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中国壳囊孢属真菌分类与系统发育研究

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中国壳囊孢属真菌分类与系统发育研究
论文目录
 
摘要第1-10页
ABSTRACT第10-20页
缩略语第20-21页
第一章 前言第21-40页
  1.1 引言第21页
  1.2 壳囊孢属真菌引起的腐烂病综述第21-25页
  1.3 壳囊孢属真菌系统学位置及分类系统第25-38页
  1.4 研究目的和意义第38-39页
  1.5 技术路线第39-40页
第二章 壳囊孢属真菌种类鉴定及系统发育分析第40-86页
  2.1 材料与方法第40-54页
    2.1.1 主要仪器与试剂第40页
    2.1.2 试验菌株来源及分离、培养第40-42页
    2.1.3 形态特征及培养性状观察第42页
    2.1.4 试验菌株真菌DNA提取第42-43页
    2.1.5 rDNA-ITS、EF1-a和 β-tubulin序列PCR扩增及检测第43-45页
    2.1.6 PCR扩增产物测序与拼接、校正第45页
    2.1.7 三种序列同源性比对及系统发育分析第45-54页
  2.2 结果与分析第54-81页
    2.2.1 试验菌株分布第54页
    2.2.2 种类鉴定结果与分析第54-67页
    2.2.3 测序结果统计第67-68页
    2.2.4 rDNA-ITS序列同源性比对及系统发育分析结果第68-69页
    2.2.5 EF1-a序列同源性比对及系统发育分析结果第69-77页
    2.2.6 β-tubulin序列同源性比对及系统发育分析结果第77-81页
  2.3 讨论第81-85页
    2.3.1 形态学第81-82页
    2.3.2 系统发育分析第82-85页
  2.4 本章小结第85-86页
第三章 壳囊孢属新种Cytospora palm sp.nov.的鉴定和描述第86-99页
  3.1 材料与方法第86-90页
    3.1.1 试验菌株分离、培养及形态观察第86页
    3.1.2 接种试验第86-87页
    3.1.3 rDNA-ITS序列系统发育分析第87-90页
  3.2 试验结果第90-96页
    3.2.1 试验菌株形态鉴定第90-92页
    3.2.2 接种试验结果第92-93页
    3.2.3 rDNA-ITS序列系统发育分析结果第93-96页
  3.3 讨论第96-98页
  3.4 本章小结第98-99页
第四章 ITS1次级结构信息在Cytospora近缘种系统发育研究中的应用第99-122页
  4.1 材料和方法第101-106页
    4.1.1 常规系统发育分析方法第101-102页
    4.1.2 ITS1区域识别以及次级结构预测和比对第102-106页
    4.1.3 常规序列和次级结构复合信息的系统发育分析第106页
    4.1.4 保守区域和可变区域的识别第106页
  4.2 系统发育分析结果第106-116页
    4.2.1 常规rDNA-ITS序列系统发育分析结果第106-112页
    4.2.2 ITS1序列次级结构预测结果第112页
    4.2.3 联合ITS1序列及其次级结构信息的系统发育分析结果第112-116页
  4.3 讨论第116-121页
  4.4 本章小结第121-122页
第五章 金黄壳囊孢Cytospora chrysosperma种内遗传分化研究第122-143页
  5.1 材料与方法第123-127页
    5.1.1 试验菌株第123页
    5.1.2 试验菌株rDNA-ITS、EF1-a和 β-tubulin序列第123页
    5.1.3 rDNA-ITS、EF1-a和 β-tubulin序列进化树构建以及多基因联合分析第123-126页
    5.1.4 C. chrysosperma祖先地理分布区重建第126-127页
  5.2 系统发育分析结果第127-138页
    5.2.1 rDNA-ITS序列系统发育分析结果第127页
    5.2.2 EF1-A序列系统发育分析结果第127-128页
    5.2.3 β-tubulin序列系统发育分析结果第128-129页
    5.2.4 rDNA-ITS、EF1-a和 β-tubulin多基因联合系统发育分析结果第129-135页
    5.2.5 C. chrysosperma祖先分布区重建结果第135-138页
  5.3 讨论第138-142页
  5.4 本章小结第142-143页
第六章 总结、展望与创新点第143-147页
  6.1 总结第143-145页
  6.2 展望第145-146页
  6.3 论文创新点第146-147页
参考文献第147-157页
在读期间发表论文第157-158页
致谢第158页

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