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牦牛基因组遗传变异图谱和高原适应的转录组研究

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牦牛基因组遗传变异图谱和高原适应的转录组研究
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第一章 研究背景第12-38页
  1.1 牦牛第12-22页
    1.1.1 牦牛的起源与驯化第12-16页
    1.1.2 牦牛的育种现状第16-19页
    1.1.3 牦牛的高海拔适应研究第19-22页
  1.2 家养动物育种的研究进展第22-30页
    1.2.1 驯化与育种第22-25页
    1.2.2 分子育种第25-30页
  1.3 高海拔适应机制的研究进展第30-35页
    1.3.1 高海拔适应的分子机制第31-32页
    1.3.2 基因组学研究第32-33页
    1.3.3 转录组学研究第33-35页
  1.4 研究意义和科学问题第35-38页
    1.4.1 牦牛基因组遗传变异图谱第37页
    1.4.2 牦牛高海拔适应的分子机制第37-38页
第二章 材料与方法第38-51页
  2.1 牦牛基因组遗传变异图谱第38-47页
    2.1.1 牦牛基因组的升级第38-42页
    2.1.2 样品采集与DNA测序第42页
    2.1.3 全基因组遗传变异的鉴定第42-45页
    2.1.4 群体基因组学分析第45-46页
    2.1.5 遗传变异图谱的可视化第46-47页
  2.2 牦牛高海拔适应的分子机制第47-51页
    2.2.1 样品采集与RNA测序第47页
    2.2.2 差异表达分析第47-48页
    2.2.3 组织间表达相关性比较第48-49页
    2.2.4 多组织差异表达基因第49-51页
第三章 研究结果第51-73页
  3.1 牦牛基因组遗传变异图谱第51-62页
    3.1.1 基因组组装与注释第51-52页
    3.1.2 样品采集与测序第52-54页
    3.1.3 全基因组遗传变异第54-58页
    3.1.4 群体基因组学分析第58-60页
    3.1.5 遗传变异图谱的可视化第60-62页
  3.3 牦牛高海拔适应的分子机制第62-73页
    3.3.1 样品采集以及转录组测序第62页
    3.3.2 表达模式分析第62-65页
    3.3.3 差异表达基因第65-69页
    3.3.4 多组织差异表达基因第69-73页
第四章 讨论第73-85页
  4.1 牦牛基因组遗传变异图谱第73-79页
    4.1.1 基因组的升级第73-74页
    4.1.2 家养牦牛与野生牦牛的遗传分化第74-75页
    4.1.3 家养牦牛的驯化第75-77页
    4.1.4 遗传变异图谱和分子育种第77-79页
  4.2 牦牛高海拔适应的分子机制第79-83页
    4.2.1 牦牛与黄牛表达模式的差异第79-80页
    4.2.2 差异表达基因对低氧胁迫的应答第80-81页
    4.2.3 多组织差异表达基因第81-83页
  4.3 总结与展望第83-85页
参考文献第85-98页
在学期间的研究成果第98-99页
致谢第99页

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