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尖孢镰刀菌胡麻专化型的转录组学研究

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尖孢镰刀菌胡麻专化型的转录组学研究
论文目录
 
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-10页
一 引言第10-22页
  1.1 胡麻及胡麻枯萎病简介第10-12页
    1.1.1 胡麻及胡麻枯萎病第10页
    1.1.2 胡麻枯萎病致病菌及其作用机制第10-11页
    1.1.3 胡麻枯萎病防治现状第11-12页
  1.2 生物防治第12-14页
    1.2.1 生物防治第12-13页
    1.2.2 微生物生物防治的主要作用机制第13-14页
  1.3 转录组学研究概况第14-18页
    1.3.1 转录组简介第14-15页
    1.3.2 主流转录组测序平台第15-17页
    1.3.3 新一代转录组测序技术的应用第17-18页
  1.4 GO数据库概述第18-19页
  1.5 KEGG数据库概述第19-20页
  1.6 研究意义第20-22页
二 材料方法第22-29页
  2.1 材料第22-24页
    2.1.1 培养基及配制第22页
    2.1.2 菌种第22页
    2.1.3 溶液配制第22-23页
    2.1.4 仪器设备第23页
    2.1.5 试剂、试剂盒第23-24页
  2.2 方法第24-29页
    2.2.1 尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株G56培养方法第24页
    2.2.2 生防菌SF1的培养第24页
    2.2.3 生防菌SF1发酵液无细胞滤液的制备第24-25页
    2.2.4 尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株G56与生防菌SF1的共培养第25页
    2.2.5 生防菌SF1抑菌率的测定第25页
    2.2.6 尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株G56的RNA样本制备第25-26页
    2.2.7 RNA样品质量检测第26页
    2.2.8 转录组测序文库的制备及库检第26-27页
    2.2.9 测序质量评估第27-28页
    2.2.10 生物信息分析流程第28-29页
三 结果与分析第29-47页
  3.1 生防菌SF1对尖孢镰刀菌G56抑制作用的测定第29-30页
  3.2 RNA样品质检结果分析第30-34页
    3.2.1 RNA样品琼脂糖凝胶电泳分析第30-31页
    3.2.2 Nanodrop超微量分光光度计及Qubit检测第31-32页
    3.2.3 安捷伦2100 (Agilent2100)生物芯片分析系统检测第32-34页
  3.3 转录组测序质量评估第34-35页
  3.4 转录组学研究第35-45页
    3.4.1 可变剪切分析第35-36页
    3.4.2 基因表达水平分析第36-38页
    3.4.3 基因差异表达分析第38-40页
    3.4.4 差异基因GO富集分析第40-42页
    3.4.5 差异基因KEGG富集分析第42-45页
  3.5 讨论第45-47页
四 结论与展望第47-48页
  4.1 结论第47页
  4.2 工作展望第47-48页
参考文献第48-53页
附录第53-55页
附录一 部分差异基因BLAST比对结果第53-55页
致谢第55页

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