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水稻穗部性状QTL分析及精细定位研究

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水稻穗部性状QTL分析及精细定位研究
论文目录
 
中文摘要第1-8页
ABSTRACT第8-14页
符号说明第14-15页
第一章 文献综述第15-34页
  1. 水稻穗部性状研究进展第15-24页
  1.1 水稻穗部结构特征第16-18页
  1.2 穗部性状的遗传分析第18-19页
  1.3 穗部性状相关基因第19-22页
    1.3.1 标示SAM向IM转变的基因第19页
    1.3.2 调控叶腋分生组织形成的基因第19-20页
    1.3.3 调控枝梗及穗轴延伸的基因第20-21页
    1.3.4 调控穗发育过程中时间转换的基因第21页
    1.3.5 维持穗部多种分生组织细胞特性的基因第21-22页
  1.4 植物激素调控途径中的基因第22-24页
    1.4.1 细胞分裂素调控途径中的基因第22页
    1.4.2 生长素调控途径中的基因第22-23页
    1.4.3 赤霉素调控途径中的基因第23页
    1.4.4 独脚金内酯调控途径中的基因第23-24页
2 穗部性状QTL分析进展第24-28页
  2.1 遗传群体与QTL第25-27页
    2.1.1 初级群体第25页
    2.1.2 永久性群体第25-26页
    2.1.3 片段导入系群体第26-27页
  2.2 QTL定位方法第27-28页
    2.2.1 单标记分析法(The single marker mapping,SMM)第27页
    2.2.2 区间作图法(Interval mapping,IM)第27-28页
    2.2.3 复合区间作图法(Composite interval mapping,CIM)第28页
    2.2.4 混合线性模型复合区间作图法(Mixed composite interval mapping,MCIM)第28页
    2.2.5 多重区间作图法(Multiple interval mapping,MIM)第28页
3 遗传标记的发展第28-31页
  3.1 基于分子杂交技术的分子标记第29页
  3.2 基于PCR技术的分子标记第29-31页
  3.3 基于基因芯片技术和测序技术的分子标记第31页
4 本研究的目的和意义第31-34页
第二章 穗部性状以及单株产量的QTL分析第34-56页
1 材料与方法第34-36页
  1.1 性状调查第34-35页
  1.2 遗传图谱构建第35-36页
  1.3 QTL分析第36页
2 结果与分析第36-49页
  2.1 亲本以及RIL群体构建第36-41页
    2.1.1 穗长第37页
    2.1.2 每株穗数第37-38页
    2.1.3 一次枝梗数第38-39页
    2.1.4 穗着粒密度第39页
    2.1.5 每穗颖花数第39-40页
    2.1.6 二次枝梗数第40-41页
    2.1.7 单株重第41页
  2.2 RIL群体性状相关性分析第41-42页
  2.3 穗部性状QTL定位与分析第42-49页
    2.3.1 一次枝梗数的QTL第48页
    2.3.2 穗长QTL第48页
    2.3.3 单株穗数QTL第48页
    2.3.4 二次枝梗数QTL第48-49页
    2.3.5 穗着粒密度QTL第49页
    2.3.6 每穗颖花数QTL第49页
    2.3.7 单株产量QTL第49页
3 多效性位点第49-50页
4 结论与讨论第50-56页
  4.1 高精密度遗传图谱构建第51页
  4.2 QTL与已知基因关系分析第51-55页
    4.2.1 穗长QTL与已知基因第51-52页
    4.2.2 单株穗数QTL与已知基因第52页
    4.2.3 一次枝梗数QTL与已知基因第52-53页
    4.2.4 穗着粒密度QTL与已知基因第53页
    4.2.5 每穗颖花数QTL与已知基因第53页
    4.2.6 二次枝梗数QTL与已知基因第53-54页
    4.2.7 单株产量与已知基因第54-55页
  4.3 QTL的一因多效性第55-56页
第三章 三个穗部性状QTL的精细定位与克隆第56-72页
1 材料与方法第56-62页
  1.1 仪器与试剂第56-57页
  1.2 DNA的提取第57-59页
  1.3 总RNA的提取第59页
  1.4 cDNA的合成第59-60页
    1.4.1 使用方法第59-60页
    1.4.2 RT-PCR反应程序第60页
  1.5 实时定量PCR第60-61页
  1.6 互补验证第61-62页
2 结果与分析第62-69页
  2.1 一次枝梗数qPPB3第62-65页
    2.1.1 一次枝梗数qPPB3的精细定位第62-63页
    2.1.2 qPPB3的候选基因第63-64页
    2.1.3 D88蛋白的亚细胞定位第64-65页
  2.2 二次枝梗数qSPB1第65-67页
    2.2.1 qSPB1的精细定位第65页
    2.2.2 qSPB1的候选基因第65-67页
  2.3 每穗颖花数qSN8第67-69页
    2.3.1 qSN8的精细定位第67页
    2.3.2 qSN8候选基因的确定第67-68页
    2.3.3 转基因及互补表型观察第68-69页
  2.4 穗部相关基因的表达分析第69页
3 结论与讨论第69-72页
  3.1 茎秆分枝与穗部分枝第69-70页
  3.2 二次枝梗的可调控性第70-71页
  3.3 增加每穗颖花数基因第71-72页
第四章 全文结论第72-75页
参考文献第75-88页
附录第88-100页
致谢第100-102页
攻读学位期间发表论文第102-103页

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