产气荚膜梭菌生物被膜形成分子机制的研究

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产气荚膜梭菌生物被膜形成分子机制的研究

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产气荚膜梭菌生物被膜形成分子机制的研究

论文目录
摘要	第1-6页
Abstract	第6-11页
第一章文献综述	第11-20页
1.1 产气荚膜梭菌概述	第11-12页
1.2 生物被膜研究进展	第12-17页
1.2.1 生物被膜的结构	第12页
1.2.2 生物被膜的形成过程	第12-13页
1.2.3 影响生物被膜形成的因素	第13-14页
1.2.4 生物被膜形成调控机制	第14-16页
1.2.5 生物被膜的耐药性及其机制	第16-17页
1.2.6 生物被膜的防治方法	第17页
1.3 转录组测序技术	第17-18页
1.4 蛋白质组学技术	第18-20页
第二章产气荚膜梭菌生物被膜的形态观察	第20-24页
2.1 材料	第20-21页
2.1.1 菌种	第20页
2.1.2 主要试剂和用品	第20页
2.1.3 仪器设备	第20-21页
2.2 方法	第21页
2.2.1 普通光学显微镜观察产气荚膜梭菌生物被膜	第21页
2.2.2 扫描电镜观察产气荚膜梭菌生物被膜	第21页
2.3 结果与分析	第21-23页
2.3.1 普通光学显微镜观察产气荚膜梭菌生物被膜	第21-22页
2.3.2 扫描电镜观察产气荚膜梭菌生物被膜	第22-23页
2.4 讨论	第23-24页
第三章产气荚膜梭菌生物被膜转录组测序与分析	第24-46页
3.1 材料	第24-25页
3.1.1 主要试剂	第24页
3.1.2 仪器设备	第24页
3.1.3 主要软件	第24-25页
3.2 方法	第25-28页
3.2.1 产气荚膜梭菌生物被膜的收集	第25页
3.2.2 总RNA的提取	第25页
3.2.3 RNA完整性、纯度及浓度检测	第25页
3.2.4 文库构建	第25-26页
3.2.5 库检及RNA测序	第26页
3.2.6 测序数据质量评估	第26页
3.2.7 Reads与参考基因组比对	第26页
3.2.8 基因表达水平分析	第26页
3.2.9 差异基因表达分析	第26页
3.2.10 差异基因GO富集分析	第26-27页
3.2.11 差异基因KEGG富集分析	第27页
3.2.12 差异基因的实时荧光定量PCR验证	第27-28页
3.3 结果与分析	第28-43页
3.3.1 测序数据质量评估	第28-31页
3.3.2 Reads与参考基因组比对	第31页
3.3.3 基因表达水平分析	第31-32页
3.3.4 差异基因表达分析	第32-33页
3.3.5 差异基因GO富集分析	第33-35页
3.3.6 差异基因KEGG富集分析	第35-40页
3.3.7 差异基因的实时荧光定量PCR验证	第40-43页
3.4 讨论	第43-46页
第四章产气荚膜梭菌生物被膜蛋白质组学分析	第46-67页
4.1 材料	第46-47页
4.1.1 主要试剂	第46页
4.1.2 仪器设备	第46-47页
4.2 方法	第47-53页
4.2.1 蛋白提取	第47-48页
4.2.2 蛋白质的Bradford定量	第48页
4.2.3 蛋白质检测	第48页
4.2.4 酶切和除盐	第48-49页
4.2.5 iTRAQ标记	第49页
4.2.6 HighpHC18分组分	第49-50页
4.2.7 LC-MS/MS质谱检测	第50页
4.2.8 生物信息学分析	第50-52页
4.2.9 转录组与蛋白质组关联分析	第52-53页
4.3 结果与分析	第53-65页
4.3.1 数据质控	第53-56页
4.3.2 差异蛋白分析	第56页
4.3.3 GO富集分析	第56-57页
4.3.4 KEGG富集分析	第57-60页
4.3.5 转录组和蛋白质组关联分析	第60-65页
4.4 讨论	第65-67页
第五章结论与展望	第67-69页
5.1 结论	第67-68页
5.2 创新点	第68页
5.3 展望	第68-69页
参考文献	第69-75页
致谢	第75-76页
作者简介	第76-77页

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