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葡萄抗病相关基因表达及抗黑痘病转录组研究

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葡萄抗病相关基因表达及抗黑痘病转录组研究
论文目录
 
摘要第1-7页
ABSTRACT第7-14页
第一章 文献综述第14-23页
  1.1 引言第14页
  1.2 葡萄病害和抗病机制研究第14-18页
    1.2.1 葡萄黑痘病第14-15页
    1.2.2 葡萄白粉病第15页
    1.2.3 葡萄抗病机制研究第15-18页
  1.3 抗病相关转录因子第18-20页
    1.3.1 JAZ转录因子第18-19页
    1.3.2 bHLH转录因子第19-20页
  1.4 转录组测序技术在葡萄中的应用第20-22页
  1.5 本研究的立题依据、目的意义和研究内容第22-23页
第二章 葡萄抗病相关基因的表达分析第23-42页
  2.1 材料第23-25页
    2.1.1 葡萄材料第23页
    2.1.2 EST序列第23页
    2.1.3 主要仪器设备第23页
    2.1.4 主要试剂第23-24页
    2.1.5 引物第24-25页
  2.2 方法第25-26页
    2.2.1 材料处理第25-26页
    2.2.2 葡萄RNA提取纯化及反转录反应第26页
    2.2.3 实时定量RT-PCR第26页
  2.3 结果与分析第26-39页
    2.3.1 中国野生毛葡萄商-24株系抗病相关EST序列分析及功能分类第26-28页
    2.3.2 中国野生毛葡萄商-24株系抗黑痘病相关基因第28-29页
    2.3.3 中国野生毛葡萄商-24株系抗白粉病相关基因第29页
    2.3.4 葡萄抗黑痘病相关基因表达分析第29-36页
    2.3.5 葡萄抗白粉病相关基因表达分析第36-39页
  2.4 讨论第39-42页
    2.4.1 葡萄抗病相关基因分析第39-40页
    2.4.2 代谢相关基因第40页
    2.4.3 防御相关基因第40-41页
    2.4.4 泛素/26S蛋白酶体途径相关基因第41-42页
第三章 抗病和感病葡萄抗黑痘病的转录组分析第42-70页
  3.1 材料第42页
    3.1.1 葡萄材料第42页
    3.1.2 主要仪器设备第42页
    3.1.3 主要试剂第42页
  3.2 方法第42-44页
    3.2.1 葡萄黑痘病接种第42页
    3.2.2 葡萄RNA的提取纯化第42-43页
    3.2.3 转录组文库构建及测序第43页
    3.2.4 差异表达基因的鉴定第43页
    3.2.5 差异表达基因的GO生物功能和Pathway富集性分析第43页
    3.2.6 转录组数据分析第43-44页
  3.3 结果与分析第44-67页
    3.3.1 接种黑痘菌后不同抗性葡萄转录组测序结果统计第44-45页
    3.3.2 不同接种时间抗病毛葡萄商-24株系和感病葡萄红地球的差异基因分析第45-56页
    3.3.3 相同接种时间抗病毛葡萄商-24株系与感病葡萄红地球的差异基因分析第56-63页
    3.3.4 抗病毛葡萄商-24株系和感病葡萄红地球差异基因表达模式的聚类分析第63-67页
  3.4 讨论第67-70页
    3.4.1 不同接种时间抗病毛葡萄商-24株系和感病葡萄红地球的差异基因分析第67-68页
    3.4.2 相同接种时间抗病毛葡萄商-24株系与感病葡萄红地球的差异基因分析第68页
    3.4.3 抗病毛葡萄商-24株系和感病葡萄红地球共表达差异基因分析第68-70页
第四章 葡萄JAZ基因家族的表达分析及克隆第70-85页
  4.1 材料第70-72页
    4.1.1 葡萄材料第70页
    4.1.2 主要仪器设备第70页
    4.1.3 主要试剂第70页
    4.1.4 载体与菌株第70-71页
    4.1.5 引物第71-72页
  4.2 方法第72-73页
    4.2.1 材料处理第72页
    4.2.2 葡萄RNA提取纯化及反转录反应第72页
    4.2.3 半定量RT-PCR第72-73页
    4.2.4 实时定量RT-PCR第73页
    4.2.5 葡萄JAZ基因的克隆第73页
  4.3 结果与分析第73-82页
    4.3.1 葡萄JAZ基因在不同组织中的表达分析第73-74页
    4.3.2 葡萄JAZ基因在不同外源激素处理下的表达分析第74-75页
    4.3.3 葡萄JAZ基因在高盐(NaCl)和干旱胁迫下的表达分析第75-76页
    4.3.4 葡萄JAZ基因在病原菌侵染后的表达分析第76-77页
    4.3.5 葡萄JAZ基因的qRT-PCR分析第77-78页
    4.3.6 葡萄JAZ抗逆抗病相关基因的克隆与分析第78-82页
  4.4 讨论第82-85页
第五章 葡萄bHLH转录因子家族的鉴定及表达分析第85-113页
  5.1 材料第85-87页
    5.1.1 葡萄材料第85页
    5.1.2 主要仪器设备第85页
    5.1.3 主要试剂第85页
    5.1.4 引物第85-87页
  5.2 方法第87-88页
    5.2.1 葡萄bHLH转录因子家族的鉴定第87页
    5.2.2 葡萄bHLH转录因子家族的序列比对及进化树分析第87-88页
    5.2.3 葡萄bHLH转录因子的蛋白基序分析第88页
    5.2.4 葡萄bHLH转录因子的外显子/内含子结构分析第88页
    5.2.5 葡萄bHLH转录因子的同线性分析第88页
    5.2.6 葡萄材料处理第88页
    5.2.7 葡萄RNA提取纯化及反转录反应第88页
    5.2.8 葡萄bHLH转录因子的实时定量表达分析第88页
  5.3 结果与分析第88-110页
    5.3.1 葡萄bHLH转录因子家族的鉴定第88-97页
    5.3.2 葡萄、拟南芥与水稻bHLH基因家族的进化树分析第97-99页
    5.3.3 葡萄bHLH转录因子家族的序列比对及进化树分析第99-101页
    5.3.4 葡萄bHLH转录因子家族的染色体定位和基因复制第101-103页
    5.3.5 葡萄和拟南芥bHLH转录因子家族的同线性分析第103-104页
    5.3.6 葡萄bHLH转录因子在不同组织中的表达分析第104-107页
    5.3.7 葡萄bHLH转录因子在外源ABA和MeJA激素处理下的表达分析第107页
    5.3.8 葡萄bHLH转录因子在高盐(NaCl)和干旱胁迫下的表达分析第107-110页
    5.3.9 葡萄bHLH转录因子在病原菌侵染后的表达分析第110页
  5.4 讨论第110-113页
    5.4.1 葡萄bHLH转录因子家族的鉴定第110页
    5.4.2 葡萄bHLH转录因子家族的进化与扩增第110-111页
    5.4.3 葡萄bHLH转录因子在多种生物过程中的功能第111-113页
第六章 结论第113-114页
参考文献第114-126页
附录第126-150页
缩略词第150-151页
致谢第151-152页
作者简介第152-153页

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