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棉铃虫对Bt的抗性机制及其取食诱导后棉花转录组的变化

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棉铃虫对Bt的抗性机制及其取食诱导后棉花转录组的变化
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-9页
缩略词第9-15页
1 前言第15-27页
  1.1 BT研究进展第15-18页
    1.1.1 Bt简介第15-16页
    1.1.2 Bt的作用机制及假说模型第16-18页
  1.2 Bt抗性现状第18-20页
    1.2.1 昆虫对Bt室内抗性第19页
    1.2.2 昆虫对Bt田间抗性第19-20页
    1.2.3 棉铃虫对Bt的抗性第20页
  1.3 昆虫对Bt抗性机制、受体和抗性治理策略第20-21页
    1.3.1 昆虫对Bt抗性的机制简介第20-21页
    1.3.2 昆虫中肠受体蛋白种类第21页
    1.3.3 Bt作物害虫抗性治理策略第21页
  1.4 植物的抗虫性第21-24页
    1.4.1 植物组成性防御第21-22页
    1.4.2 植物诱导性防御第22-23页
    1.4.3 虫害诱导的植物体内信号分子第23-24页
    1.4.4 棉花的防御功能第24页
  1.5 高通量测序技术第24-26页
    1.5.1 高通量测序技术简介第24页
    1.5.2 高通量测序技术的种类第24-25页
    1.5.3 转录组测序第25页
    1.5.4 RNA Seq原理第25页
    1.5.5 RNA Seq的技术优势第25-26页
  1.6 本研究的目的和意义第26页
  1.7 本研究目标第26-27页
2 抗、感棉铃虫钙粘蛋白、氨肽酶-N和碱性磷酸酶基因毒素结合区克隆与分析第27-40页
  2.1 材料与方法第27-34页
    2.1.1 供试材料第27-28页
    2.1.2 主要试剂第28页
    2.1.3 LB培养基及试剂的配制第28页
    2.1.4 主要仪器设备第28-29页
    2.1.5 技术路线第29页
    2.1.6 CAD、APN1和ALP1基因Cry1Ac毒素结合区克隆、测序第29-34页
  2.2 结果与分析第34-38页
    2.2.1 棉铃虫中肠总RNA的提取第34-35页
    2.2.2 CAD、APN1和ALP1基因毒素结合区的特异性扩增第35页
    2.2.3 CAD、APN1和ALP1基因Cry1Ac结合区EST分析第35-38页
  2.3 讨论第38-40页
3 抗、感棉铃虫钙粘蛋白、氨肽酶-N和碱性磷酸酶时、空相对表达量比较第40-58页
  3.1 材料与方法第40-44页
    3.1.1 供试材料第40-41页
    3.1.2 主要试剂第41页
    3.1.3 主要仪器设备第41页
    3.1.4 技术路线第41-42页
    3.1.5 主要方法第42页
    3.1.6 引物的设计与合成第42-43页
    3.1.7 qPCR反应体系和程序第43页
    3.1.8 探针可靠性验证第43页
    3.1.9 数据分析及处理第43-44页
  3.2 结果与分析第44-55页
    3.2.1 结果与分析第44页
    3.2.2 探针的可靠性验证第44-50页
    3.2.3 CAD在抗、感棉铃虫世代历期中相对表达量分析第50页
    3.2.4 APN1在抗、感棉铃虫世代历期中相对表达量分析第50-51页
    3.2.5 ALP1在抗、感棉铃虫世代历期中相对表达量分析第51-52页
    3.2.6 CAD、APN1和ALP1在敏感品系不同组织中相对表达量分析第52-53页
    3.2.7 CAD、APN1和ALP1在抗性品系不同组织中相对表达量分析第53-54页
    3.2.8 CAD、APN1和ALP1同一龄期(初孵)不同抗性水平相对表达量分析第54-55页
  3.3 讨论第55-58页
4 RNA干扰棉铃虫体内的钙粘蛋白、氨肽酶-N和碱性磷酸酶及其功能验证第58-71页
  4.1 材料和方法第58-61页
    4.1.1 供试材料第58页
    4.1.2 主要试剂第58-59页
    4.1.3 主要仪器设备第59页
    4.1.4 技术路线第59-60页
    4.1.5 主要方法第60-61页
  4.2 结果与分析第61-69页
    4.2.1 不同siCAD片段和不同时间点沉默效果第61-62页
    4.2.2 不同siAPN1片段和不同时间点沉默效果第62-63页
    4.2.3 不同siALP1片段和不同时间点沉默效果第63-64页
    4.2.4 有效siRNA注射后24小时沉默效果第64-65页
    4.2.5 RNA干扰后的幼虫体重抑制(Bt胁迫)第65页
    4.2.6 RNA干扰后的幼虫死亡率(Bt胁迫)第65-66页
    4.2.7 RNA干扰后的幼虫化蛹率(Bt胁迫)第66-67页
    4.2.8 RNA干扰后的羽化率(Bt胁迫)第67-68页
    4.2.9 RNA干扰ALP1后的死亡率、化蛹率及羽化率(非Bt胁迫)第68-69页
  4.3 讨论第69-71页
5 棉铃虫取食诱导棉花转录组变化测序第71-80页
  5.1 材料与方法第71-76页
    5.1.1 供试材料第71-72页
    5.1.2 主要试剂第72页
    5.1.3 主要仪器第72页
    5.1.4 棉苗栽培第72-73页
    5.1.5 技术路线第73页
    5.1.6 虫害胁迫第73-74页
    5.1.7 棉花总RNA的提取和纯化第74-75页
    5.1.8 cDNA合成第75-76页
    5.1.9 建库和测序第76页
  5.2 结果与分析第76-78页
    5.2.1 棉花总RNA提取第76页
    5.2.2 Solexa测序统计数据量与拼接Contig数量关系第76-77页
    5.2.3 Solexa测序统计总Reads数第77页
    5.2.4 EST拼装第77-78页
  5.3 讨论第78-80页
6 棉铃虫取食诱导棉花转录组变化分析和抗虫基因的筛选第80-91页
  6.1 材料与方法第80页
  6.2 结果与分析第80-89页
    6.2.1 基因注释第80页
    6.2.2 GO分析第80-82页
    6.2.3 代谢通路构建第82-84页
    6.2.4 表达丰度分析第84-86页
    6.2.5 GO term类别富集分析第86-88页
    6.2.6 Pathway富集分析结果第88页
    6.2.7 两样本间基因显著性差异分析第88-89页
    6.2.8 不同时间点同时上调、下调的处理样本第89页
    6.2.9 抗性基因简单筛选第89页
  6.3 讨论第89-91页
7 全文结论与讨论第91-94页
  7.1 全文结论第91-93页
  7.2 全文讨论第93-94页
    7.2.1 问题第93页
    7.2.2 展望第93-94页
致谢第94-95页
参考文献第95-103页
附录第103页

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