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基于psbA-trnH基因和18S rDNA的薯蓣属植物系统发育分析

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基于psbA-trnH基因和18S rDNA的薯蓣属植物系统发育分析
论文目录
 
摘要第3-4页
Abstract第4-9页
1 引言第9-20页
  1.1 薯蓣属研究进展第9-10页
    1.1.1 薯蓣的形态特征第9页
    1.1.2 薯蓣的起源与分布第9-10页
  1.2 薯蓣属系统分类学的研究进展第10-12页
    1.2.1 基于形态学的分类第10页
    1.2.2 基于解剖学分类第10-11页
    1.2.3 基于孢粉学分类第11页
    1.2.4 基于细胞学分类第11-12页
  1.3 分子系统学的研究第12-18页
    1.3.1 基于分子标记分类第12-14页
    1.3.2 分子系统学的发展和应用第14-17页
      1.3.2.1 叶绿体DNA第15-16页
      1.3.2.2 核DNA rDNA及ITS第16页
      1.3.2.3 线粒体DNA第16-17页
    1.3.3 系统发育树的意义第17-18页
      1.3.3.1 距离法构建系统树第17-18页
      1.3.3.2 最大似然法第18页
      1.3.3.3 最大简约法第18页
      1.3.3.4 贝叶斯推断法第18页
  1.4 本研究的意义和目的第18-20页
2 方法第20-29页
  2.1 材料第20-24页
  2.2 试剂和仪器第24页
    2.2.1 实验仪器第24页
    2.2.2 实验试剂第24页
  2.3 实验方法第24-29页
    2.3.1 构建形态聚类图第24-25页
    2.3.2 DNA提取方法第25页
    2.3.3 PCR扩增及测序第25-27页
    2.3.4 基因序列确定与亲缘关系分析第27-28页
      2.3.4.1 psbA-trnH基因序列第27-28页
      2.3.4.2 18S rRNA基因序列第28页
    2.3.5 构建系统树第28-29页
3 结果与分析第29-60页
  3.1 不同薯蓣属植物样品的Q型聚类第29-35页
    3.1.1 形态指标统计结果第29-33页
    3.1.2 Q型聚类第33-35页
  3.2 植物总DNA提取第35页
  3.3 PCR扩增结果第35-36页
    3.3.1 psbA-trnH基因序列PCR扩增第35-36页
    3.3.2 18S rRNA基因扩增产物第36页
  3.4 核苷酸序列的比对分析第36-51页
    3.4.1 psbA-trnH基因序列分析结果第36-44页
    3.4.2 18S rDNA序列分析第44-51页
  3.5 K2P遗传距离模型第51-55页
  3.6 系统发育树第55-60页
    3.6.1 基于psbA-trnH基因的系统发育树第55-57页
    3.6.2 18S rRNA基因系统发育树第57-60页
4 讨论第60-65页
5 结论第65-67页
致谢第67-68页
参考文献第68-73页
附录第73-76页
作者简介第76页

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