论文目录 | |
| 图片目录 | 第11-13
页 |
| 表格目录 | 第13-15
页 |
| 中文摘要 | 第15-18
页 |
| 英文摘要 | 第18-22
页 |
| 文献综述 | 第22-53
页 |
| 第一节 遗传标记研究进展 | 第22-34
页 |
| 前言 | 第22-23
页 |
| · 遗传标记的分类 | 第23-25
页 |
| · 形态学标记 | 第23
页 |
| · 细胞遗传标记 | 第23
页 |
| · 生化遗传标记 | 第23-24
页 |
| · 分子遗传标记 | 第24-25
页 |
| · 分子标记的主要类型 | 第25-32
页 |
| · 限制性片段多态性(RFLP) | 第25
页 |
| · 随机扩增多态DNA(RAPD) | 第25-26
页 |
| · 扩增片段长度多态性(AFLP) | 第26-27
页 |
| · 单核苷酸多态性(SNP) | 第27-28
页 |
| · 微卫星(Microsatellite)DNA | 第28-29
页 |
| · mtDNA标记 | 第29-30
页 |
| · DNA指纹标记 | 第30
页 |
| · ISSR(Inter Simple Sequence Repeats) | 第30-31
页 |
| · PCR-SSCP标记 | 第31-32
页 |
| · 分子标记与数量性状位点的连锁分析方法 | 第32-33
页 |
| · 前景与展望 | 第33-34
页 |
| 第二节 遗传标记在山(绵)羊遗传育种中的应用 | 第34-53
页 |
| · 遗传多样性方面 | 第34-44
页 |
| · RFLP标记 | 第34-37
页 |
| · 利用RFLP标记在绵羊、山羊育种上的应用研究报道相对较多。 | 第34-36
页 |
| · Beta酪蛋白全基因PCR-RFLP | 第36
页 |
| · 绵羊褪黑激素受体1a基因第二外显子PCR-RFLP分析 | 第36
页 |
| · 绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLP分析 | 第36-37
页 |
| · BMPR-IB基因PCR-RFLP研究 | 第37
页 |
| · RAPD标记 | 第37-42
页 |
| · 微卫星DNA | 第42-44
页 |
| · 小卫星DNA标记(Ministatellite DNA) | 第44
页 |
| · AFLP遗传标记 | 第44
页 |
| · MAS与QTL定位 | 第44-53
页 |
| 第一章 引物筛选及四川几个山(绵)羊品种的RAPD分析 | 第53-72
页 |
| 摘要 | 第53
页 |
| 关键词 | 第53
页 |
| 引言 | 第53-54
页 |
| 1 材料与方法 | 第54-58
页 |
| · 试验材料 | 第54-55
页 |
| · 试验动物 | 第54
页 |
| · 试剂盒、工具酶和生化试剂 | 第54
页 |
| · 主要仪器 | 第54-55
页 |
| · 引物合成 | 第55
页 |
| · 试验方法 | 第55-58
页 |
| · 全血基因组DNA的抽提 | 第56
页 |
| · 基因池A和基因池B的制备 | 第56
页 |
| · 随机引物筛选 | 第56
页 |
| · PCR实验条件优化 | 第56-57
页 |
| · 五个山(绵)羊基因池A的PCR扩增 | 第57
页 |
| · 五个山(绵)羊基因池B的PCR扩增 | 第57
页 |
| · RAPD数据统计处理 | 第57-58
页 |
| 2 试验结果 | 第58-67
页 |
| · 基因组DNA的抽提、检验 | 第58
页 |
| · 筛选之引物 | 第58-61
页 |
| · 优化的PCR反应条件 | 第61-65
页 |
| · Taq酶浓度 | 第61
页 |
| · 引物浓度 | 第61-62
页 |
| · Mg~(2+)浓度 | 第62-63
页 |
| · 模板浓度 | 第63-64
页 |
| · 4dNTP浓度 | 第64
页 |
| · PCR循环数及其他条件 | 第64-65
页 |
| · 五个山(绵)羊品种间的遗传亲缘关系 | 第65-66
页 |
| · 五个山(绵)羊品种内公羊和母羊之间的遗传相似系数 | 第66
页 |
| · 各品种间的UPGMA聚类 | 第66-67
页 |
| 3 讨论 | 第67-69
页 |
| · 随机引物的多态性 | 第67-68
页 |
| · RAPD的可重复性 | 第68
页 |
| · RAPD对近缘种山羊分析的可靠性 | 第68-69
页 |
| 小结 | 第69
页 |
| 参考文献 | 第69-72
页 |
| 第二章 四川9个黑山羊种群的RAPD分析 | 第72-84
页 |
| 摘要 | 第72
页 |
| 关键词 | 第72
页 |
| 引言 | 第72-73
页 |
| 1 材料与方法 | 第73-75
页 |
| · 材料 | 第73-74
页 |
| · 试验动物 | 第73
页 |
| · 试剂 | 第73
页 |
| · 主要仪器 | 第73-74
页 |
| · 方法 | 第74-75
页 |
| · 随机引物的挑选 | 第74
页 |
| · 对所有样品进行逐一PCR扩增 | 第74-75
页 |
| · 数据分析 | 第75
页 |
| · 引物的多态性分析 | 第75
页 |
| · 群体的遗传多样性参数 | 第75
页 |
| · 群体杂合度(Nei’s基因多样度)： | 第75
页 |
| · Shannon多态信息指数 | 第75
页 |
| · 群体基因分化系数 | 第75
页 |
| · 各群体间的遗传一致性和跗距离 | 第75
页 |
| · Nei’s遗传相似性指数 | 第75
页 |
| · Nei’s标准遗传距离 | 第75
页 |
| · 聚类分析 | 第75
页 |
| 2 结果 | 第75-79
页 |
| · 各引物序列信息及扩增结果 | 第75-77
页 |
| · 各群体的杂合度和Shannon多态信息指数 | 第77
页 |
| · 群体基因分化系数 | 第77
页 |
| · 各群体间的遗传一致性和遗传距离 | 第77-78
页 |
| · 各群体的UPGMA聚类分析结果 | 第78-79
页 |
| 3 讨论 | 第79-80
页 |
| · 黑山羊核DNA遗传多样性的高检出率 | 第79
页 |
| · 四川黑山羊整体的低分化 | 第79-80
页 |
| · 四川黑山羊亲缘关系与地理分布的一致性 | 第80
页 |
| 小结 | 第80
页 |
| 参考文献 | 第80-84
页 |
| 第三章 黑山羊种群RAPD标记与黑山羊表型性状的相关分析 | 第84-95
页 |
| 摘要 | 第84
页 |
| 关键词 | 第84
页 |
| 引言 | 第84-85
页 |
| 1 材料与方法 | 第85-87
页 |
| · 材料 | 第85-86
页 |
| · 试验动物 | 第85
页 |
| · 试剂 | 第85
页 |
| · 仪器 | 第85
页 |
| · 引物 | 第85-86
页 |
| · 方法 | 第86-87
页 |
| · 分别对公羊和母羊总DNA进行逐一PCR扩增 | 第86
页 |
| · 数据分析 | 第86-87
页 |
| · 各性状的表型变异及相关分析 | 第86
页 |
| · RAPD标记与性状间的关联分析 | 第86
页 |
| · 与性状真实关联的分子标记筛选 | 第86-87
页 |
| 2 结果 | 第87-92
页 |
| · 各RAPD引物序列及扩增结果 | 第87-88
页 |
| · 各产区黑山羊间性状差异的方差分析 | 第88
页 |
| · 各性状的表型变异 | 第88
页 |
| · 性状间的表型相关 | 第88-89
页 |
| · RAPD标记与性状间的关联分析 | 第89-90
页 |
| · 与性状真实关联的分子标记筛选结果 | 第90-92
页 |
| · 根据表型相关的显著性进行筛选 | 第90
页 |
| · 根据两独立样本间个体表型值的分布进行筛选 | 第90-92
页 |
| 3 讨论 | 第92-93
页 |
| · 关于RAPD标记与性状的关联分析 | 第92
页 |
| · RAPD标记对性状的效应 | 第92-93
页 |
| 参考文献 | 第93-95
页 |
| 第四章 四川黑山羊10个微卫星基因座遗传多态性研究 | 第95-109
页 |
| 摘要 | 第95
页 |
| 关键词 | 第95
页 |
| 引言 | 第95-97
页 |
| 1 材料与方法 | 第97-100
页 |
| · 材料 | 第97-98
页 |
| · 试验动物 | 第97-98
页 |
| · 试剂 | 第98
页 |
| · 主要仪器 | 第98
页 |
| · 方法 | 第98-100
页 |
| · 微卫星引物的筛选与合成 | 第98
页 |
| · PCR扩增 | 第98-99
页 |
| · 数据分析 | 第99-100
页 |
| · 微卫星标记等位基因频率 | 第99-100
页 |
| · 多态信息含量(PIC) | 第100
页 |
| · 群体杂合度(H) | 第100
页 |
| · 有效等位基因数(Ne) | 第100
页 |
| · 群体间遗传距离和聚类 | 第100
页 |
| 2 结果与分析 | 第100-105
页 |
| · PCR扩增产物及电泳结果 | 第100
页 |
| · 等位基因及其频率 | 第100-101
页 |
| · 多态信息含量 | 第101-103
页 |
| · 群体杂合度 | 第103
页 |
| · 有效等位基因数 | 第103-104
页 |
| · 群体间的遗传距离和聚类 | 第104-105
页 |
| 3 讨论 | 第105-106
页 |
| · 四川9个黑山羊种群的遗传多态性 | 第105-106
页 |
| · 黑山羊品种(群体)的等位基因及其频率 | 第106
页 |
| · 黑山羊品种(群体)聚类 | 第106
页 |
| 小结 | 第106-107
页 |
| 参考文献 | 第107-109
页 |
| 第五章 四川各地黑山羊mtDNA分子遗传特征研究 | 第109-133
页 |
| 摘要 | 第109
页 |
| 关键词 | 第109
页 |
| 引言 | 第109
页 |
| 1 材料和方法 | 第109-112
页 |
| · 材料 | 第109-110
页 |
| · 试验动物 | 第109
页 |
| · 试剂 | 第109-110
页 |
| · 引物 | 第110
页 |
| · 主要仪器 | 第110
页 |
| · 方法 | 第110-112
页 |
| · 肝组织中分离线粒体 | 第111
页 |
| · mtDNA的提取 | 第111
页 |
| · mtDNA的纯化与检测 | 第111
页 |
| · 目的DNA片断的扩增 | 第111-112
页 |
| · PCR产物的纯化与正反向测序 | 第112
页 |
| · 测序数据的处理 | 第112
页 |
| · 序列的CLUSTALW对位排列 | 第112
页 |
| · 分析软件(MEGA2.0)确定多态位点 | 第112
页 |
| · 分析软件(MEGA2.0)确定核苷酸总变异位点 | 第112
页 |
| · 分析软件(MEGA2.0)确定简约信息位点 | 第112
页 |
| · DnaSP软件计算单倍型多样性 | 第112
页 |
| · DnaSP软件计算种群内的核苷酸多样性 | 第112
页 |
| · DnaSP软件计算种群间的序列歧异水平 | 第112
页 |
| · Network4.1软件构建单倍型网络关系图 | 第112
页 |
| · PAUP~*4.0b10构建单倍型邻接树 | 第112
页 |
| · Arlequin 2.0进行核苷酸误配分析 | 第112
页 |
| 2 结果 | 第112-127
页 |
| · 四川黑山羊的mtDNA变异 | 第112-118
页 |
| · 黑山羊mtDNA Dloop序列长度与碱基组成 | 第112-113
页 |
| · 黑山羊mtDNA Dloop序列的核苷酸多态位点变异 | 第113
页 |
| · 四川黑山羊mtDNA Dloop环单倍型 | 第113-118
页 |
| 2.2.四川黑山羊种群mtDNA Dloop遗传结构 | 第118-123
页 |
| · 黑山羊mtDNA Dloop序列长度与碱基组成 | 第118-119
页 |
| · 黑山羊mtDNA Dloop序列的核苷酸多态位点变异 | 第119
页 |
| · 黑山羊mtDNA Dloop序列的核苷酸多态位点变异类型 | 第119-120
页 |
| · 黑山羊mtDNA Dloop环单倍型 | 第120-123
页 |
| · 四川黑山羊D Loop全序列单倍型网络图 | 第123-125
页 |
| · 系统发育关系树的构建 | 第125-126
页 |
| · 黑山羊群体扩张事件 | 第126
页 |
| · 30个序列一体碱基图 | 第126-127
页 |
| · 黑山羊种群内mtDNA Dloop序列的同源性比较 | 第127
页 |
| · 黑山羊同其他山羊mtDNA Dloop序列的聚类比较 | 第127
页 |
| 2 .9 黑山羊同其他山羊品种间mtDNA Dloop序列的聚类 | 第127
页 |
| 3 讨论 | 第127-131
页 |
| · 冷冻肝脏中mtDNA的抽提效果比较 | 第127-129
页 |
| · 四川黑山羊种群mtDNA丰富的遗传多样性 | 第129-130
页 |
| · 黑山羊种群间的遗传分化 | 第130
页 |
| · mtDNA序列分析同RAPD分析的比较 | 第130-131
页 |
| 参考文献 | 第131-133
页 |
| 本学位论文研究结论 | 第133-137
页 |
| 致谢 | 第137-138
页 |
| 在校期间发表文章情况 | 第138-171
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