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四个玉米及其野生材料BAC基因组文库的构建和分析
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四个玉米及其野生材料BAC基因组文库的构建和分析
论文目录
摘要
第1-10页
Abstract
第10-13页
缩写名词表
第13-14页
1. 前言
第14-36页
1.1 玉米研究的重要性
第14-15页
1.2 郑58和昌7-2的特点
第15-16页
1.3 野生玉米材料的研究进展
第16-23页
1.3.1 野生玉米材料分类和特点
第16-18页
1.3.2 Parviglumis的特点的研究进展
第18-20页
1.3.3 Tripsacum的特征和研究进展
第20-23页
1.4 大片段克隆载体的研究进展
第23-27页
1.5 BAC文库的应用
第27-34页
1.5.1 基因的图位克隆
第27页
1.5.2 物理图谱的构建
第27-30页
1.5.3 全基因组测序
第30页
1.5.4 比较基因组学研究
第30-33页
1.5.5 BAC文库的新用途
第33-34页
1.6 本研究的目的和意义
第34-36页
2. 材料和方法
第36-48页
2.1 玉米材料
第36页
2.2 BAC载体
第36页
2.3 BAC载体的制备
第36-38页
2.4 玉米基因组DNA包埋块的制备
第38页
2.5 预先部分酶解
第38-39页
2.6 高分子量DNA片段的制备
第39-40页
2.7 BAC文库的构建
第40-41页
2.8 文库的质量检测
第41-47页
2.8.1 平均插入片段的检测
第41页
2.8.2 探针的制备
第41-43页
2.8.3 筛选两个野生玉米的BAC文库
第43-45页
2.8.4 BAC末端测序和FPC组装
第45-46页
2.8.5 BESs和克隆的定位
第46-47页
2.8.6 细胞器污染率的估算
第47页
2.9 文库的复制
第47-48页
3. 结果与分析
第48-76页
3.1 BAC载体的制备
第48-49页
3.2 预先部分酶解玉米基因组DNA
第49-54页
3.3 高分子量DNA片段的制备
第54-59页
3.4 BAC文库的制备和质量检测
第59-65页
3.5 BAC文库的筛选
第65-70页
3.5.1 同位素标记探针筛选两个野生玉米文库
第65-66页
3.5.2 杂交结果的验证
第66-70页
3.6 BAC末端测序以及contig的拼装
第70-73页
3.7 利用BESs将部分BAC克隆锚定到玉米B73参考序列上
第73-76页
4. 讨论
第76-83页
4.1 BAC文库的构建
第76-77页
4.2 BAC文库基因组覆盖度的估计
第77-79页
4.3 对这些BAC文库资源的利用
第79-82页
4.4 本实验以外的BAC文库构建
第82-83页
参考文献
第83-95页
附录1 部分实验体系及步骤
第95-104页
附1.1 Plasmid DNA purification using QIAGEN plasmid Midi Kit
第95-96页
附1.2 植物基因组DNA包埋块制备时需要的试剂
第96页
附1.3 BAC克隆质粒的手工小量提取
第96-97页
附1.4 制备基因探针PCR反应体系
第97-99页
附1.5 杂交膜的制备
第99-100页
附1.6 DIG High Prime DNA Labeling and Detection Starter Kit I(Roche)
第100-102页
附1.7 96孔板提取BAC质粒
第102-104页
附录2 附表
第104-121页
附录3 简历
第121-123页
致谢
第123-124页
本篇论文共
124
页,
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