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基于时间点的转录组学分析比较Mo和Mmc的代谢特点及Mo培养基的优化

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基于时间点的转录组学分析比较Mo和Mmc的代谢特点及Mo培养基的优化
论文目录
 
摘要第1-5页
abstract第5-15页
1 前言第15-25页
  1.1 支原体概述第15-16页
    1.1.1 支原体的概念与分类第15页
    1.1.2 支原体的特征第15-16页
    1.1.3 支原体生理学第16页
  1.2 羊支原体性肺炎第16-20页
    1.2.1 羊支原体性肺炎病原学第16-18页
    1.2.2 羊支原体性肺炎病原菌的培养方法第18页
    1.2.3 羊支原体性肺炎病原菌代谢的研究进展第18-20页
  1.3 羊支原体性肺炎检疫方法第20-22页
    1.3.1 病原的分离培养第20页
    1.3.2 病理诊断第20-21页
    1.3.3 分子生物学诊断第21页
    1.3.4 血清学诊断第21-22页
  1.4 羊支原体性肺炎疫苗的研究进展第22-23页
  1.5 RNA-Seq技术、支原体转录组学研究进展第23-24页
  1.6 本研究的目的和意义第24-25页
2 研究一丝状支原体山羊亚种与绵羊肺炎支原体生长曲线的测定第25-30页
  2.1 试验材料第25-26页
    2.1.1 菌种第25页
    2.1.2 主要试剂第25页
    2.1.3 试验器材第25-26页
    2.1.4 主要溶液的配制第26页
  2.2 试验方法第26-27页
    2.2.1 菌株的复苏与培养第26页
    2.2.2 活菌计数第26-27页
    2.2.3 生长曲线的测定第27页
    2.2.4 菌株的保存第27页
  2.3 试验结果第27-28页
    2.3.1 PG3株和NM151株的生长曲线测定结果第27-28页
  2.4 讨论第28-29页
  2.5 小结第29-30页
3 研究二MmcPG3株的不同生长时期的转录组测序与分析第30-58页
  3.1 试验材料第30-31页
    3.1.1 菌种第30页
    3.1.2 主要试剂第30页
    3.1.3 试验器材第30-31页
    3.1.4 主要溶液的配制第31页
  3.2 试验方法第31-37页
    3.2.1 菌株培养第31页
    3.2.2 总RNA的提取第31-32页
    3.2.3 样品检测、制备和测序第32-33页
    3.2.4 生物信息分析流程第33-34页
    3.2.5 基因表达水平第34页
    3.2.6 差异表达基因的分析第34页
    3.2.7 差异基因KEGG注释和富集分析第34-35页
    3.2.8 RT/q-PCR对RNA-seq分析结果的验证第35-37页
  3.3 结果第37-54页
    3.3.1 PG3株四个生长时期的样品总RNA提取结果第37-38页
    3.3.2 PG3株四个生长时期总RNA样品质量检测结果第38-39页
    3.3.3 PG3株四个生长时期转录组测序结果第39-42页
    3.3.4 PG3株四个生长时期基因表达水平第42页
    3.3.5 PG3株四个生长时期差异表达基因的分析第42-43页
    3.3.6 PG3株四个生长时期差异表达基因KEGG富集分析第43-54页
    3.3.7 RT/q-PCR对PG3株RNA-seq分析结果的验证结果第54页
  3.4 讨论第54-57页
    3.4.1 PG3株生长时期糖酵解途径的代谢差异第55页
    3.4.2 PG3株生长时期核苷酸代谢的差异第55-56页
    3.4.3 PG3株生长时期甘油磷脂代谢途径的代谢差异第56页
    3.4.4 PG3株四个生长时期氨酰-tRNA连接酶相关的差异第56-57页
  3.5 结论第57-58页
4 研究三绵羊肺炎支原体NM151株不同生长时期转录组测序分析第58-76页
  4.1 试验材料第58页
    4.1.1 菌种第58页
    4.1.2 主要试剂第58页
    4.1.3 试验器材第58页
    4.1.4 主要溶液的配制第58页
  4.2 试验方法第58-61页
    4.2.1 菌株培养第58页
    4.2.2 总RNA的提取第58-59页
    4.2.3 样品检测、制备和测序第59页
    4.2.4 生物信息分析流程第59-60页
    4.2.5 基因表达水平第60页
    4.2.6 差异表达基因的分析第60页
    4.2.7 差异基因KEGG注释和富集分析第60页
    4.2.8 RT/q-PCR对RNA-seq分析结果的验证第60-61页
  4.3 结果第61-73页
    4.3.1 NM151株五个生长时期样品总RNA提取结果第61-62页
    4.3.2 NM151株五个生长时期总RNA样品质量检测结果第62-63页
    4.3.3 NM151株五个生长时期转录组测序数据结果第63-66页
    4.3.4 NM151株五个生长时期基因表达水平第66页
    4.3.5 NM151株五个生长时期差异表达基因的分析第66-68页
    4.3.6 NM151株个五不同生长时期差异表达基因KEGG富集分析第68-72页
    4.3.7 RT/q-PCR对NM151株RNA-seq分析结果的验证结果第72-73页
  4.4 讨论第73-75页
    4.4.1 NM151株五个生长时期富集到糖酵解的差异表达基因第73-74页
    4.4.2 NM151株五个时期富集到核苷酸代谢的差异表达基因第74页
    4.4.3 NM151株五个时期与氨酰-tRNA连接酶相关差异表达基因第74-75页
  4.5 结论第75-76页
5 研究四Mmc与Mo的代谢差异的比较分析及培养基优化方案提出第76-102页
  5.1 试验数据第76页
  5.2 MmcPG3株与MoNM151株代谢差异的比较分析方法第76-77页
    5.2.1 MmcPG3株与MoNM151株代谢特点的总体比较第76页
    5.2.2 MmcPG3株与MoNM151株对应生长时期点对点比较分析第76-77页
  5.3 结果第77-98页
    5.3.1 MmcPG3株与MoNM151株代谢特点的总体比较第77-78页
    5.3.2 MmcPG3株与MoNM151株对应生长时期点对点比较分析第78-97页
    5.3.3 Mo培养基改良方案的提出第97-98页
  5.4 讨论第98-101页
  5.5 结论第101-102页
6 研究五Mo培养基的优化第102-106页
  6.1 试验材料第102页
    6.1.1 菌种第102页
    6.1.2 主要试剂第102页
    6.1.3 试验器材第102页
    6.1.4 主要溶液的配制第102页
  6.2 试验方法第102-103页
    6.2.1 菌株的复苏与培养第102-103页
    6.2.2 活菌计数第103页
    6.2.3 pH值的测定第103页
    6.2.4 生长曲线的测定第103页
  6.3 试验结果第103-105页
    6.3.1 NM151株在四种不同改良培养基中的生长曲线第103-105页
    6.3.2 NM151株在四种改良培养基中的pH值测定第105页
  6.4 讨论第105-106页
  6.5 结论第106页
7 全文结论第106-107页
致谢第107-108页
参考文献第108-117页
作者简介第117页

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