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分子动力学模拟研究基于环糊精的超分子识别机理
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分子动力学模拟研究基于环糊精的超分子识别机理
论文目录
摘要
第1-8页
ABSTRACT
第8-22页
第一章 绪论
第22-46页
1.1 超分子化学概述
第22-27页
1.1.1 超分子化学的历史
第22-23页
1.1.2 超分子化学的观点理念
第23-24页
1.1.3 超分子化学的构建模块
第24-25页
1.1.4 超分子化学的应用
第25-26页
1.1.5 常见的的超分子体系
第26-27页
1.2 基于环糊精的分子识别
第27-36页
1.2.1 环糊精的发展历史
第28页
1.2.2 环糊精的结构特性
第28-33页
1.2.3 环糊精超分子识别机理
第33-35页
1.2.4 环糊精体系的研究方法
第35-36页
1.3 黄酮类天然产物
第36-39页
1.3.1 来源和分类
第36-37页
1.3.2 药用价值
第37页
1.3.3 葛根黄酮概述
第37-38页
1.3.4 环糊精在葛根黄酮分离中的应用
第38-39页
1.4 分子动力学方法
第39-44页
1.4.1 分子动力学简介
第39页
1.4.2 积分运动方程
第39-41页
1.4.3 分子力学
第41-43页
1.4.4 常用的分子动力学软件
第43-44页
1.5 论文思路和研究内容
第44-46页
第二章 环糊精与葛根黄酮超分子复合物的形成过程及介质和醋酸对复合物稳定性的影响
第46-72页
2.1 引言
第46-49页
2.2 方法
第49-51页
2.2.1 分子对接
第49页
2.2.2 动力学模拟参数设置
第49-50页
2.2.3 醋酸浓度的处理
第50-51页
2.3 结果与讨论
第51-70页
2.3.1 分子对接预测键合模式
第51-53页
2.3.2 水溶液中主客体包合物的形成过程
第53-55页
2.3.3 主客体间的构象诱导效应
第55-58页
2.3.4 介质和醋酸溶剂对主客体构象诱导效应的影响
第58-61页
2.3.5 客体在环糊精空腔内的穿梭行为
第61-69页
2.3.6 色谱分离葛根素和大豆苷的机理解释
第69-70页
2.4 小结
第70-72页
第三章 色谱实验结合动力学计算研究短链醇作为流动相添加剂对环糊精配基分离葛根黄酮的影响
第72-92页
3.1 引言
第72-74页
3.2 方法
第74-78页
3.2.1 模拟参数设置
第74-75页
3.2.2 环糊精力场参数验证
第75-77页
3.2.3 溶剂体系的平衡
第77-78页
3.2.4 色谱实验
第78页
3.3 结果与讨论
第78-90页
3.3.1 游离β-CD的构象变化
第78-81页
3.3.2 醇分子在β-CD空腔的停留
第81-83页
3.3.3 溶剂分布
第83-85页
3.3.4 主客体构象诱导效应
第85-88页
3.3.5 葛根黄酮的色谱保留和机理解释
第88-90页
3.4 小结
第90-92页
第四章 有机溶剂中环糊精二聚体的形成与解离
第92-120页
4.1 引言
第92-95页
4.2 方法
第95-102页
4.2.1 结构模型
第95-96页
4.2.2 模拟参数设置
第96-97页
4.2.3 力场参数验证
第97-100页
4.2.4 常规动力学模拟
第100页
4.2.5 伞状取样动力学模拟
第100-102页
4.3 结果
第102-111页
4.3.1 单体
第102-107页
4.3.2 无客体分子的二聚体
第107-109页
4.3.3 有客体分子的二聚体
第109-110页
4.3.4 二聚体的结合能与溶剂性质的关系
第110-111页
4.4 讨论
第111-118页
4.5 小结
第118-120页
第五章 溶剂化对主客体复合物稳定性的贡献及其量化分析
第120-144页
5.1 引言
第120-122页
5.2 方法
第122-126页
5.2.1 模拟参数设置
第122-124页
5.2.2 热力学参数的计算
第124-126页
5.3 结果
第126-138页
5.3.1 复合物键合模式
第126-129页
5.3.2 体系热力学参数
第129-131页
5.3.3 焓拆分
第131-134页
5.3.4 熵拆分
第134-136页
5.3.5 客体旋转
第136-138页
5.4 讨论
第138-141页
5.5 小结
第141-144页
第六章 环糊精二聚体对黄酮类药物分子的协同键合效应
第144-162页
6.1 引言
第144-146页
6.2 模拟方法和参数设置
第146-147页
6.3 结果
第147-157页
6.3.1 键合模式
第147-149页
6.3.2 键合热力学参数
第149-150页
6.3.3 自由能拆分
第150-154页
6.3.4 氢键作用分析
第154-155页
6.3.5 聚体与单体的比较
第155-157页
6.4 讨论
第157-160页
6.5 小结
第160-162页
第七章 结论
第162-166页
7.1 结论
第162-164页
7.2 创新点
第164-166页
问题与建议
第166-168页
参考文献
第168-190页
致谢
第190-192页
研究成果及发表的学术论文
第192-194页
作者及导师简介
第194-196页
附件
第196-197页
本篇论文共
197
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