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碳纳米管固定Lip2脂肪酶的分子动力学研究
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碳纳米管固定Lip2脂肪酶的分子动力学研究
论文目录
摘要
第1-6页
ABSTRACT
第6-14页
第一章 绪论
第14-30页
· 脂肪酶简介
第14-17页
· 脂肪酶的概述
第14页
· 脂肪酶的结构及其催化机制
第14-15页
· 脂肪酶固定化
第15-16页
· 非水相体系中脂肪酶的催化反应
第16-17页
· 脂肪酶在手性拆分中的应用
第17页
· 碳纳米管的简介
第17-19页
· 碳纳米管的基本结构
第17-18页
· 碳纳米管的结构特性
第18-19页
· Gaussian 简介
第19-20页
· Gaussian03 简介
第19页
· Gaussian03 计算原理
第19-20页
· 分子动力学模拟
第20-27页
· 分子动力学模拟介绍
第20-21页
· 分子动力学方法
第21-23页
· GROMACS 简介
第23-26页
· 分子力场简介
第26-27页
· 分子动力学模拟在脂肪酶催化机理研究中的应用
第27页
· 本课题研究的背景及主要内容
第27-30页
· 研究背景
第27-28页
· 研究内容
第28-30页
第二章 Lip2 脂肪酶的预处理及溶剂模型的建立
第30-40页
· 前言
第30-31页
· 固定化酶的建立
第31-35页
· 通过共价键连接 Lip2 脂肪酶和碳纳米管
第31-32页
· 通过吸附作用形成的固定化酶
第32-35页
· 酶的预处理
第35-37页
· 溶剂模型的建立
第37-39页
· 小结
第39-40页
第三章 游离酶及固定化酶的分子动力学模拟
第40-62页
· 前言
第40页
· 计算方法
第40-41页
· 总体计算方法
第40-41页
· 模拟过程中各阶段的参数设置
第41页
· 结果与讨论
第41-61页
· 整体分析
第42-44页
· 与碳纳米管相互作用的残基
第44-46页
· 盖子构象的分析
第46-49页
· ED 分析
第49-55页
· 氨基酸残基间的最小距离分析
第55-59页
· 盐桥和氢键的分析
第59-61页
· 小结
第61-62页
第四章 固定酶及游离酶与底物的分子动力学模拟
第62-72页
· 前言
第62-63页
· 底物分子模型的建立
第63-65页
· 分子动力学模拟
第65-69页
· 计算方法
第65-66页
· 结果与讨论
第66-69页
· 小结
第69-72页
第五章 结论
第72-74页
· 结论
第72页
· 创新
第72-74页
参考文献
第74-78页
附录
第78-80页
致谢
第80-82页
研究成果及发表的学术论文
第82-83页
作者和导师介绍
第83-84页
硕士研究生学位论文答辩委员会决议书
第84-85页
本篇论文共
85
页,
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