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基于psbA-trnH基因和18S rDNA的薯蓣属植物系统发育分析
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基于psbA-trnH基因和18S rDNA的薯蓣属植物系统发育分析
论文目录
摘要
第3-4页
Abstract
第4-9页
1 引言
第9-20页
1.1 薯蓣属研究进展
第9-10页
1.1.1 薯蓣的形态特征
第9页
1.1.2 薯蓣的起源与分布
第9-10页
1.2 薯蓣属系统分类学的研究进展
第10-12页
1.2.1 基于形态学的分类
第10页
1.2.2 基于解剖学分类
第10-11页
1.2.3 基于孢粉学分类
第11页
1.2.4 基于细胞学分类
第11-12页
1.3 分子系统学的研究
第12-18页
1.3.1 基于分子标记分类
第12-14页
1.3.2 分子系统学的发展和应用
第14-17页
1.3.2.1 叶绿体DNA
第15-16页
1.3.2.2 核DNA rDNA及ITS
第16页
1.3.2.3 线粒体DNA
第16-17页
1.3.3 系统发育树的意义
第17-18页
1.3.3.1 距离法构建系统树
第17-18页
1.3.3.2 最大似然法
第18页
1.3.3.3 最大简约法
第18页
1.3.3.4 贝叶斯推断法
第18页
1.4 本研究的意义和目的
第18-20页
2 方法
第20-29页
2.1 材料
第20-24页
2.2 试剂和仪器
第24页
2.2.1 实验仪器
第24页
2.2.2 实验试剂
第24页
2.3 实验方法
第24-29页
2.3.1 构建形态聚类图
第24-25页
2.3.2 DNA提取方法
第25页
2.3.3 PCR扩增及测序
第25-27页
2.3.4 基因序列确定与亲缘关系分析
第27-28页
2.3.4.1 psbA-trnH基因序列
第27-28页
2.3.4.2 18S rRNA基因序列
第28页
2.3.5 构建系统树
第28-29页
3 结果与分析
第29-60页
3.1 不同薯蓣属植物样品的Q型聚类
第29-35页
3.1.1 形态指标统计结果
第29-33页
3.1.2 Q型聚类
第33-35页
3.2 植物总DNA提取
第35页
3.3 PCR扩增结果
第35-36页
3.3.1 psbA-trnH基因序列PCR扩增
第35-36页
3.3.2 18S rRNA基因扩增产物
第36页
3.4 核苷酸序列的比对分析
第36-51页
3.4.1 psbA-trnH基因序列分析结果
第36-44页
3.4.2 18S rDNA序列分析
第44-51页
3.5 K2P遗传距离模型
第51-55页
3.6 系统发育树
第55-60页
3.6.1 基于psbA-trnH基因的系统发育树
第55-57页
3.6.2 18S rRNA基因系统发育树
第57-60页
4 讨论
第60-65页
5 结论
第65-67页
致谢
第67-68页
参考文献
第68-73页
附录
第73-76页
作者简介
第76页
本篇论文共
76
页,
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