论文目录 | |
| 摘要 | 第11-14页 |
| Abstract | 第14-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-26页 |
| 1.1 亚洲栽培稻分类 | 第16-18页 |
| 1.2 亚洲栽培稻的驯化 | 第18-19页 |
| 1.3 中国东北粳稻的育种历史与贡献 | 第19-21页 |
| 1.4 杂草稻的分布与生物学特性 | 第21-22页 |
| 1.5 杂草稻的起源演化研究进展 | 第22-23页 |
| 1.6 应用驯化相关基因对研究杂草稻演化的设想 | 第23-26页 |
| 第二章 利用基因组范围分子标记分析中国东北粳稻的遗传组成与多样性 | 第26-42页 |
| 2.1 材料与方法 | 第27-29页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第27页 |
| 2.1.2 基因组DNA提取与SSR分子标记分析 | 第27页 |
| 2.1.3 样本粳稻核心SNPs的Golden Gate基因芯片分析 | 第27-29页 |
| 2.1.4 数据分析 | 第29页 |
| 2.2 结果与分析 | 第29-38页 |
| 2.2.1 东北粳稻遗传多样性的历史变化 | 第29-30页 |
| 2.2.2 基于SSR标记的群体遗传结构分析 | 第30-32页 |
| 2.2.3 基于SSR标记的系统进化分析 | 第32页 |
| 2.2.4 样本粳稻核心SNPs的基因型判定 | 第32-34页 |
| 2.2.5 基于粳稻核心SNPs群体结构分析 | 第34-36页 |
| 2.2.6 基于粳稻核心SNPs的主成分分析与系统进化分析 | 第36-38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-42页 |
| 第三章 籼稻血缘对东北粳稻育种贡献的遗传基础 | 第42-56页 |
| 3.1 材料与方法 | 第43-45页 |
| 3.1.1 供试材料 | 第43页 |
| 3.1.2 产量构成因素性状调查 | 第43-44页 |
| 3.1.3 基因组DNA提取与亚种特异Indel,SSILP分子标记分析 | 第44页 |
| 3.1.4 亚种特异SNPs的筛选与应用 | 第44-45页 |
| 3.1.5 数据分析 | 第45页 |
| 3.2 结果与分析 | 第45-53页 |
| 3.2.1 籼(粳)稻基因型频率与程氏指数判别值的相关分析 | 第45-46页 |
| 3.2.2 亚种特异Indel与SSILP标记分析东北粳稻籼稻基因型频率 | 第46-50页 |
| 3.2.3 东北粳稻籼型基因型频率与产量构成因素的相关分析 | 第50-51页 |
| 3.2.4 亚种特异SNPs的筛选与芯片合成 | 第51页 |
| 3.2.5 亚种特异SNPs芯片SSS在籼粳成分分析中的应用 | 第51-53页 |
| 3.3 讨论 | 第53-56页 |
| 3.3.1 籼粳杂交扩展了东北粳稻的遗传多样性 | 第53-54页 |
| 3.3.2 籼稻基因的利用改善了粳稻固有的形态与生理基础 | 第54页 |
| 3.3.3 亚洲栽培稻亚种分化分子标记的发展 | 第54-56页 |
| 第四章 东北粳稻产量与品质相关基因的特点 | 第56-64页 |
| 4.1 材料与方法 | 第56-58页 |
| 4.1.1 供试材料 | 第56页 |
| 4.1.2 基因组DNA提取 | 第56页 |
| 4.1.3 产量与品质相关基因的基因型检测 | 第56-58页 |
| 4.2 结果与分析 | 第58-61页 |
| 4.2.1 籼稻功能基因在中国东北粳型水稻中的利用 | 第58-61页 |
| 4.3 讨论 | 第61-64页 |
| 4.3.1 重要农艺性状优势等位基因在东北粳稻群体中的应用 | 第61-62页 |
| 4.3.2 东北地区籼粳杂交育种未来的发展方向 | 第62-64页 |
| 第五章 杂草稻样本的遗传背景分析 | 第64-74页 |
| 5.1 材料与方法 | 第64-66页 |
| 5.1.1 供试材料 | 第64-65页 |
| 5.1.2 基因组DNA与叶绿体DNA提取 | 第65页 |
| 5.1.3 亚种特异Indel与SSILP标记分析 | 第65页 |
| 5.1.4 样本atpB-rbcL,p-VATPase与SAM基因区域DNA单体型检测 | 第65-66页 |
| 5.1.5 数据分析 | 第66页 |
| 5.2 结果与分析 | 第66-71页 |
| 5.2.1 杂草稻基于亚种特异位点变异的系统发育与比较分析 | 第66-68页 |
| 5.2.2 基于三个基因单体型建立杂草稻与稻属植物的遗传关系 | 第68-71页 |
| 5.3 讨论 | 第71-74页 |
| 第六章 杂草稻驯化相关性状与基因的特点 | 第74-82页 |
| 6.1 材料与方法 | 第74-76页 |
| 6.1.1 供试材料 | 第74页 |
| 6.1.2 驯化相关性状的调查 | 第74-75页 |
| 6.1.3 基因组DNA的提取 | 第75页 |
| 6.1.4 驯化相关基因的基因型与基因区域单体型检测 | 第75-76页 |
| 6.1.5 数据分析 | 第76页 |
| 6.2 结果与分析 | 第76-79页 |
| 6.2.1 杂草稻样本的落粒性及其相关基因特点 | 第76-77页 |
| 6.2.2 杂草稻样本的休眠性及其相关基因特点 | 第77页 |
| 6.2.3 杂草稻样本的果皮颜色及其相关基因特点 | 第77-78页 |
| 6.2.4 杂草稻样本的颖壳颜色与酚反应及其相关基因特点 | 第78页 |
| 6.2.5 杂草稻样本蜡质基因Waxy的特点 | 第78页 |
| 6.2.6 杂草稻样本粒型及其相关基因的特点 | 第78-79页 |
| 6.3 讨论 | 第79-82页 |
| 6.3.1 驯化相关基因在不同水稻组群中的分类与选择 | 第79-81页 |
| 6.3.2 驯化相关基因对杂草稻防控的重要意义 | 第81-82页 |
| 第七章 杂草稻驯化相关基因与种子耐老化的关系 | 第82-92页 |
| 7.1 材料与方法 | 第82-83页 |
| 7.1.1 杂草稻与栽培稻杂交F_2群体的构建 | 第82页 |
| 7.1.2 种子耐老化的检测 | 第82页 |
| 7.1.3 基因组DNA提取 | 第82页 |
| 7.1.4 F_2群体四个驯化相关基因的基因型检测 | 第82-83页 |
| 7.1.5 数据分析 | 第83页 |
| 7.2 结果与分析 | 第83-86页 |
| 7.2.1 种子耐老化与4个驯化相关基因的经典遗传学分析 | 第83-86页 |
| 7.3 讨论 | 第86-92页 |
| 7.3.1 杂草稻种群的演化与扩张动力 | 第86-87页 |
| 7.3.2 驯化相关基因与生态适应性之间的关系 | 第87-88页 |
| 7.3.3 关于杂草稻样本演化的探讨 | 第88-92页 |
| 第八章 以驯化视角解读东北粳稻及其伴生杂草稻的遗传演化 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-112页 |
| 附录 | 第112-122页 |
| 致谢 | 第122-124页 |
| 攻读博士学位论文期间发表的论文 | 第124页 |
