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玄参属系统发育和生物地理学分析及砾玄参复合种的亲缘地理学研究

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玄参属系统发育和生物地理学分析及砾玄参复合种的亲缘地理学研究
论文目录
 
摘要第1-11页
Abstract第11-18页
第一章 前言第18-44页
  1.1 玄参属植物研究背景第18-27页
    1.1.1 玄参属植物概况第18页
    1.1.2 玄参属植物研究历史及现状第18-27页
  1.2 分子系统学、生物地理学、亲缘地理学研究进展第27-42页
    1.2.1 分子系统学概述第27-32页
    1.2.2 生物地理学概述第32-34页
    1.2.3 亲缘地理学概述第34-40页
    1.2.4 东亚及青藏高原种子植物亲缘地理研究现状第40-42页
  1.3 玄参属研究存在的问题第42-43页
  1.4 本文研究内容及目的第43-44页
第二章 玄参属的系统发育重建和生物地理研究第44-82页
  2.1 材料和方法第45-61页
    2.1.1 分类单元材料来源第45-54页
      2.1.1.1 采集与取样第45-49页
      2.1.1.2 各主要物种的地理及生境信息第49-54页
    2.1.2 分子系统学方法第54-57页
    2.1.3 分化时间分析方法第57-58页
    2.1.4 祖先分布区重建方法第58-61页
  2.2 结果分析第61-72页
    2.2.1 序列信息第61-62页
    2.2.2 系统发育分析第62-69页
    2.2.3 分歧时间估计第69-72页
    2.2.4 祖先分布区重建第72页
  2.3 讨论第72-81页
    2.3.1 玄参属内形态学分组的系统学意义第72-73页
    2.3.2 玄参属的起源、迁移和物种分化历史第73-78页
    2.3.3 玄参属的生物地理分布格局第78-79页
    2.3.4 核ITS与cpDNA序列拓扑结构的不一致性第79-80页
    2.3.5 玄参属分类处理建议第80-81页
  2.4 小结第81-82页
第三章 砾玄参微卫星引物开发第82-94页
  3.1 材料和方法第83-90页
    3.1.1 材料第83页
    3.1.2 仪器、试剂及来源第83页
    3.1.3 DNA提取第83页
    3.1.4 微卫星富集文库构建、测序及引物设计第83-88页
      3.1.4.1 基因组DNA酶切第83-84页
      3.1.4.2 接头的制备及酶切产物的连接第84页
      3.1.4.3 连接产物抑制PCR扩增及产物切胶纯化第84-86页
      3.1.4.4 连接T载体、转化及测序第86-88页
    3.1.5 微卫星引物设计第88页
    3.1.6 PCR引物效率检测第88-89页
    3.1.7 微卫星位点的多态性检测第89-90页
  3.2 结果第90页
  3.3 数据分析及讨论第90-94页
第四章 环青藏高原地区砾玄参复合种的亲缘地理学研究第94-122页
  4.1 材料第95-96页
  4.2 方法第96-103页
    4.2.1 基因组总DNA的提取第96-97页
    4.2.2 引物筛选,PCR扩增及序列测定第97-98页
    4.2.3 群体遗传多样性及序列分析第98-99页
    4.2.4 cpDNA和ITS单倍型谱系关系分析第99-100页
    4.2.5 SSR群体遗传结构分析第100-101页
    4.2.6 基于cpDNA的历史生物地理学分析第101-103页
  4.3 结果分析第103-116页
    4.3.1 cpDNA序列的测序结果第103页
    4.3.2 基于cpDNA的单倍型谱系关系分析第103-108页
    4.3.3 基于cpDNA和SSR的群体遗传多样性第108-111页
    4.3.4 基于nrSSR标记的群体遗传结构分析第111-113页
    4.3.5 nrITS单倍型谱系关系第113页
    4.3.6 分子钟估算和祖先分布区重建第113-116页
  4.4 讨论第116-121页
    4.4.1 砾玄参复合种群体遗传结构与物种分化第117-118页
    4.4.2 砾玄参复合种由中亚传入青藏高原第118-119页
    4.4.3 地理隔离、冰期避难所和冰后期局部扩张第119-120页
    4.4.4 谱系分选不完全和杂交第120-121页
  4.5 总结第121-122页
第五章 总结与展望第122-125页
  5.1 总结第122-123页
  5.2 不足与展望第123-125页
参考文献第125-138页
附录第138-146页
在读期间的主要成果第146-148页
致谢第148-149页

本篇论文共149页,点击这进入下载页面
 
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