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四个玉米及其野生材料BAC基因组文库的构建和分析

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四个玉米及其野生材料BAC基因组文库的构建和分析
论文目录
 
摘要第1-10页
Abstract第10-13页
缩写名词表第13-14页
  1. 前言第14-36页
  1.1 玉米研究的重要性第14-15页
  1.2 郑58和昌7-2的特点第15-16页
  1.3 野生玉米材料的研究进展第16-23页
    1.3.1 野生玉米材料分类和特点第16-18页
    1.3.2 Parviglumis的特点的研究进展第18-20页
    1.3.3 Tripsacum的特征和研究进展第20-23页
  1.4 大片段克隆载体的研究进展第23-27页
  1.5 BAC文库的应用第27-34页
    1.5.1 基因的图位克隆第27页
    1.5.2 物理图谱的构建第27-30页
    1.5.3 全基因组测序第30页
    1.5.4 比较基因组学研究第30-33页
    1.5.5 BAC文库的新用途第33-34页
  1.6 本研究的目的和意义第34-36页
  2. 材料和方法第36-48页
  2.1 玉米材料第36页
  2.2 BAC载体第36页
  2.3 BAC载体的制备第36-38页
  2.4 玉米基因组DNA包埋块的制备第38页
  2.5 预先部分酶解第38-39页
  2.6 高分子量DNA片段的制备第39-40页
  2.7 BAC文库的构建第40-41页
  2.8 文库的质量检测第41-47页
    2.8.1 平均插入片段的检测第41页
    2.8.2 探针的制备第41-43页
    2.8.3 筛选两个野生玉米的BAC文库第43-45页
    2.8.4 BAC末端测序和FPC组装第45-46页
    2.8.5 BESs和克隆的定位第46-47页
    2.8.6 细胞器污染率的估算第47页
  2.9 文库的复制第47-48页
  3. 结果与分析第48-76页
  3.1 BAC载体的制备第48-49页
  3.2 预先部分酶解玉米基因组DNA第49-54页
  3.3 高分子量DNA片段的制备第54-59页
  3.4 BAC文库的制备和质量检测第59-65页
  3.5 BAC文库的筛选第65-70页
    3.5.1 同位素标记探针筛选两个野生玉米文库第65-66页
    3.5.2 杂交结果的验证第66-70页
  3.6 BAC末端测序以及contig的拼装第70-73页
  3.7 利用BESs将部分BAC克隆锚定到玉米B73参考序列上第73-76页
  4. 讨论第76-83页
  4.1 BAC文库的构建第76-77页
  4.2 BAC文库基因组覆盖度的估计第77-79页
  4.3 对这些BAC文库资源的利用第79-82页
  4.4 本实验以外的BAC文库构建第82-83页
参考文献第83-95页
附录1 部分实验体系及步骤第95-104页
  附1.1 Plasmid DNA purification using QIAGEN plasmid Midi Kit第95-96页
  附1.2 植物基因组DNA包埋块制备时需要的试剂第96页
  附1.3 BAC克隆质粒的手工小量提取第96-97页
  附1.4 制备基因探针PCR反应体系第97-99页
  附1.5 杂交膜的制备第99-100页
  附1.6 DIG High Prime DNA Labeling and Detection Starter Kit I(Roche)第100-102页
  附1.7 96孔板提取BAC质粒第102-104页
附录2 附表第104-121页
附录3 简历第121-123页
致谢第123-124页

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