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刺槐—根瘤菌共生体系在重金属污染土壤修复过程中对土壤微生物的影响

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刺槐—根瘤菌共生体系在重金属污染土壤修复过程中对土壤微生物的影响
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-14页
第一章 绪论第14-37页
  1.1 土壤重金属污染及危害第14-16页
  1.2 重金属污染土壤的修复技术第16页
    1.2.1 物理和化学方法第16页
    1.2.2 生物方法第16页
  1.3 植物修复第16-19页
    1.3.1 植物修复策略第16-18页
    1.3.2 植物修复的局限第18页
    1.3.3 微生物强化植物修复第18-19页
  1.4 根瘤菌强化豆科植物修复第19-31页
    1.4.1 豆科植物用于植物修复的优势第19-25页
    1.4.2 根瘤菌对胁迫响应的机制第25-31页
  1.5 重金属对土壤微生物活性及群落结构的影响第31-32页
    1.5.1 重金属对土壤微生物酶活性的影响第31页
    1.5.2 重金属对土壤微生物群落结构的影响第31-32页
  1.6 高通量测序技术在环境微生物群落研究中的应用第32-34页
  1.7 研究内容及技术路线第34-37页
    1.7.1 研究目的第34-35页
    1.7.2 研究内容及技术路线第35-37页
第二章 重金属污染土壤中微生物多样性及群落结构的研究第37-58页
  2.1 引言第37-38页
  2.2 材料与方法第38-39页
    2.2.1 土壤样品的采集策略第38页
    2.2.2 土壤理化性质的测定第38页
    2.2.3 DNA提取、PCR和 16S rRNA基因V4-V5区测序第38-39页
    2.2.4 16S rRNA基因序列生物信息学分析第39页
    2.2.5 数据统计分析第39页
  2.3 结果与分析第39-55页
    2.3.1 土壤理化因子分析第39-44页
    2.3.2 测序及分类确定第44页
    2.3.3 沉淀池周边土壤中微生物群落结构分析第44页
    2.3.4 土壤微生物群落结构和理化因子的关系第44-51页
    2.3.5 基于两个分组的微生物潜在代谢特征分析第51页
    2.3.6 基于两个分组的微生物指示种分析第51-55页
  2.4 讨论第55-58页
    2.4.1 微生物群落和多样性的变化第55-56页
    2.4.2 主导微生物以及基于两个分组的微生物潜在代谢特征分析第56-57页
    2.4.3 基于两个分组的微生物群落指示种分析第57-58页
第三章 铅锌矿区刺槐根瘤中具有重金属抗性及促生特性的内生细菌的分离鉴定第58-73页
  3.1 引言第58-59页
  3.2 材料和方法第59-60页
    3.2.1 植物和土壤样品的采集及土壤理化性质的测定第59页
    3.2.2 根瘤内生细菌的分离纯化与保存第59页
    3.2.3 细菌重金属耐受性检测第59页
    3.2.4 细菌ACC脱氨酶活性的检测第59页
    3.2.5 细菌产IAA能力的检测第59页
    3.2.6 细菌产铁载体能力的检测第59-60页
    3.2.7 细菌溶解磷酸钙能力的检测第60页
    3.2.8 细菌 16S rRNA、nod A和nif H基因扩增和测序第60页
    3.2.9 系统发育分析第60页
    3.2.10 选择强化植物修复的优势菌株第60页
  3.3 结果与分析第60-70页
    3.3.1 土壤理化性质第60-61页
    3.3.2 根瘤内可培养细菌的遗传多样性第61-69页
    3.3.3 细菌对重金属的耐受性检测第69页
    3.3.4 细菌的ACC脱氨酶活性及产IAA、铁载体和溶解磷的能力第69-70页
    3.3.5 优势促生菌株的筛选第70页
  3.4 讨论第70-73页
第四章 重金属污染土壤修复过程中根际土壤微生物群落多样性和功能的研究第73-117页
  4.1 引言第73-74页
  4.2 材料和方法第74-78页
    4.2.1 污染土壤的采集第74页
    4.2.2 试验设计第74-76页
    4.2.3 植物和土壤样品的采集及理化性质的测定第76页
    4.2.4 DNA的提取第76-77页
    4.2.5 PCR、16S rRNA基因V4-V5区测序及生物信息学分析第77页
    4.2.6 宏基因组测序及生物信息学分析第77-78页
    4.2.7 数据统计分析第78页
  4.3 结果与分析第78-114页
    4.3.1 植物修复评价第78-81页
    4.3.2 细菌群落结构和多样性分析(基于 16S rRNA基因V4-V5区测序)第81-88页
    4.3.3 环境因子对细菌群落结构的影响第88-89页
    4.3.4 接种和未接种刺槐根际土壤中指示物种分析第89-93页
    4.3.5 重度污染土壤中接种M. loti HZ76对根际细菌群落的影响(基于宏基因组测序)第93-100页
    4.3.6 重度污染土壤中接种HZ76对根际细菌功能的影响第100-104页
    4.3.7 重度污染土壤中细菌群落和功能基因之间的关系第104-114页
  4.4 讨论第114-117页
第五章 重金属污染土壤修复过程中刺槐根和根瘤内微生物群落的研究第117-139页
  5.1 引言第117页
  5.2 材料与方法第117-118页
    5.2.1 温室试验第117页
    5.2.2 样品采集第117-118页
    5.2.3 DNA提取第118页
    5.2.4 PCR、16S rRNA基因V4-V5区测序及生物信息学分析第118页
    5.2.5 数据统计分析第118页
  5.3 结果与分析第118-135页
    5.3.1 测序结果和物种分类第118-123页
    5.3.2 刺槐根、根瘤和根际土的细菌群落结构差异分析第123-128页
    5.3.3 不同根际部位显著富集的OTU比较第128-131页
    5.3.4 根和根瘤从根际土中对特异物种平行选择的过程第131-133页
    5.3.5 根和根瘤中细菌群落潜在的代谢特征分析第133-135页
  5.4 讨论第135-139页
    5.4.1 重金污染土壤中刺槐不同部位细菌群落的变化第135-136页
    5.4.2 根和根瘤中微生物的选择过程第136-137页
    5.4.3 根和根瘤中细菌群落的潜在代谢特征变化第137-139页
第六章 总结第139-141页
  6.1 结论第139页
    6.1.1 铅锌矿区重金属污染土壤中微生物多样性及群落结构的研究第139页
    6.1.2 铅锌矿区刺槐根瘤中具有重金属抗性及促生特性内生细菌的分离鉴定第139页
    6.1.3 重金属污染土壤修复过程中根际土壤微生物群落多样性和功能的研究第139页
    6.1.4 重金属污染土壤修复过程中刺槐根和根瘤内微生物群落的研究第139页
  6.2 创新点第139-140页
  6.3 研究展望第140-141页
参考文献第141-169页
附录第169-174页
缩略词第174-175页
致谢第175-177页
作者简介第177-178页
发表及待发表的相关学术论文第178页

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