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猪流行性腹泻病毒优势流行毒株筛选及表达S蛋白重组伪狂犬病毒的构建

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猪流行性腹泻病毒优势流行毒株筛选及表达S蛋白重组伪狂犬病毒的构建
论文目录
 
摘要第3-5页
SUMMARY第5-10页
第一章 综述第10-20页
1 PEDV的概述第10-15页
  1.1 PED的流行特征第10页
  1.2 PEDV的病原学特性第10-11页
  1.3 PEDV基因组特征第11-12页
  1.4 PEDV S基因的功能特性第12-13页
  1.5 PEDV S基因变异第13页
  1.6 PED疫苗的研究及应用状况第13-15页
    1.6.1 传统疫苗第13-14页
    1.6.2 新型疫苗第14-15页
2 PRV的概述第15-17页
  2.1 PRV的病原学特征第15页
  2.2 PRV的基因组特征第15-16页
  2.3 PRV糖蛋白毒力相关基因第16页
  2.4 猪伪狂犬疫苗的研究第16-17页
    2.4.1 PRV基因缺失疫苗第16-17页
    2.4.2 PRV活载体疫苗第17页
3 细菌人工染色体第17-20页
  3.1 BAC的研究与进展第17-18页
  3.2 BAC克隆常用的定位修饰方法第18-20页
第二章 PEDV S与ORF3基因遗传进化分析及优势流行株的筛选第20-31页
1 材料第20-21页
  1.1 病毒和工程菌第20页
  1.2 主要试剂第20-21页
2 实验方法第21-23页
  2.1 设计引物与合成第21页
  2.2 PEDV RNA的提取第21页
  2.3 S基因各片段的扩增和鉴定第21-22页
  2.4 S基因各片段的克隆和测序第22页
  2.5 S基因和ORF3基因的测序与对比分析第22-23页
3 结果第23-29页
  3.1 PEDV S和ORF3基因克隆第23页
  3.2 PEDV S和ORF3基因克隆的鉴定第23页
  3.3 PEDV S基因的同源性和遗传变异分析第23-27页
  3.4 S基因的遗传进化第27-28页
  3.5 S蛋白抗原位点变化分析第28-29页
  3.6 ORF3氨基酸序列同源性分析第29页
4 讨论第29-31页
第三章 表达PEDV S蛋白的重组PRV的构建第31-50页
1 材料第31-32页
  1.1 菌(毒)株、质粒和细胞第31页
  1.2 实验试剂第31-32页
2 方法第32-41页
  2.1 PEDV S基因的优化第32页
  2.2 引物设计与合成第32-33页
  2.3 真核表达质粒PEP-S1-END和PEP-S2-END的构建第33-35页
    2.3.1 重组质粒PUC57-S和真核表达载体酶切第33页
    2.3.2 表达载体与目的基因连接第33页
    2.3.3 连接产物的转化第33-34页
    2.3.4 扩大培养重组菌第34页
    2.3.5 重组菌的菌液PCR鉴定第34-35页
    2.3.6 重组质粒的测序鉴定第35页
    2.3.7 重组质粒的提取及鉴定第35页
  2.4 真核质粒的体外瞬时转染第35页
  2.5 间接免疫荧光法检测转染水平第35-36页
  2.6 表达PEDV S1和S2蛋白的重组PRV的构建第36-38页
    2.6.1 RED重组PCR产物的制备第36页
    2.6.2 PCR产物的回收和纯化第36页
    2.6.3 PCR产物模板质粒的去除第36页
    2.6.4 酶切产物的回收第36-37页
    2.6.5 PRV-BAC ZJ株的PCMV启动子更换第37页
    2.6.6 pPRV-EF1-KAN突变体KAN基因的删除第37页
    2.6.7 pPRV-EF1/GS1783电转化感受态细胞的制备第37-38页
    2.6.8 pPRV-S-ΔGIE突变体的构建第38页
  2.7 拯救rPRV-S1-ΔGIE和rPRV-S2-ΔGIE重组病毒第38-40页
    2.7.1 提取pPRV-S1-ΔGIE和pPRV-S2-ΔGIE质粒及酶切鉴定第38-39页
    2.7.2 rPRV-S1-ΔGIE和rPRV-S2-ΔGIE重组病毒的拯救第39-40页
    2.7.3 删除rPRV-S1-ΔGIE和rPRV-S2-ΔGIE中的KAN基因并拯救第40页
  2.8 WESTERN BLOT检测PEDV S蛋白的表达第40页
  2.9 重组病毒免疫小鼠试验第40-41页
3 试验结果第41-47页
  3.1 重组表达质粒PEP-S1-END和PEP-S2-END的构建和鉴定第41-42页
  3.2 PEP-S1-END和PEP-S2-END质粒体外瞬时转染第42页
  3.3 表达PEDV S1和S2蛋白的重组PRV的构建第42-47页
    3.3.1 RED重组PCR产物的制备第42-43页
    3.3.2 PCR产物模板质粒的去除第43页
    3.3.3 提取pPRV-S1-ΔGIE和pPRV-S2-ΔGIE质粒及酶切鉴定第43-44页
    3.3.4 拯救rPRV-S1-ΔGIE和rPRV-S2-ΔGIE重组病毒第44页
    3.3.5 删除rPRV-S1-ΔGIE和rPRV-S2-ΔGIE中的KAN基因并拯救第44-45页
    3.3.6 拯救删除KAN基因的rPRV-S1-ΔGIE和rPRV-S2-ΔGIE重组病毒第45页
    3.3.7 重组病毒表达蛋白的WESTERN BLOT检测第45-46页
    3.3.8 免疫小鼠抗体检测第46-47页
4 讨论第47-48页
  4.1 KOZAK的调控作用第47页
  4.2 RED同源重组第47页
  4.3 PEDV S基因的真核表达第47-48页
5 结论第48-50页
参考文献第50-57页
致谢第57-58页
附录第58-64页
作者简介第64-65页
导师简介第65-66页

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