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常见牧草DNA条形码通用序列筛选及数据库建立

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常见牧草DNA条形码通用序列筛选及数据库建立
论文目录
 
摘要第4-5页
SUMMARY第5-9页
英文缩略第9-10页
第一章 文献综述第10-19页
1 DNA条形码简介第10页
2 植物DNA条形码的研究现状第10-15页
  2.1 单个片段植物DNA条形码研究现状第12-14页
    2.1.1 rbcL片段第12页
    2.1.2 mat K片段第12-13页
    2.1.3 trnH-psbA片段第13页
    2.1.4 ITS序列第13-14页
  2.2 多片段组合植物DNA条形码研究进展及优缺点分析第14-15页
    2.2.1 rpoC1+rpoB+mat K或rpoC1+matK+trnH-psbA第14-15页
    2.2.2 mat K+atpF-atpH+psbK-psbI或matK+atpF-atpH+trnH-psbA第15页
3 DNA条形码技术在植物中的应用第15-17页
  3.1 DNA条形码在保护珍稀濒危植物物种中的应用第15-16页
  3.2 DNA条形码在鉴定物种及发现隐种方面发挥重要作用第16页
  3.3 DNA条形码在植物系统发育研究中的应用第16-17页
4 DNA条形码的工作流程及分析方法第17-18页
  4.1 工作流程第17页
  4.2 分析方法第17-18页
    4.2.1 序列比对第17页
    4.2.2 计算K2P遗传距离,分析种内种间变异程度第17页
    4.2.3 构建系统发育树第17-18页
5 存在的争议与展望第18-19页
第二章 材料和方法第19-31页
1 实验材料第19-22页
  1.1 实验牧草第19-21页
  1.2 主要仪器设备第21-22页
  1.3 主要试剂第22页
2 实验方法第22-29页
  2.1 DNA提取第22-23页
  2.2 基因组DNA检测第23-24页
    2.2.1 琼脂糖凝胶电泳法检测第23-24页
    2.2.2 纯度系浓度检测第24页
  2.3 DNA Barcoding基因选择与引物设计第24-28页
  2.4 PCR扩增第28页
    2.4.1 反应体系第28页
    2.4.2 反应条件第28页
  2.5 胶回收PCR产物第28-29页
  2.6 克隆及测序第29页
3 数据分析第29-31页
第三章 结果与分析第31-51页
1 PCR扩增引物筛选第31-35页
2 DNA保守区识别第35-36页
3 DNA Barcodes候选特异性片段多样性分析第36-41页
  3.1 mat K1片段多样性分析第36-37页
  3.2 mat K2片段多样性分析第37-38页
  3.3 mat K3片段多样性分析第38-39页
  3.4 rbc L片段多样性分析第39-41页
4 单倍型分析第41-46页
  4.1 mat K1单倍型分析第41-42页
  4.2 mat K2单倍型分析第42-43页
  4.3 mat K3单倍型分析第43-44页
  4.4 rbc L单倍型分析第44-46页
5 DNA Barcoding数据库的建立第46-49页
  5.1 禾本科牧草DNA Barcoding数据库第46-47页
  5.2 豆科牧草DNA Barcoding数据库第47-49页
6 系统发育树的构建第49-51页
第四章 讨论第51-57页
1 常见牧草标记位点选择及引物设计第51-52页
2 豆科和禾本科牧草的饲用价值及其DNA Barcoding研究的必要性第52页
3 单片段及多片段组合方式鉴别效率比较第52-56页
  3.1 mat K基因4个标记位点第53-54页
  3.2 rbc L基因第54页
  3.3 trnH-psbA基因第54-55页
  3.4 ITS基因第55页
  3.5 mat K基因3个标记位点(matK1、mat K2和matK3)及rbc L基因联合鉴别效率第55-56页
4 基于系统发育树的辅助鉴定第56-57页
第五章 结论第57-58页
致谢第58-59页
参考文献第59-66页
附录第66-67页
作者简介第67-68页
导师简介第68-69页

本篇论文共69页,点击这进入下载页面
 
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