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基于籼稻全基因组剖析抗性基因的结构及其分布特点
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基于籼稻全基因组剖析抗性基因的结构及其分布特点
论文目录
中文摘要
第1-11 页
英文摘要
第11-14 页
第1章 植物抗性基因的结构、功能与进化
第14-38 页
· 植物抗病的分子机制
第15 页
· 植物抗病基因的分离克隆
第15-17 页
· 转座子标签法
第15-16 页
· 图位克隆法
第16 页
· 同源序列候选基因法
第16-17 页
· 植物抗性基因的结构和分类
第17-22 页
· R蛋白的基本结构
第17-18 页
· R蛋白的分类
第18-22 页
· NBS-LRR类蛋白
第20 页
· 胞外LRR-TM类蛋白
第20-21 页
· 跨膜受体激酶类(LRR-TM-STK)蛋白
第21-22 页
· 丝氨酸-苏氨酸激酶类(STK)蛋白
第22 页
· 其它
第22 页
· 植物抗性基因的功能和作用机制
第22-24 页
· R蛋白的信号传导
第23-24 页
· R蛋白的识别
第24 页
· 抗性基因的进化机制
第24-28 页
· 抗性基因在基因组中的分布
第24-25 页
· 抗性基因的复制和重组
第25-27 页
· 病原识别位点的适应性进化
第27 页
· 转座子与R基因
第27-28 页
· 展望
第28-29 页
参考文献
第29-38 页
第2章 NBS-LRR基因家族的结构和系统分析
第38-53 页
· NBS-LRR基因的结构及功能
第38-41 页
· NBS domain
第39 页
· CC motif
第39 页
· TIR domain
第39-41 页
· LRR domain
第41 页
· NBS-LRR基因在基因组中的分布
第41-42 页
· NBS-LRR基因复制和重排
第42-43 页
· NBS-LRR基因的进化
第43-45 页
· 保守线性模式和快速重排模式
第43-44 页
· 基因组系统进化
第44-45 页
· LRR domain的适应性选择
第45 页
· 结论
第45-47 页
参考文献
第47-53 页
第3章 水稻全基因组NBS-LRR编码基因分析
第53-82 页
· 材料和方法
第54-57 页
· 数据库和基因序列来源
第54-55 页
· NBS-LRR基因同源基因的获得
第55 页
· 序列结构分析
第55 页
· 序列联配和系统进化分析
第55-57 页
· 结果与分析
第57-71 页
· 水稻NBS-LRR基因结构多样性
第57-64 页
· NBS-LRR基因N端序列分析
第57-62 页
· NBS区域序列分析
第62-64 页
· LRR和C末端区域分析
第64 页
· NBS-LRR基因的特殊结构
第64-67 页
· NBS domain区域内含子的位置
第67 页
· 水稻NBS-LRR基因系统分析
第67-71 页
· 水稻NBS-LRR基因在基因组中的分布
第71 页
· 讨论
第71-75 页
参考文献
第75-82 页
第4章 水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族同义密码子使用偏好的比较
第82-98 页
· 材料和方法
第83-84 页
· 试验数据的获得
第83 页
· 分析方法
第83-84 页
· 因子相应性分析
第83-84 页
· 密码子相对使用度的估算
第84 页
· 最优密码子的确定方法
第84 页
· 结果与分析
第84-93 页
· 水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族的碱基组成
第84-90 页
· 水稻和拟南芥NBS-LRR基因家族密码子使用选择性分析
第90-91 页
· 最优密码子的确定
第90 页
· 密码子使用差异性分析
第90-91 页
· 影响最优密码子使用因素的分析
第91-93 页
· 讨论
第93-95 页
参考文献
第95-98 页
第5章 籼稻全基因组非NBS-LRR抗性基因的结构及其分布特点
第98-114 页
· 材料和方法
第98-99 页
· 结果与分析
第99-108 页
· 非NBS-LRR抗性基因的数量及其分布
第99 页
· 非NBS-LRR抗性基因的保守序列
第99-105 页
· 胞外LRR-TM类基因
第102 页
· 跨膜受体激酶(LRR-TM-STK)类基因
第102 页
· 丝氨酸-苏氨酸激酶(STK)类基因
第102-105 页
· 其它类基因
第105 页
· 水稻抗性基因的分布
第105-108 页
· 水稻抗性基因系统分析
第108 页
· 讨论
第108-110 页
参考文献
第110-114 页
附录A 表目录
第114-115 页
附录B 图目录
第115 页
本篇论文共
115
页,
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