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中国不同葡萄酒产区酒酒球菌MLST和PFGE分型及其抗逆基因表达研究

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中国不同葡萄酒产区酒酒球菌MLST和PFGE分型及其抗逆基因表达研究
论文目录
 
摘要第1-8页
ABSTRACT第8-15页
第一章 文献综述第15-29页
  1.1 葡萄酒中的乳酸菌第15-17页
    1.1.1 葡萄酒中乳酸菌的种类第15页
    1.1.2 酒球菌属的简介(凌代文 1999)第15-17页
  1.2 乳酸菌的分类研究方法第17-19页
    1.2.1 16S r RNA基因序列分析第17页
    1.2.2 多序列位点分型技术第17-19页
    1.2.3 脉冲场凝脉电泳第19页
  1.3 酒酒球菌胁迫适应性反应机制的研究进展第19-23页
    1.3.1 MLF与膜H+-F0F1-ATP酶第20-21页
    1.3.2 环境胁迫对酒酒球菌细胞膜组分的影响第21-22页
    1.3.3 胁迫蛋白的合成第22-23页
  1.4 基因表达的研究方法第23-24页
  1.5 立题意义与研究内容第24-29页
    1.5.1 立题意义第24-25页
    1.5.2 课题主要研究内容第25-27页
    1.5.3 技术路线第27-29页
第二章中国不同葡萄酒产区酒酒球菌的分离鉴定第29-39页
  2.1 材料与仪器第29-30页
    2.1.1 样品来源第29页
    2.1.2 培养基与培养条件第29页
    2.1.3 试验试剂第29-30页
    2.1.4 主要仪器设备第30页
  2.2 试验方法第30-33页
    2.2.1 样品采集第30页
    2.2.2 酒酒球菌的分离和纯化第30-31页
    2.2.3 酒酒球菌分离株的保存第31页
    2.2.4 酒酒球菌分离株的鉴定第31-33页
  2.3 结果与分析第33-36页
    2.3.1 酒酒球菌的分离结果第33-34页
      2.3.2. DNA的提取结果第34页
    2.3.3 16S r RNA基因的扩增结果第34页
    2.3.4 16S r RNA基因序列全部上传于Gen Bank数据库第34-35页
    2.3.5 16S r RNA基因同源性比较及系统发育树分析第35-36页
  2.4 讨论第36-37页
    2.4.1 PCR扩增的特异性第36-37页
    2.4.2 酒酒球菌的 16S r RNA分类鉴定第37页
  2.5 小结第37-39页
第三章中国不同葡萄酒产区酒酒球菌抗逆基因MLST分析第39-59页
  3.1 材料与仪器第39-40页
    3.1.1 供试菌株第39页
    3.1.2 培养基与培养条件第39页
    3.1.3 主要试剂第39-40页
    3.1.4 主要仪器设备第40页
    3.1.5 生物信息学分析软件第40页
  3.2 试验方法第40-44页
    3.2.1 MLST目的基因的选取第40-41页
    3.2.2 引物的设计与合成第41-42页
    3.2.3 菌株培养及总DNA提取第42页
    3.2.4 抗逆基因的PCR扩增第42-44页
    3.2.5 DNA测序第44页
    3.2.6 序列分析第44页
  3.3 结果与分析第44-56页
    3.3.1 MLST目的基因的扩增和测序结果第44-46页
    3.3.2 酒酒球菌等位基因的ST分型结果第46-48页
    3.3.3 等位基因的分析第48-52页
    3.3.4 ST型的e BURST分析第52-53页
    3.3.5 不同地区酒酒球菌分离株的亲缘关系分析第53-55页
    3.3.6 不同ST型的聚类分析结果第55-56页
  3.4 讨论第56-58页
    3.4.1 MLST分型抗逆基因片段特性第56-57页
    3.4.2 抗逆基因中检测出选择性压力第57页
    3.4.3 混合式进化途径第57-58页
  3.5 小结第58-59页
第四章酒酒球菌PFGE技术与MLST技术的比较及结合第59-75页
  4.1 材料与仪器第59-60页
    4.1.1 供试菌株第59页
    4.1.2 培养基与培养条件第59页
    4.1.3 主要试剂第59页
    4.1.4 主要仪器设备第59-60页
    4.1.5 生物信息分析软件第60页
  4.2 试验方法第60-64页
    4.2.1 主要试剂的配制第60页
    4.2.2 胶块的制备第60-61页
    4.2.3 细胞的裂解第61页
    4.2.4 洗胶块第61页
    4.2.5 酶切第61-62页
    4.2.6 加样第62-63页
    4.2.7 电泳第63页
    4.2.8 图像的获取第63页
    4.2.9 数据分析第63-64页
  4.3 结果与分析第64-69页
    4.3.1 PFGE分型第64-65页
    4.3.2 PFGE分型和菌株的分布第65-66页
    4.3.3 PFGE和MLST分型结果的组合第66-68页
    4.3.4 PFGE和MLST分型技术比较第68-69页
  4.4 讨论第69-72页
    4.4.1 不同分型方式都形成了两个系统发育组第69-70页
    4.4.2 PFGE分型技术展示出的酒酒球菌东、西部产区差异第70-71页
    4.4.3 PFGE-MLST结合技术的优越性第71-72页
  4.5 小结第72-75页
第五章不同基因型酒酒球菌酿酒适应性的相关研究第75-85页
  5.1 材料与仪器第75-76页
    5.1.1 供试菌株第75页
    5.1.2 培养基与培养条件第75页
    5.1.3 主要试剂第75页
    5.1.4 主要仪器设备第75-76页
  5.2 试验方法第76-77页
    5.2.1 酒酒球菌菌液浊度与菌密度的测定第76页
    5.2.2 酒酒球菌对p H和酒精的抗性实验第76-77页
    5.2.3 苹果酸-乳酸酶活力的测定第77页
    5.2.4 氨基酸测定(陈毓荃 1997)第77页
  5.3 结果与分析第77-82页
    5.3.1 酒酒球菌菌密度与OD位的关系第77-78页
    5.3.2 p H和酒精对酒酒球菌生长的影晌第78-80页
    5.3.3 酒酒球菌对p H和酒精复合因子的抗性第80-81页
    5.3.4 不同菌株间苹果酸-乳酸酶活力比较第81页
    5.3.5 优选菌株的氨基酸代谢研究第81-82页
  5.4 讨论第82-83页
    5.4.1 菌株的不同酿酒适应性第82页
    5.4.2 影响酒酒球菌苹果酸-乳酸酶代谢活力的因素第82-83页
    5.4.3 酒酒球菌中含氮化合物的代谢第83页
  5.5 小结第83-85页
第六章 MLF过程中酒酒球菌不同抗逆基因表达水平研究第85-105页
  6.1 材料与仪器第85-86页
    6.1.1 供试菌株第85页
    6.1.2 模拟酒培养基与培养条件第85页
    6.1.3 主要试剂第85-86页
    6.1.4 主要仪器设备第86页
  6.2 试验方法第86-89页
    6.2.1 关键酶基因及管家基因的确定第86-87页
    6.2.2 实时荧光定量PCR引物设计与合成第87页
    6.2.3 RNA的提取第87-88页
    6.2.4 反转录合成c DNA第88页
    6.2.5 实时荧光定量PCR第88页
    6.2.6 实时荧光定量PCR数据处理分析第88-89页
    6.2.7 抗逆基因在菌株不同MLF阶段的表达测定第89页
    6.2.8 苹果酸和柠檬酸含量的测定第89页
  6.3 结果与分析第89-100页
    6.3.1 RNA的数量和质量第89-90页
    6.3.2 实时荧光定量PCR结果第90-92页
    6.3.3 不同生长阶段关键酶基因的表达情况分析第92-100页
  6.4 讨论第100-103页
    6.4.1 MLF过程中mle A和cit E基因的变化第101-102页
    6.4.2 MLF过程中胁迫应答相关基因的变化第102-103页
  6.5 小结第103-105页
第七章结论、创新与展望第105-107页
  7.1 主要结论第105页
  7.2 创新点第105-106页
  7.3 展望第106-107页
参考文献第107-117页
致谢第117-119页
作者简介第119页

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