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多梳蛋白PCGF6在精子发生过程中的功能研究及小鼠出生后睾丸发育过程中长链非编码RNA表达谱分析

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多梳蛋白PCGF6在精子发生过程中的功能研究及小鼠出生后睾丸发育过程中长链非编码RNA表达谱分析
论文目录
 
摘要第1-9页
ABSTRACT第9-13页
缩略词表第13-15页
目录第15-19页
第一章 研究背景第19-60页
  1.1 引言第19页
  1.2 哺乳动物精子发生过程及其相关基因研究第19-27页
    1.2.1 哺乳动物精子发生过程第19-22页
    1.2.2 哺乳动物精子发生相关基因第22-27页
  1.3 表观遗传调控因子polycomb抑制复合体1(PRC1)第27-39页
    1.3.1 PRC1复合体的组成第27-29页
    1.3.2 PRC1复合体介导的基因转录抑制机制第29-32页
    1.3.3 PRC1复合体的招募机制第32-36页
    1.3.4 哺乳动物PCGF家族成员及其生物学功能第36-39页
  1.4 长链非编码RNA第39-51页
    1.4.1 长链非编码RNA的概述第39-42页
    1.4.2 长链非编码RNA的起源第42-43页
    1.4.3 长链非编码RNA的生物学功能第43-46页
    1.4.4 长链非编码RNA的分子作用机制第46-51页
  1.5 哺乳动物精子发生的表观遗传学调控研究第51-60页
    1.5.1 DNA甲基化与精子发生第51-53页
    1.5.2 组蛋白修饰与精子发生第53-56页
    1.5.3 非编码RNA与精子发生第56-60页
第二章 表观遗传调控复合体PRC1核心成员多梳蛋白PCGF6在精子发生过程中的功能研究第60-123页
  2.1 前言第60-61页
  2.2 实验材料与试剂第61-67页
    2.2.1 实验动物第61页
    2.2.2 质粒载体与菌株第61页
    2.2.3 实验使用的细胞株第61-62页
    2.2.4 试剂第62-65页
    2.2.5 引物序列第65-67页
  2.3 实验方法第67-92页
    2.3.1 TRIzol法提取总RNA第67-68页
    2.3.2 第一链cDNA的合成第68-69页
    2.3.3 Real-time定量PCR(qRT-PCR)第69-70页
    2.3.4 总蛋白的提取及Western blot第70-73页
    2.3.5 免疫荧光组织化学第73-74页
    2.3.6 基因克隆第74-79页
    2.3.7 表达载体的构建第79-80页
    2.3.8 shRNA干扰载体的构建第80-81页
    2.3.9 细胞培养第81-83页
    2.3.10 脂质体介导的细胞转染第83页
    2.3.11 慢病毒包装以及感染细胞第83-85页
    2.3.12 CCK-8检测细胞增殖试验第85页
    2.3.13 EdU检测细胞增殖试验第85-86页
    2.3.14 流式细胞仪检测细胞周期第86页
    2.3.15 流式细胞仪检测细胞DNA倍体第86-87页
    2.3.16 免疫共沉淀(Co-IP)第87-88页
    2.3.17 基于双分子荧光互补(BiFC)的蛋白互作分析第88-91页
    2.3.18 利用双荧光素酶基因检测系统进行启动子活性分析第91-92页
  2.4 实验结果第92-117页
    2.4.1 PCGF6在小鼠睾丸组织中的表达情况第92-95页
    2.4.2 双标shRNA干扰慢病毒载体的改造第95-98页
    2.4.3 PCGF6基因shRNA干扰慢病毒载体的构建第98-99页
    2.4.4 PCGF6基因shRNA靶序列干扰效率的鉴定第99-101页
    2.4.5 shRNA载体的慢病毒包装第101-102页
    2.4.6 PCGF6基因稳定敲低GC-2 spd细胞株的建立第102-103页
    2.4.7 PCGF6基因敲低对GC-2 spd细胞增殖的影响第103-104页
    2.4.8 PCGF6基因敲低对GC-2 spd细胞周期的影响第104-106页
    2.4.9 PCGF6基因敲低对GC-2 spd体外分化成单倍体细胞的影响第106-109页
    2.4.10 PCGF6基因敲低对GC-2 spd细胞相关组蛋白修饰水平的影响第109-111页
    2.4.11 PCGF6在小鼠睾丸组织内互作蛋白的鉴定第111-114页
    2.4.12 PCGF6蛋白与HSPA2蛋白直接互作检测第114-115页
    2.4.13 PCGF6基因启动子活性调控研究第115-117页
  2.5 讨论第117-122页
    2.5.1 PCGF6负调控雄性生殖细胞的增殖第117-118页
    2.5.2 PCGF6可通过作用减数分裂参与雄性生殖细胞的分化第118-119页
    2.5.3 PCGF6参与雄性生殖细胞减数分裂过程的潜在表观遗传调控机制第119-121页
    2.5.4 PCGF6基因参与精子发生的模型假设第121-122页
  2.6 本章小结第122-123页
第三章 小鼠出生后睾丸发育过程中长链非编码RNA表达谱分析第123-145页
  3.1 前言第123页
  3.2 实验材料与试剂第123-124页
    3.2.1 实验动物第123-124页
    3.2.2 实验试剂第124页
    3.2.3 引物序列第124页
  3.3 实验方法第124-127页
    3.3.1 小鼠睾丸组织总RNA的提取和标记第124-125页
    3.3.2 LncRNA芯片表达谱分析第125页
    3.3.3 Real-time定量PCR(qRT-PCR)第125页
    3.3.4 LncRNA的基因组环境分析第125-126页
    3.3.5 LncRNA基因组位置相关蛋白编码基因的GO功能富集分析第126页
    3.3.6 LncRNA启动子分析第126页
    3.3.7 LncRNA的进化保守性分析第126-127页
  3.4 实验结果第127-142页
    3.4.1 新生小鼠和成年小鼠睾丸组织lncRNAs和mRNAs表达谱概况第127-128页
    3.4.2 新生小鼠和成年小鼠睾丸组织中存在上千条差异表达lncRNAs第128-132页
    3.4.3 qRT-PCR验证芯片结果第132-133页
    3.4.4 LncRNAs在小鼠出生后睾丸发育过程中的表达具有时序性第133页
    3.4.5 差异表达lncRNAs与蛋白编码基因的基因组位置关系第133-137页
    3.4.6 一些差异表达lncRNAs与microRNA重叠第137-139页
    3.4.7 LncRNA相关蛋白编码基因倾向于参与转录调控第139-140页
    3.4.8 大多数差异表达lncRNAs启动子具有表观遗传修饰标志第140-141页
    3.4.9 大多数差异表达lncRNAs含有进化保守元件第141-142页
  3.5 讨论第142-144页
  3.6 本章小结第144-145页
第四章 全文总结第145-147页
  4.1 主要创新点第145页
  4.2 主要结论第145-146页
  4.3 研究展望第146-147页
参考文献第147-171页
附录Ⅰ 实验试剂配制方法第171-175页
附录Ⅱ 双标shRNA慢病毒载pLVX-mRFP-IRES-Neo-shRNA2图谱及序列第175-180页
附表(见光盘)第180-181页
致谢第181-182页
攻读博士期间发表的学术论文第182页
攻读博士期间参与的科研项目第182页

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