抗菌肽活性的力学调控机制研究

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抗菌肽活性的力学调控机制研究

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抗菌肽活性的力学调控机制研究

论文目录
摘要	第1-7页
Abstract	第7-12页
第一章绪论	第12-34页
· 引言	第12页
· 抗菌肽的研究现状	第12-21页
· 抗菌肽的分布、分类	第12-14页
· 抗菌肽的作用过程及结构特点	第14-16页
· 抗菌肽的功能	第16-18页
· 细菌对抗菌肽的抗性	第18-19页
· 抗菌肽药物研究现状	第19-20页
· 抗菌肽的柔性对活性的影响	第20-21页
· 研究手段	第21-32页
· 分子动力学模拟	第21-30页
· 有限元分析	第30-31页
· 温度因子	第31-32页
· 论文研究的主要内容	第32-34页
第二章抗菌肽刚度依赖的构效关系	第34-58页
· 材料与方法	第34-40页
· 抗菌肽	第34-35页
· 研究平台	第35页
· SMD 模拟过程	第35-38页
· 拉伸刚度的提取	第38-39页
· SMD 模拟过程的分析	第39-40页
· 结果	第40-53页
· 抗菌肽体系的平衡	第40-41页
· SMD 模拟参数的选择	第41-43页
· 抗菌肽 HP(2-20)及其类似物的非线性拉伸力学特性	第43-44页
· SMD 模拟过程中抗菌肽二级结构的变化	第44-45页
· SMD 模拟过程中抗菌肽肽链骨架二面角的变化	第45-48页
· SMD 模拟中抗菌肽上氢键的变化	第48-49页
· 抗菌肽拉伸刚度的提取	第49-52页
· 抗菌肽活性与刚度的关系	第52-53页
· 讨论	第53-56页
· 本章小结	第56-58页
第三章抗菌肽-膜体系分子动力学模拟	第58-83页
· 材料与方法	第58-61页
· 体系的构建	第58-60页
· 分子动力学模拟过程	第60-61页
· 结果	第61-79页
· 体系的平衡	第61-62页
· NPAT 系综下抗菌肽几何位置及构象的变化	第62-67页
· NPAT 系综下抗菌肽与膜之间非键相互作用能的变化	第67页
· NPAT 系综下抗菌肽对单个磷脂分子的影响	第67-71页
· NPγT 系综下不同大小表面张力对磷脂分子平均面积的影响	第71-73页
· NPγT 系综下几何位置及构象的变化	第73-76页
· NPγT 系综下抗菌肽与膜之间非键相互作用能的变化	第76-77页
· NPγT 系综下抗菌肽对单个磷脂分子的影响	第77-79页
· 讨论	第79-82页
· 本章小结	第82-83页
第四章抗菌肽-膜体系有限元分析	第83-109页
· 材料与方法	第83-88页
· 结果	第88-105页
· 有限元分析稳定性检验	第89页
· 抗菌肽对膜上应力分布的影响	第89-95页
· 抗菌肽对膜上应变分布的影响	第95-100页
· 抗菌肽对膜上应变能密度分布的影响	第100-105页
· 讨论	第105-107页
· 本章小结	第107-109页
第五章抗菌肽抑菌活性对柔性的双相依赖性	第109-124页
· 材料与方法	第109-110页
· 抗菌肽	第109页
· 生物信息学分析	第109页
· 计算柔性指数	第109-110页
· 抗菌肽 IsCT 及其类似拉伸刚度的提取	第110页
· 结果	第110-120页
· 抗菌肽的柔性指数	第111-112页
· 抗菌肽的柔性指数与拉伸刚度一致	第112-113页
· 抗菌肽的柔性指数与活性	第113-114页
· 抗菌肽的疏水性与活性	第114-115页
· 抗菌肽的两亲性与活性	第115-116页
· 抗菌肽的电荷与活性	第116-117页
· 柔性-活性关系的结构基础	第117-120页
· 讨论	第120-123页
· 本章小结	第123-124页
结论	第124-126页
参考文献	第126-133页
附录	第133-150页
攻读博士学位期间取得的研究成果	第150-152页
致谢	第152-153页
附件	第153页

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