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吲哚好氧转化微生物群落结构及功能基因解析

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吲哚好氧转化微生物群落结构及功能基因解析
论文目录
 
摘要第1-6页
ABSTRACT第6-18页
主要符号与英文缩写表第18-19页
1 吲哚的微生物转化研究进展第19-43页
  1.1 吲哚的来源及其生物学特性第19-29页
    1.1.1 吲哚的物化性质、来源及危害第19-24页
    1.1.2 吲哚在微生物间的转运第24-26页
    1.1.3 吲哚对微生物的信号分子作用第26-29页
  1.2 吲哚的微生物转化研究第29-40页
    1.2.1 吲哚的微生物好氧降解研究第29-34页
    1.2.2 吲哚的微生物厌氧降解研究第34-36页
    1.2.3 吲哚的微生物转化合成靛蓝研究第36-40页
  1.3 本论文的选题依据及研究内容第40-43页
    1.3.1 本论文的选题依据第40-41页
    1.3.2 本论文的研究内容及意义第41-43页
2 吲哚好氧生物转化微生物群落解析第43-62页
  2.1 材料与方法第43-47页
    2.1.1 实验材料第43-44页
    2.1.2 实验方法第44-47页
  2.2 结果与讨论第47-61页
    2.2.1 实际焦化废水污泥微生物群落分析第47-50页
    2.2.2 吲哚废水反应器运行与产物分析第50-52页
    2.2.3 反应器污泥微生物群落多样性分析第52-54页
    2.2.4 反应器污泥微生物群落结构分析第54-57页
    2.2.5 反应器污泥中吲哚降解菌分析第57-61页
  2.3 本章小结第61-62页
3 吲哚降解菌的筛选及Cupriavidus sp. SHE组学分析第62-80页
  3.1 材料与方法第62-66页
    3.1.1 实验材料第62-63页
    3.1.2 实验方法第63-66页
  3.2 结果与讨论第66-79页
    3.2.1 吲哚降解菌株的筛选和鉴定第66-67页
    3.2.2 吲哚降解菌株降解特性第67-70页
    3.2.3 贪铜菌SHE降解吲哚途径解析第70-73页
    3.2.4 贪铜菌SHE基因组分析第73-75页
    3.2.5 贪铜菌SHE比较蛋白质组解析第75-79页
  3.3 本章小结第79-80页
4 菌株Cupriavidus sp. SHE降解吲哚机制解析第80-102页
  4.1 材料与方法第80-87页
    4.1.1 实验材料第80-82页
    4.1.2 实验方法第82-87页
  4.2 结果与讨论第87-101页
    4.2.1 吲哚加氧酶基因簇结构及荧光定量分析第87-88页
    4.2.2 吲哚加氧酶基因簇基因敲除及功能验证第88-93页
    4.2.3 邻氨基苯甲酸代谢基因簇结构分析及荧光定量第93-95页
    4.2.4 邻氨基苯甲酸代谢基因簇基因敲除及功能验证第95-99页
    4.2.5 菌株SHE降解吲哚的代谢途径确定第99-101页
  4.3 本章小结第101-102页
5 吲哚加氧酶特性及其转化吲哚研究第102-126页
  5.1 材料与方法第102-105页
    5.1.1 实验材料第102-103页
    5.1.2 实验方法第103-105页
  5.2 结果与讨论第105-125页
    5.2.1 吲哚加氧酶IndA生物信息学分析第105-111页
    5.2.2 吲哚加氧酶IndA酶学性质研究第111-116页
    5.2.3 重组大肠杆菌IND_AB合成靛蓝可行性研究第116-118页
    5.2.4 重组大肠杆菌IND_AB合成靛蓝环境因素优化第118-120页
    5.2.5 重组大肠杆菌IND_AB合成靛蓝培养基优化第120-125页
  5.3 本章小结第125-126页
6 结论、创新点、建议第126-128页
  6.1 主要结论第126-127页
  6.2 创新点摘要第127页
  6.3 建议第127-128页
参考文献第128-142页
附录A 菌株SHE基因组中加氧酶总结列表第142-147页
附录B 菌株SHE蛋白质组检测到的显著变化蛋白总结列表第147-152页
附录C 菌株SHE中邻氨基苯甲酸辅酶A连接酶基因she1810序列第152-153页
附录D 菌株SHE中吲哚加氧酶基因she5652序列第153-154页
作者简介第154-155页
攻读博士学位期间科研成果第155-157页
致谢第157页

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