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基因组选择方法的比较与多变量GBLUP模型研究

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基因组选择方法的比较与多变量GBLUP模型研究
论文目录
 
中文摘要第1-8页
Abstract第8-12页
缩略语表第12-14页
第1章 文献综述第14-26页
  1.1 基因组选择研究背景第14-15页
  1.2 分子标记第15页
  1.3 基因效应与方差第15-18页
  1.4 基因组选择研究进展第18-26页
    1.4.1 基因组选择的基本方法第18-21页
    1.4.2 一步法第21-22页
    1.4.3 基因组选择中的非加性效应第22页
    1.4.4 多变量基因组选择方法第22-24页
    1.4.5 影响基因组选择准确性的主要因素第24-26页
第2章 基因组选择方法的比较研究第26-41页
  2.0 前言第27-28页
  2.1 材料和方法第28-30页
    2.1.1 数据第28页
    2.1.2 统计方法第28-29页
    2.1.3 模拟第29页
    2.1.4 研究设计第29-30页
  2.2 结果与分析第30-35页
    2.2.1 不同数目QTL下的预测精度和预测能力对比第30-33页
    2.2.2 不同遗传率下6种方法预测精度和预测能力的对比第33-34页
    2.2.3 不同方法预测小麦产量的结果对比第34-35页
  2.3 讨论第35-41页
    2.3.1 遗传率对预测精度和预测能力的影响第35-36页
    2.3.2 QTL数目对预测精度和预测能力的影响第36-38页
    2.3.3 训练集大小对预测的影响第38-39页
    2.3.4 RR-BLUP和GBLUP的关系第39-40页
    2.3.5 影响预测的其它因素第40-41页
第3章 基于GBLUP模型的NCII设计水稻杂交种表型预测研究第41-62页
  3.0 前言第42-44页
  3.1 材科与方法第44-49页
    3.1.1 材料收集第44-45页
    3.1.2 方法第45-48页
    3.1.3 技术路线第48-49页
  3.2 结果与分析第49-59页
    3.2.1 杂交种表型预测结果第49-53页
    3.2.2 配合力预测结果第53页
    3.2.3 水稻潜在杂交群体表型预测结果第53-54页
    3.2.4 基于R语言的软件包开发第54-56页
    3.2.5 Java程序的开发第56-59页
  3.3 讨论第59-62页
    3.3.1 显性方差对预测的贡献第59-60页
    3.3.2 标记密度对预测的影响第60页
    3.3.3 NCII训练集的价值与标记的匹配第60-62页
第4章 多变量GBLUP模型研究第62-73页
  4.0 前言第63页
  4.1 材料与方法第63-65页
    4.1.1 数据第63页
    4.1.2 预测方法第63-65页
    4.1.3 交叉验证第65页
  4.2 结果与分析第65-70页
    4.2.1 多性状预测结果第65-69页
    4.2.2 多环境预测结果第69-70页
  4.3 讨论第70-73页
    4.3.1 多变量模型对多性状预测的影响第70-71页
    4.3.2 多变量模型对多环境预测的影响第71-73页
第5章 基于选择指数的基因组选择方法研究第73-89页
  5.0 前言第74-75页
  5.1 数据与方法第75-78页
    5.1.1 数据第75页
    5.1.2 方法第75-77页
    5.1.3 模拟设计第77-78页
  5.2 结果与分析第78-85页
    5.2.1 目标性状选择指数的构建第78-81页
    5.2.2 选择指数直接预测目标性状第81-82页
    5.2.3 选择指数辅助预测目标性状第82-85页
  5.3 讨论第85-89页
参考文献第89-96页
致谢第96-98页
附表第98-108页
攻读博士学位期间发表的研究论文第108-109页

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