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分子动力学模拟研究基于环糊精的超分子识别机理
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分子动力学模拟研究基于环糊精的超分子识别机理
论文目录
 
摘要第1-8页
ABSTRACT第8-22页
第一章 绪论第22-46页
　　1.1 超分子化学概述第22-27页
　　　　1.1.1 超分子化学的历史第22-23页
　　　　1.1.2 超分子化学的观点理念第23-24页
　　　　1.1.3 超分子化学的构建模块第24-25页
　　　　1.1.4 超分子化学的应用第25-26页
　　　　1.1.5 常见的的超分子体系第26-27页
　　1.2 基于环糊精的分子识别第27-36页
　　　　1.2.1 环糊精的发展历史第28页
　　　　1.2.2 环糊精的结构特性第28-33页
　　　　1.2.3 环糊精超分子识别机理第33-35页
　　　　1.2.4 环糊精体系的研究方法第35-36页
　　1.3 黄酮类天然产物第36-39页
　　　　1.3.1 来源和分类第36-37页
　　　　1.3.2 药用价值第37页
　　　　1.3.3 葛根黄酮概述第37-38页
　　　　1.3.4 环糊精在葛根黄酮分离中的应用第38-39页
　　1.4 分子动力学方法第39-44页
　　　　1.4.1 分子动力学简介第39页
　　　　1.4.2 积分运动方程第39-41页
　　　　1.4.3 分子力学第41-43页
　　　　1.4.4 常用的分子动力学软件第43-44页
　　1.5 论文思路和研究内容第44-46页
第二章 环糊精与葛根黄酮超分子复合物的形成过程及介质和醋酸对复合物稳定性的影响第46-72页
　　2.1 引言第46-49页
　　2.2 方法第49-51页
　　　　2.2.1 分子对接第49页
　　　　2.2.2 动力学模拟参数设置第49-50页
　　　　2.2.3 醋酸浓度的处理第50-51页
　　2.3 结果与讨论第51-70页
　　　　2.3.1 分子对接预测键合模式第51-53页
　　　　2.3.2 水溶液中主客体包合物的形成过程第53-55页
　　　　2.3.3 主客体间的构象诱导效应第55-58页
　　　　2.3.4 介质和醋酸溶剂对主客体构象诱导效应的影响第58-61页
　　　　2.3.5 客体在环糊精空腔内的穿梭行为第61-69页
　　　　2.3.6 色谱分离葛根素和大豆苷的机理解释第69-70页
　　2.4 小结第70-72页
第三章 色谱实验结合动力学计算研究短链醇作为流动相添加剂对环糊精配基分离葛根黄酮的影响第72-92页
　　3.1 引言第72-74页
　　3.2 方法第74-78页
　　　　3.2.1 模拟参数设置第74-75页
　　　　3.2.2 环糊精力场参数验证第75-77页
　　　　3.2.3 溶剂体系的平衡第77-78页
　　　　3.2.4 色谱实验第78页
　　3.3 结果与讨论第78-90页
　　　　3.3.1 游离β-CD的构象变化第78-81页
　　　　3.3.2 醇分子在β-CD空腔的停留第81-83页
　　　　3.3.3 溶剂分布第83-85页
　　　　3.3.4 主客体构象诱导效应第85-88页
　　　　3.3.5 葛根黄酮的色谱保留和机理解释第88-90页
　　3.4 小结第90-92页
第四章 有机溶剂中环糊精二聚体的形成与解离第92-120页
　　4.1 引言第92-95页
　　4.2 方法第95-102页
　　　　4.2.1 结构模型第95-96页
　　　　4.2.2 模拟参数设置第96-97页
　　　　4.2.3 力场参数验证第97-100页
　　　　4.2.4 常规动力学模拟第100页
　　　　4.2.5 伞状取样动力学模拟第100-102页
　　4.3 结果第102-111页
　　　　4.3.1 单体第102-107页
　　　　4.3.2 无客体分子的二聚体第107-109页
　　　　4.3.3 有客体分子的二聚体第109-110页
　　　　4.3.4 二聚体的结合能与溶剂性质的关系第110-111页
　　4.4 讨论第111-118页
　　4.5 小结第118-120页
第五章 溶剂化对主客体复合物稳定性的贡献及其量化分析第120-144页
　　5.1 引言第120-122页
　　5.2 方法第122-126页
　　　　5.2.1 模拟参数设置第122-124页
　　　　5.2.2 热力学参数的计算第124-126页
　　5.3 结果第126-138页
　　　　5.3.1 复合物键合模式第126-129页
　　　　5.3.2 体系热力学参数第129-131页
　　　　5.3.3 焓拆分第131-134页
　　　　5.3.4 熵拆分第134-136页
　　　　5.3.5 客体旋转第136-138页
　　5.4 讨论第138-141页
　　5.5 小结第141-144页
第六章 环糊精二聚体对黄酮类药物分子的协同键合效应第144-162页
　　6.1 引言第144-146页
　　6.2 模拟方法和参数设置第146-147页
　　6.3 结果第147-157页
　　　　6.3.1 键合模式第147-149页
　　　　6.3.2 键合热力学参数第149-150页
　　　　6.3.3 自由能拆分第150-154页
　　　　6.3.4 氢键作用分析第154-155页
　　　　6.3.5 聚体与单体的比较第155-157页
　　6.4 讨论第157-160页
　　6.5 小结第160-162页
第七章 结论第162-166页
　　7.1 结论第162-164页
　　7.2 创新点第164-166页
问题与建议第166-168页
参考文献第168-190页
致谢第190-192页
研究成果及发表的学术论文第192-194页
作者及导师简介第194-196页
附件第196-197页

本篇论文共197页，点击这进入下载页面。
 
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