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画眉基因组BAC文库构建及防御素基因解析

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画眉基因组BAC文库构建及防御素基因解析
论文目录
 
致谢第1-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-15页
1 文献综述第15-38页
  1.1 画眉研究概况第15-23页
    1.1.1 画眉的生物学特征第15-17页
    1.1.2 噪鹛属分类学和起源的争论第17-18页
    1.1.3 亚种分化第18-20页
    1.1.4 基因渗透第20-21页
    1.1.5 声音研究第21-23页
  1.2 高通量测序背景下鸟类BAC文库的重要性第23-30页
    1.2.1 测序技术的发展第23-25页
    1.2.2 鸟类基因组的重要性、测序及不足第25-27页
    1.2.3 高效的反-4D文库第27-30页
  1.3 防御素基因研究概况第30-38页
    1.3.1 防御素基因分类、结构、功能第30-32页
    1.3.2 防御素的进化与组织表达第32-34页
    1.3.3 鸟类防御素的研究第34-38页
2 本论文的立项依据、目的和研究内容第38-40页
3 画眉Reverse-4D文库的构建第40-56页
  3.1 材料第40-41页
    3.1.1 样品来源第40页
    3.1.2 BAC载体和电转感受态细胞第40-41页
    3.1.3 主要仪器设备、试剂和耗材第41页
  3.2 方法和步骤第41-49页
    3.2.1 高分子量DNA的制备第41-47页
    3.2.2 DNA连接和转化第47-48页
    3.2.3 Reverse-4D BAC文库的超级库和亚库构建过程第48-49页
  3.3 BAC库的结果与讨论第49-56页
    3.3.1 结果第49-50页
    3.3.2 讨论第50-56页
4 画眉防御素物理图谱的构建第56-81页
  4.1 材料第56-57页
    4.1.1 材料来源第56页
    4.1.2 引物设计第56-57页
    4.1.3 主要仪器设备、试剂和耗材第57页
  4.2 方法和步骤第57-62页
    4.2.1 基因组DNA的提取第57-58页
    4.2.2 引物的验证第58-59页
    4.2.3 筛库和最小叠连群的构建第59-60页
    4.2.4 画眉防御素基因注释第60-61页
    4.2.5 画眉防御素基因的进化分析第61-62页
    4.2.6 鸟类防御素基因分化时间估计第62页
  4.3 结果与讨论第62-81页
    4.3.1 叠连群的构建第62-65页
    4.3.2 防御素基因系统发生分析和进化分析第65-68页
    4.3.3 物种间防御素基因结构比较第68-72页
    4.3.4 复制驱动力和复制时间估计第72-75页
    4.3.5 重复元件与复制机制第75-81页
5 画眉防御素基因的染色体定位第81-89页
  5.1 材料第81-82页
    5.1.1 材料来源第81页
    5.1.2 主要仪器设备第81页
    5.1.3 主要试剂及耗材第81-82页
  5.2 方法和步骤第82-85页
    5.2.1 探针质粒的提取第82-83页
    5.2.2 中期染色体的准备第83-84页
    5.2.3 标记探针第84页
    5.2.4 FISH杂交过程第84-85页
    5.2.5 FISH结果统计第85页
  5.3 结果和讨论第85-89页
    5.3.1 结果第85-87页
    5.3.2 讨论第87-89页
6 画眉防御素基因的表达分析第89-96页
  6.1 材料第89-90页
    6.1.1 样品来源第89页
    6.1.2 引物及其设计第89-90页
    6.1.3 主要仪器设备、试剂及耗材第90页
  6.2 方法和步骤第90-93页
    6.2.1 总RNA提取第90-91页
    6.2.2 cDNA的合成第91页
    6.2.3 PCR检测其表达情况第91-93页
  6.3 结果与讨论第93-96页
7 主要结论、创新点及展望第96-98页
  7.1 主要结论第96-97页
  7.2 创新点第97页
  7.3 展望第97-98页
8 附图第98-100页
9 参考文献第100-111页
10 攻读博士学位期间的科研成果第111页

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