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基于籼稻全基因组剖析抗性基因的结构及其分布特点

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基于籼稻全基因组剖析抗性基因的结构及其分布特点
论文目录
 
中文摘要第1-11 页
英文摘要第11-14 页
第1章 植物抗性基因的结构、功能与进化第14-38 页
  · 植物抗病的分子机制第15 页
  · 植物抗病基因的分离克隆第15-17 页
    · 转座子标签法第15-16 页
    · 图位克隆法第16 页
    · 同源序列候选基因法第16-17 页
  · 植物抗性基因的结构和分类第17-22 页
    · R蛋白的基本结构第17-18 页
    · R蛋白的分类第18-22 页
      · NBS-LRR类蛋白第20 页
      · 胞外LRR-TM类蛋白第20-21 页
      · 跨膜受体激酶类(LRR-TM-STK)蛋白第21-22 页
      · 丝氨酸-苏氨酸激酶类(STK)蛋白第22 页
      · 其它第22 页
  · 植物抗性基因的功能和作用机制第22-24 页
    · R蛋白的信号传导第23-24 页
    · R蛋白的识别第24 页
  · 抗性基因的进化机制第24-28 页
    · 抗性基因在基因组中的分布第24-25 页
    · 抗性基因的复制和重组第25-27 页
    · 病原识别位点的适应性进化第27 页
    · 转座子与R基因第27-28 页
  · 展望第28-29 页
  参考文献第29-38 页
第2章 NBS-LRR基因家族的结构和系统分析第38-53 页
  · NBS-LRR基因的结构及功能第38-41 页
    · NBS domain第39 页
    · CC motif第39 页
    · TIR domain第39-41 页
    · LRR domain第41 页
  · NBS-LRR基因在基因组中的分布第41-42 页
  · NBS-LRR基因复制和重排第42-43 页
  · NBS-LRR基因的进化第43-45 页
    · 保守线性模式和快速重排模式第43-44 页
    · 基因组系统进化第44-45 页
    · LRR domain的适应性选择第45 页
  · 结论第45-47 页
  参考文献第47-53 页
第3章 水稻全基因组NBS-LRR编码基因分析第53-82 页
  · 材料和方法第54-57 页
    · 数据库和基因序列来源第54-55 页
    · NBS-LRR基因同源基因的获得第55 页
    · 序列结构分析第55 页
    · 序列联配和系统进化分析第55-57 页
  · 结果与分析第57-71 页
    · 水稻NBS-LRR基因结构多样性第57-64 页
      · NBS-LRR基因N端序列分析第57-62 页
      · NBS区域序列分析第62-64 页
      · LRR和C末端区域分析第64 页
    · NBS-LRR基因的特殊结构第64-67 页
    · NBS domain区域内含子的位置第67 页
    · 水稻NBS-LRR基因系统分析第67-71 页
    · 水稻NBS-LRR基因在基因组中的分布第71 页
  · 讨论第71-75 页
  参考文献第75-82 页
第4章 水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族同义密码子使用偏好的比较第82-98 页
  · 材料和方法第83-84 页
    · 试验数据的获得第83 页
    · 分析方法第83-84 页
      · 因子相应性分析第83-84 页
      · 密码子相对使用度的估算第84 页
      · 最优密码子的确定方法第84 页
  · 结果与分析第84-93 页
    · 水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族的碱基组成第84-90 页
    · 水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族密码子使用选择性分析第90-91 页
      · 最优密码子的确定第90 页
      · 密码子使用差异性分析第90-91 页
    · 影响最优密码子使用因素的分析第91-93 页
  · 讨论第93-95 页
  参考文献第95-98 页
第5章 籼稻全基因组非NBS-LRR抗性基因的结构及其分布特点第98-114 页
  · 材料和方法第98-99 页
  · 结果与分析第99-108 页
    · 非NBS-LRR抗性基因的数量及其分布第99 页
    · 非NBS-LRR抗性基因的保守序列第99-105 页
      · 胞外LRR-TM类基因第102 页
      · 跨膜受体激酶(LRR-TM-STK)类基因第102 页
      · 丝氨酸-苏氨酸激酶(STK)类基因第102-105 页
      · 其它类基因第105 页
    · 水稻抗性基因的分布第105-108 页
    · 水稻抗性基因系统分析第108 页
  · 讨论第108-110 页
  参考文献第110-114 页
附录A 表目录第114-115 页
附录B 图目录第115 页

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