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代谢工程改造酿酒酵母生物合成类胡萝卜素的研究

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代谢工程改造酿酒酵母生物合成类胡萝卜素的研究
论文目录
 
致谢第1-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
缩写词表第11-15页
第一章 绪论第15-39页
  1.1 引言第15-18页
  1.2 类胡萝卜素的应用及市场第18-22页
    1.2.1 类胡萝卜素简介第18-19页
    1.2.2 类胡萝卜素的用途第19-21页
    1.2.3 类胡萝卜素的市场价值第21-22页
  1.3 类胡萝卜素的合成第22-32页
    1.3.1 类胡萝卜素的化学法合成第22-23页
    1.3.2 类胡萝卜素的生物合成途径第23-25页
    1.3.3 生物法合成类胡萝卜素研究进展第25-27页
    1.3.4 类胡萝卜素在异源宿主中的合成第27-32页
  1.4 酶分子定向进化在类胡萝卜素生物合成中的应用第32-34页
    1.4.1 定向进化用于新类胡萝卜素分子的合成第32-34页
    1.4.2 定向进化在提高类胡萝卜素产量上的应用第34页
  1.5 酿酒酵母中外源代谢途径的组装和表达调控第34-37页
    1.5.1 基于附着型载体的方法第34-35页
    1.5.2 基于YIP整合型载体的方法第35页
    1.5.3 基于PCR的多片段组装技术第35-36页
    1.5.4 外源生物合成途径的基因表达调控第36-37页
  1.6 本课题研究的内容及意义第37-39页
第二章 β-胡萝卜素生物合成途径基因的克隆与表达第39-49页
  2.1 前言第39-40页
  2.2 实验材料与方法第40-42页
    2.2.1 仪器设备第40-41页
    2.2.2 生物材料第41页
    2.2.3 生化试剂和药品第41页
    2.2.4 试剂和培养基配方第41-42页
  2.3 实验方法第42-45页
    2.3.1 质粒抽提、酶切、连接等分子生物学操作第42-43页
    2.3.2 酿酒酵母电转化感受态细胞的制备及转化第43-44页
    2.3.3 红法夫酵母RNA的抽提与胡萝卜素基因的克隆第44-45页
    2.3.4 酿酒酵母类胡萝卜素的抽提及HPLC分析第45页
  2.4 实验结果与讨论第45-48页
    2.4.1 β-胡萝卜素合成基因的克隆第45-46页
    2.4.2 β-胡萝卜素合成途径在2μ质粒上的构建第46-48页
  2.4 本章小结第48-49页
第三章 酿酒酵母代谢途径组装新载体工具的构建第49-60页
  3.1 前言第49-50页
  3.2 实验材料与方法第50-52页
    3.2.1 生物材料第50页
    3.2.2 生化试剂及培养基第50-52页
  3.3 实验方法第52-54页
    3.3.1 常规分子生物学操作第52页
    3.3.2 CPEC法构建质粒第52-54页
    3.3.3 pMRI载体的使用及marker循环利用测试第54页
  3.4 实验结果与讨论第54-58页
    3.4.1 pMRI基本载体骨架的构建第54页
    3.4.2 pMRI表达载体的构建第54-57页
    3.4.3 pMRI质粒的使用第57页
    3.4.4 loxP-KanMX-pBR32ori-loxP的循环利用测试第57-58页
  3.5 本章小结第58-60页
第四章 利用分散式组装策略构建可控性β-胡萝卜素生物合成途径第60-75页
  4.1 引言第60-61页
  4.2 仪器设备、试剂、药品和引物第61页
  4.3 实验方法第61-65页
    4.3.1 β-胡萝卜素、番茄红素标准曲线制作第61-62页
    4.3.2 HPLC分析条件第62-63页
    4.3.3 培养基中葡萄糖浓度的测定第63页
    4.3.4 表达载体的构建和代谢途径的组装第63-64页
    4.3.5 GAL80基因的敲除第64页
    4.3.6 菌株的基因型检测第64页
    4.3.7 菌株的摇瓶发酵第64页
    4.3.9 菌株的遗传稳定性分析第64-65页
  4.4 实验结果与讨论第65-74页
    4.4.1 类胡萝卜素标准曲线的建立第65-66页
    4.4.2 功能模块和菌株的构建第66-67页
    4.4.3 半乳糖诱导类胡萝卜素的生物合成第67-69页
    4.4.4 葡萄糖控制型β-胡萝卜合成途径的构建第69-73页
    4.4.5 菌株的遗传稳定性分析第73-74页
  4.5 本章小结第74-75页
第五章 利用顺序控制策略提高酿酒酵母中类胡萝卜素的产量第75-100页
  5.1 引言第75-77页
  5.2 实验仪器材料与试剂第77-80页
  5.3 实验方法第80-84页
    5.3.1 角鲨烯和FOH标准曲线制作第80页
    5.3.2 发酵液中角鲨烯和FOH的抽提第80页
    5.3.3 乙醇标准曲线制作及样品中乙醇含量分析第80-81页
    5.3.4 载体及菌株的构建第81-83页
    5.3.5 实时荧光定量PCR和半定量PCR检测基因的表达变化第83页
    5.3.6 酿酒酵母的高密度发酵第83-84页
  5.4 实验结果与讨论第84-99页
    5.4.1 角鲨烯、FOH、乙醇标准曲线第84-85页
    5.4.2 启动子强度的比较第85-88页
    5.4.3 利用P_(BTSI)下调ERG9基因的表达第88-91页
    5.4.4 构建β-胡萝卜素和角鲨烯合成途径的顺序控制系统第91-93页
    5.4.5 优化顺序控制策略进一步提高类胡萝卜素产量第93-96页
    5.4.6 YXWP-101(+)的高密度发酵第96-99页
  5.5 本章小结第99-100页
第六章 结合蛋白质工程与代谢工程提高酿酒酵母中番茄红素的产量第100-129页
  6.1 引言第100-101页
  6.2 实验材料第101-105页
    6.2.1 菌株质粒及其它生物材料第101-103页
    6.2.2 仪器、试剂、药品和引物第103-105页
  6.3 实验方法第105-111页
    6.3.1 分子生物学操作第105页
    6.3.2 生物信息学分析第105-106页
    6.3.3 酿酒酵母的培养和产物分析第106页
    6.3.4 番茄红素合成途径中关键酶的选择和改造原理第106-107页
    6.3.5 酿酒酵母代谢途径中关键酶定向进化的基本流程第107-108页
    6.3.6 pUMRI载体及菌株的构建第108-111页
  6.4 实验结果与讨论第111-128页
    6.4.1 不同来源八氢番茄红素基因对酿酒酵母产番茄红素的影响第111-114页
    6.4.2 CrtYB的定向进化第114-120页
    6.4.3 整合型番茄红素合成途径的组装第120-122页
    6.4.4 CrtE的定向进化第122-124页
    6.4.5 CrtI的定向进化第124页
    6.4.6 不同拷贝数Crt基因对番茄红素产量的影响第124-125页
    6.4.7 番茄红素的高密度发酵生产第125-128页
  6.5 本章小结第128-129页
第七章 结论与展望第129-132页
  7.1 结论第129-130页
  7.2 展望第130-132页
参考文献第132-145页
作者简历第145页

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