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基于向日葵锈菌转录组测序的SSR标记及遗传多态性分析
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基于向日葵锈菌转录组测序的SSR标记及遗传多态性分析
论文目录
 
摘要第3-5页
Abstract第5-9页
1 引言第9-18页
　　1.1 向日葵锈病研究进展第9页
　　1.2 DNA分子标记第9-12页
　　1.3 SSR标记第12-14页
　　　　1.3.1 SSR标记技术的概念和原理第12-13页
　　　　1.3.2 SSR分子标记的开发第13页
　　　　1.3.3 SSR标记的研究历程及特点第13-14页
　　1.4 DNA分子标记在真菌研究中的应用第14-16页
　　1.5 研究内容、目的与意义第16-18页
　　　　1.5.1 研究内容与技术路线第16-17页
　　　　1.5.2 研究目的与意义第17-18页
2 基于向日葵锈菌转录组SSR数据挖掘第18-27页
　　2.1 材料与方法第18-19页
　　　　2.1.1 材料及数据来源第18页
　　　　2.1.2 SSR的挖掘第18页
　　　　2.1.3 ORF预测及含SSR序列基因表达水平分析第18-19页
　　　　2.1.4 含SSR Unigene的的功能注释第19页
　　2.2 结果与分析第19-24页
　　　　2.2.1 重复基元的频率及分布第19-20页
　　　　2.2.2 SSR长度特征第20-22页
　　　　2.2.3 SSR位置及含SSR序列基因表达水平分析第22-23页
　　　　2.2.4 含SSR的转录本的GO注释第23-24页
　　2.3 讨论第24-27页
3 SSR反应体系优化第27-36页
　　3.1 材料方法第27-29页
　　　　3.1.1 所用试剂及仪器第27-28页
　　　　3.1.2 模板DNA制备第28页
　　　　3.1.3 SSR引物设计第28-29页
　　　　3.1.4 SSR体系优化第29页
　　3.2 试验结果第29-34页
　　　　3.2.1 基因组DNA的提取第29-30页
　　　　3.2.2 引物设计第30页
　　　　3.2.3 SSR-PCR反应体系优化第30-32页
　　　　3.2.4 引物退火温度的优化第32-34页
　　3.3 结论与讨论第34-36页
　　　　3.3.1 向日葵锈菌夏孢子基因组提取第34页
　　　　3.3.2 SSR-PCR反应条件优化第34-35页
　　　　3.3.3 引物退火温度的优化第35-36页
4 向日葵锈菌遗传多态性第36-47页
　　4.1 材料方法第36-37页
　　　　4.1.1 试验材料第36-37页
　　　　4.1.2 繁殖方法第37页
　　　　4.1.3 总DNA提取第37页
　　　　4.1.4 SSR扩增第37页
　　　　4.1.5 数据采集第37页
　　4.2 结果分析第37-45页
　　　　4.2.1 总DNA提取结果分析第37-39页
　　　　4.2.2 SSR-PCR结果及多态性分析第39-41页
　　　　4.2.3 通过UPGMA进行遗传相似性分析第41-45页
　　4.3 结论与讨论第45-47页
致谢第47-48页
参考文献第48-55页
个人简介第55页

本篇论文共55页，点击这进入下载页面。
 
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