论文目录 | |
摘要 | 第1-8页 |
ABSTRACT | 第8-14页 |
LIST OF APPENDIXES | 第14-15页 |
ABBREVIATIONS | 第15-17页 |
CHAPTER 1 INTRODUCTION | 第17-45页 |
· INTRODUCTION OF COTTON | 第17-21页 |
· GENERAL DESCRIPTION | 第17-18页 |
· COTTON USAGE AND CONSUMPTION | 第18-19页 |
· TAXONOMY AND GENOMIC EVOLUTION | 第19-20页 |
· GEOGRAPHIC ORIGIN AND DISTRIBUTION | 第20-21页 |
· COTTON FIBER DEVELOPMENT AND FEATURES | 第21-24页 |
· FIBER DEVELOPMENT | 第21-22页 |
· Initiation | 第21-22页 |
· Elongation or primary cell wall formation | 第22页 |
· Secondary cell wall deposition (SCW) | 第22页 |
· Maturation / dehydration | 第22页 |
· FIBER FEATURE AND CHARACTERISTICS | 第22-24页 |
· Fiber Elongation (FE) | 第22页 |
· Fiber Length (FL) or Upper half means length | 第22-23页 |
· Fiber Micronaire (FM) | 第23页 |
· Fiber Strength (FS) | 第23页 |
· Fiber Uniformity (FU) | 第23-24页 |
· QTL MAPPING | 第24-34页 |
· MARKERS | 第24-30页 |
· Morphological marker | 第25页 |
· Biochemical markers | 第25页 |
· DNA based markers | 第25-30页 |
· Hybridization based markers | 第25-26页 |
· Polymerase chain reaction (PCR) based markers | 第26-29页 |
· Random amplified polymorphic DNA (RAPD) | 第27-28页 |
· Amplified fragment length polymorphism (AFLP) | 第28页 |
· Simple sequence repeats (SSR) | 第28-29页 |
· DNA sequence based markers | 第29-30页 |
· MAPPING POPULATION | 第30-32页 |
· Second Filial (F2) population: | 第31-32页 |
· Backcross population (BC) | 第32页 |
· Recombinant inbred lines (RIL) | 第32页 |
· STATISTICAL METHODS FOR QTL MAPPING | 第32-34页 |
· Single Marker Analysis | 第32-33页 |
· Simple Interval mapping | 第33页 |
· Composite Interval Mapping | 第33页 |
· Multiple interval mapping | 第33-34页 |
· QTL MAPPING IN COTTON (REVIEW OF LITERATURE) | 第34-42页 |
· META QTL ANALYSIS IN COTTON | 第42-44页 |
OBJECTIVE OF STUDY | 第44-45页 |
CHAPTER 2 MATERIALS AND METHODS | 第45-57页 |
· MAPPING POPULATION | 第45-46页 |
· TRAIT EXAMINATION OR PHENOTYPING | 第46-47页 |
· GENOTYPING | 第47-48页 |
· DNA EXTRACTION | 第47-48页 |
· DNA extraction buffer | 第47-48页 |
· DNA Quantification | 第48页 |
· POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) ANALYSIS | 第48-51页 |
· POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS (PAGE) | 第50-51页 |
· Reagents for PAGE | 第50页 |
· Polyacrylamide gel preparation | 第50-51页 |
· Loading Sample on PAGE | 第51页 |
· Silver Staining | 第51页 |
· SSR PRIMER PAIRS ANALYSES | 第51-54页 |
· PRIMERS DETAILS | 第51-52页 |
· PARENTAL SCREENING | 第52-53页 |
· POPULATION SCREENING | 第53页 |
· SCORING SSR PRIMERS | 第53-54页 |
· CONSTRUCTION OF GENETIC MAP | 第54-55页 |
· PREPARING DATA FOR JOIN MAP | 第54页 |
· LINKAGE MAP CONSTRUCTION BY JOIN MAP 4.0 | 第54-55页 |
· Construction of high density genetic map | 第54-55页 |
· QTL ANALYSES | 第55-57页 |
· META QTL-ANALYSIS BASED ON HIGH DENSITY GENETIC MAP | 第55-56页 |
· QTLS AND CLUSTERS NOMENCLATURE | 第56-57页 |
CHAPTER 3 RESULTS | 第57-124页 |
· PHENOTYPIC DATA ANALYSIS | 第57-61页 |
· GENOTYPING | 第61-62页 |
· GENETIC MAP CONSTRUCTION | 第61-62页 |
· SEGREGATION DISTORTION OF SSR MARKERS | 第62页 |
· QTL MAPPING OF FIBER QUALITY TRAITS | 第62-90页 |
· FIBER LENGTH | 第70-74页 |
· FIBER STRENGTH | 第74-78页 |
· FIBER ELONGATION | 第78-82页 |
· FIBER UNIFORMITY | 第82-85页 |
· FIBER MICRONAIRE | 第85-89页 |
· QTL CLUSTERS | 第89-90页 |
· META QTL ANALYSIS OF FIBER QUALITY TRAITS | 第90-124页 |
· CONSTRUCTION OF HIGH DENSITY LINKAGE MAP | 第91-92页 |
· Collinearity with Physical map | 第91-92页 |
· SEGREGATION DISTORTION OF SSR MARKERS | 第92-100页 |
· QTL MAPPING OF FIBER QUALITY TRAITS | 第100-118页 |
· Fiber length | 第100-104页 |
· Fiber Strength | 第104-108页 |
· Fiber Elongation | 第108-111页 |
· Fiber Uniformity | 第111-114页 |
· Fiber Micronaire | 第114-118页 |
· QTL CLUSTERS AND META-ANALYSIS | 第118-124页 |
CHAPTER 4 DISCUSSION | 第124-134页 |
· PHENOTYPIC PERFORMANCE | 第124页 |
· GENETIC LINKAGE MAP CONSTRUCTION | 第124-126页 |
· GENETIC MAP USED FOR META-ANALYSIS | 第126页 |
· SEGREGATION DISTORTION OF SSR MARKERS | 第126-129页 |
· CONGRUENCE OF QTLS WITH PREVIOUS REPORTS | 第129-131页 |
· FIBER LENGTH | 第129页 |
· FIBER STRENGTH | 第129-130页 |
· FIBER MICRONAIRE | 第130页 |
· FIBER ELONGATION | 第130页 |
· FIBER UNIFORMITY | 第130-131页 |
· STABLE QTLS AND CLUSTER | 第131页 |
· DISTRIBUTION OF QTLS AMONG AT AND DT SUB-GENOMES | 第131-132页 |
· META-ANALYSIS SHOWS CLUSTERING | 第132-134页 |
CONCLUSION | 第134-136页 |
REFERENCES (参考文献) | 第136-150页 |
ACKNOWLEDGEMENTS (致谢) | 第150-151页 |
CURRICULUM VITAE (作者简历) | 第151-153页 |
APPENDIX | 第153-166页 |