNAS的研究概况第24-25页
    1.4.1 鸭骨骼肌相关基因研究概况第24-25页
    1.4.2 鸭mi RNAs的研究概况第25页
  1.5 论文选题依据、研究内容及研究意义第25-27页
    1.5.1 选题依据第25-26页
    1.5.2 研究内容第26页
    1.5.3 研究意义第26-27页
第二章 胚胎期北京鸭胸肌发育特征研究第27-35页
  2.1 材料与方法第27-29页
    2.1.1 样品采集及胸肌率计算第27-28页
    2.1.2 胸肌纤维石蜡切片制作第28页
    2.1.3 切片照相与统计第28页
    2.1.4 肌生成相关调控基因的表达谱分析第28-29页
    2.1.5 数据分析第29页
  2.2 结果第29-33页
    2.2.1 解剖分析第29-31页
    2.2.2 胚胎期北京鸭胸肌发育组织切片分析第31-32页
    2.2.3 MRF4、Myo G和MSTN的表达模式第32-33页
  2.3 讨论第33-34页
  2.4 本章小结第34-35页
第三章 胚胎期北京鸭胸肌内基因表达特征研究第35-50页
  3.1 材料与方法第36-38页
    3.1.1 样品采集第36页
    3.1.2 RNA提取和质量检测第36页
    3.1.3 RNA文库的构建、检测和测序第36页
    3.1.4 信息分析第36-38页
  3.2 结果与讨论第38-49页
    3.2.1 测序数据质量评估与过滤第38-39页
    3.2.2 单样品分析第39-44页
    3.2.3 多样品差异分析第44-49页
  3.3 本章小结第49-50页
第四章 胚胎期北京鸭胸肌内MIRNAS模式鉴定第50-70页
  4.1 材料与方法第51-55页
    4.1.1 语言、软件和数据库第51-52页
    4.1.2 样品采集、总RNA提取、c DNA文库构建和测序第52页
    4.1.3 测序结果统计与评价第52页
    4.1.4 小RNA分类分析第52-53页
    4.1.5 已知mi RNAs的鉴定和评估第53页
    4.1.6 已知mi RNAs的表达分析第53页
    4.1.7 已知mi RNAs的验证第53页
    4.1.8 新mi RNAs的预测和差异表达分析第53-54页
    4.1.9 新mi RNAs靶基因预测和功能注释第54-55页
    4.1.10 部分新mi RNAs及其靶基因的验证第55页
    4.1.11 原始数据上传第55页
  4.2 结果与分析第55-69页
    4.2.1 测序结果统计与评价第55-56页
    4.2.2 高质量序列的RNA类别划分第56-58页
    4.2.3 已知mi RNAs的鉴定与评估第58-63页
    4.2.4 已知mi RNAs的差异表达分析第63-64页
    4.2.5 已知mi RNAs的验证第64-66页
    4.2.6 新mi RNA预测与差异表达分析第66页
    4.2.7 新mi RNA靶基因预测和功能注释第66-68页
    4.2.8 Novel-mi R-8、novel-mir-14及其靶基因MAP2K1、PPARα 的验证第68-69页
  4.3 本章小结第69-70页
第五章 胚胎期北京鸭胸肌内MRNA与MIRNA的关联分析第70-76页
  5.1 数据与方法第70-71页
    5.1.1 数据第70页
    5.1.2 方法第70-71页
  5.2 结果与讨论第71-75页
    5.2.1 靶基因预测第71页
    5.2.2 差异mi RNA和差异表达基因关联分析第71-73页
    5.2.3 关联基因的GO和KEGG第73-75页
  5.3 本章小结第75-76页
第六章 部分新MIRNAS对肌原细胞分化的作用第76-93页
  6.1 材料与方法第76-82页
    6.1.1 研究对象第76页
    6.1.2 参考基因组和数据库第76页
    6.1.3 生物信息学分析第76-77页
    6.1.4 新mi RNA在成肌细胞中表达检测第77页
    6.1.5 新mi RNA在细胞分化过程中的时序表达第77-78页
    6.1.6 转染mi RNA模拟物(mimics)对成肌细胞的影响第78-81页
    6.1.7 转染mi RNA抑制物(inhibitor)对小鼠C2C12成肌细胞的影响第81-82页
  6.2 结果与讨论第82-92页
    6.2.1 新mi RNAs的生物信息分析第82-83页
    6.2.2 新mi RNAs在成肌细胞中的表达分析第83-84页
    6.2.3 novel-mi RNAs在成肌细胞分化过程中的时序表达第84-85页
    6.2.4 超表达novel-mi R-6、novel-mi R-17和novel-mi R-20对成肌分化的影响第85-89页
    6.2.5 干扰novel-mi R-6、novel-mi R-17和novel-mi R-20对成肌细胞分化的影响第89-92页
  6.3 本章小结第92-93页
第七章 全文结论第93-94页
  7.1 主要结论第93页
  7.2 创新点第93页
  7.3 有待进一步研究的问题第93-94页
参考文献第94-108页
附录第108-120页
缩略词第120-122页
致谢第122-123页
作者简介第123-124页

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