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画眉基因组BAC文库构建及防御素基因解析
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画眉基因组BAC文库构建及防御素基因解析
论文目录
致谢
第1-7页
摘要
第7-9页
Abstract
第9-15页
1 文献综述
第15-38页
1.1 画眉研究概况
第15-23页
1.1.1 画眉的生物学特征
第15-17页
1.1.2 噪鹛属分类学和起源的争论
第17-18页
1.1.3 亚种分化
第18-20页
1.1.4 基因渗透
第20-21页
1.1.5 声音研究
第21-23页
1.2 高通量测序背景下鸟类BAC文库的重要性
第23-30页
1.2.1 测序技术的发展
第23-25页
1.2.2 鸟类基因组的重要性、测序及不足
第25-27页
1.2.3 高效的反-4D文库
第27-30页
1.3 防御素基因研究概况
第30-38页
1.3.1 防御素基因分类、结构、功能
第30-32页
1.3.2 防御素的进化与组织表达
第32-34页
1.3.3 鸟类防御素的研究
第34-38页
2 本论文的立项依据、目的和研究内容
第38-40页
3 画眉Reverse-4D文库的构建
第40-56页
3.1 材料
第40-41页
3.1.1 样品来源
第40页
3.1.2 BAC载体和电转感受态细胞
第40-41页
3.1.3 主要仪器设备、试剂和耗材
第41页
3.2 方法和步骤
第41-49页
3.2.1 高分子量DNA的制备
第41-47页
3.2.2 DNA连接和转化
第47-48页
3.2.3 Reverse-4D BAC文库的超级库和亚库构建过程
第48-49页
3.3 BAC库的结果与讨论
第49-56页
3.3.1 结果
第49-50页
3.3.2 讨论
第50-56页
4 画眉防御素物理图谱的构建
第56-81页
4.1 材料
第56-57页
4.1.1 材料来源
第56页
4.1.2 引物设计
第56-57页
4.1.3 主要仪器设备、试剂和耗材
第57页
4.2 方法和步骤
第57-62页
4.2.1 基因组DNA的提取
第57-58页
4.2.2 引物的验证
第58-59页
4.2.3 筛库和最小叠连群的构建
第59-60页
4.2.4 画眉防御素基因注释
第60-61页
4.2.5 画眉防御素基因的进化分析
第61-62页
4.2.6 鸟类防御素基因分化时间估计
第62页
4.3 结果与讨论
第62-81页
4.3.1 叠连群的构建
第62-65页
4.3.2 防御素基因系统发生分析和进化分析
第65-68页
4.3.3 物种间防御素基因结构比较
第68-72页
4.3.4 复制驱动力和复制时间估计
第72-75页
4.3.5 重复元件与复制机制
第75-81页
5 画眉防御素基因的染色体定位
第81-89页
5.1 材料
第81-82页
5.1.1 材料来源
第81页
5.1.2 主要仪器设备
第81页
5.1.3 主要试剂及耗材
第81-82页
5.2 方法和步骤
第82-85页
5.2.1 探针质粒的提取
第82-83页
5.2.2 中期染色体的准备
第83-84页
5.2.3 标记探针
第84页
5.2.4 FISH杂交过程
第84-85页
5.2.5 FISH结果统计
第85页
5.3 结果和讨论
第85-89页
5.3.1 结果
第85-87页
5.3.2 讨论
第87-89页
6 画眉防御素基因的表达分析
第89-96页
6.1 材料
第89-90页
6.1.1 样品来源
第89页
6.1.2 引物及其设计
第89-90页
6.1.3 主要仪器设备、试剂及耗材
第90页
6.2 方法和步骤
第90-93页
6.2.1 总RNA提取
第90-91页
6.2.2 cDNA的合成
第91页
6.2.3 PCR检测其表达情况
第91-93页
6.3 结果与讨论
第93-96页
7 主要结论、创新点及展望
第96-98页
7.1 主要结论
第96-97页
7.2 创新点
第97页
7.3 展望
第97-98页
8 附图
第98-100页
9 参考文献
第100-111页
10 攻读博士学位期间的科研成果
第111页
本篇论文共
111
页,
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。
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