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猪不同骨骼肌长链非编码RNA的鉴定及其功能分析
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猪不同骨骼肌长链非编码RNA的鉴定及其功能分析
论文目录
 
摘要第1-10页
ABSTRACT第10-14页
第一章 文献综述第14-48页
第一节 骨骼肌第14-20页
　　1.1 骨骼肌的生长发育第14页
　　1.2 骨骼肌的分类第14-16页
　　1.3 影响骨骼肌生长发育及组成的因素第16-19页
　　1.4 骨骼肌生长发育及分类在动物生产上的意义第19-20页
第二节 lncRNA研究进展第20-38页
　　2.1 基因组的普遍转录及其复杂性第20-21页
　　2.2 lncRNA定义、分类以及基因组特征第21-23页
　　2.3 lncRNA的生物学功能及其作用机制第23-30页
　　2.4 lncRNA的研究方法第30-34页
　　2.5 lncRNA研究的发展趋势第34-38页
第三节 转录组测序(RNA-seq)第38-48页
　　3.1 转录组第38页
　　3.2 RNA-seq技术平台第38-41页
　　3.3 RNA-seq原理第41-42页
　　3.4 RNA-seq技术优势第42-43页
　　3.5 RNA-seq的应用第43-48页
第二章 本研究选题背景与目的意义第48-51页
第一节 选题背景第48页
第二节 主要研究内容第48-49页
第三节 研究的目的意义第49-51页
第三章 材料与方法第51-74页
1 实验动物第51页
2 实验仪器与主要试剂第51-52页
　　2.1 主要仪器设备第51-52页
　　2.2 主要试剂第52页
3 试验方法第52-74页
　　3.1 肌肉组织肌纤维横截面积测定第52-54页
　　3.2 肌纤维类型和肌肉代谢水平相关基因表达量分析第54-56页
　　3.3 肌肉组织线粒体拷贝数的荧光定量分析第56-58页
　　3.4 肌肉组织的RNA-seq以及生物信息学分析第58-73页
　　3.5 数据分析第73-74页
第四章 结果与分析第74-146页
1 猪不同部位骨骼肌组织学和代谢学分析结果第74-76页
　　1.1 肌纤维直径测定结果第74-75页
　　1.2 肌纤维组成测定结果第75-76页
2 猪不同骨骼肌组织转录组测序文库的构建第76-79页
　　2.1 总RNA甲醛变性琼脂糖凝胶检测结果第76-77页
　　2.2 总RNA毛细管电泳检测结果第77-78页
　　2.3 cDNA文库目的片段检测结果第78-79页
　　2.4 cDNA文库PCR扩增后的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测第79页
3 测序数据概述以及质量评估第79-143页
　　3.1 测序数据概述第80页
　　3.2 测序数据质量评估第80-81页
　　3.3 Clean reads的基因组比对第81-84页
　　3.4 转录本组装结果及其覆盖度分析第84-85页
　　3.5 蛋白编码基因(mRNA)的鉴定与分析第85-101页
　　3.6 lncRNA的筛选鉴定与功能分析第101-141页
　　3.7 circRNA的筛选鉴定及其功能分析第141-143页
4 RNA-seq数据的验证第143-146页
　　4.1 mRNA表达量的Q-PCR验证结果第143页
　　4.2 lncRNA表达量的Q-PCR验证结果第143页
　　4.3 circRNA的RT-PCR验证结果第143-146页
第五章 讨论第146-154页
1 背最长肌和腰大肌的组织学差异第146-147页
2 两种骨骼肌的mRNA转录组特征第147-150页
　　2.1 转录组中的RNA编辑事件第147-148页
　　2.2 两种骨骼肌组织中共同高表达的mRNA转录本第148-149页
　　2.3 两种骨骼肌各种特异性高表达mRNA涉及的生物学通路第149-150页
3 猪骨骼肌的lncRNA转录组特征第150-153页
　　3.1 lncRNA鉴定结果的可靠性第150-151页
　　3.2 lncRNA的基因组特征第151-152页
　　3.3 lncRNA的功能注解第152-153页
4 猪骨骼肌的circRNA转录组第153-154页
第六章 结论与创新点第154-156页
1 结论第154-155页
2 本研究创新点第155-156页
参考文献第156-170页
致谢第170-171页
博士在读期间发表论文及科研成果第171-173页
附录第173-183页

本篇论文共183页，点击这进入下载页面。
 
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