真菌Tramete versicolor F21a 降解蓝藻过程中蛋白质组与转录组差异比较

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真菌Tramete versicolor F21a 降解蓝藻过程中蛋白质组与转录组差异比较

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真菌Tramete versicolor F21a 降解蓝藻过程中蛋白质组与转录组差异比较

论文目录
摘要	第1-4页
Abstract	第4-9页
1 文献综述	第9-19页
1.1 蓝藻水华及形成原因	第9-10页
1.2 蓝藻水华的危害及治理	第10-12页
1.3 分子机理研究方法	第12-15页
1.3.1 基于差异基因的方法	第12-13页
1.3.2 芯片技术	第13页
1.3.3 转录组技术	第13页
1.3.4 蛋白组学研究	第13-15页
1.4 荧光定量PCR技术	第15-17页
1.5 本研究的目的及意义	第17-19页
2 材料与方法	第19-27页
2.1 材料及仪器	第19-21页
2.1.1 试验材料	第19页
2.1.2 主要仪器和试剂	第19-20页
2.1.3 主要培养基配方	第20-21页
2.1.4 主要试剂配制	第21页
2.2 研究方法	第21页
2.2.1 真菌菌丝膜的培养	第21页
2.2.2 蓝藻细胞的培养	第21页
2.3 Real Time-PCR验证云芝-F21a除藻关键差异基因	第21-23页
2.3.1 真菌菌膜总RNA的提取	第21-22页
2.3.2 Real Time-PCR验证	第22-23页
2.4 真菌蛋白质表达量高通量分析	第23-24页
2.4.1 蛋白质抽提	第23页
2.4.2 胰蛋白酶消化	第23页
2.4.3 TMT标记	第23-24页
2.4.4 HPLC分馏	第24页
2.5 LC-MS/MS定量蛋白组学分析	第24-25页
2.5.1 LC-MS/MS分析	第24-25页
2.5.2 数据库检索	第25页
2.5.3 质谱分析数据质量控制确认	第25页
2.6 生物信息学方法	第25-26页
2.6.1 注释方法	第25-26页
2.7 定量蛋白组学与转录组关联分析	第26页
2.8 纤维素酶降解蓝藻细胞及藻浓度的测定	第26-27页
3 结果与分析	第27-55页
3.1 Real Time-PCR验证	第27-34页
3.1.1 总RNA提取	第27-28页
3.1.2 定量PCR验证	第28-34页
3.2 云芝T. versicolor-F21a菌膜降解蓝藻蛋白组分析	第34-44页
3.2.1 样品的采取	第34页
3.2.2 质谱分析（MS）数据的质量控制确认	第34-35页
3.2.3 原始数据的处理和统计	第35页
3.2.4 蛋白注释分析	第35-37页
3.2.5 GO富集分析	第37-40页
3.2.6 KEGG Pathway富集分析	第40-41页
3.2.7 结构域（Doman）富集分析	第41-42页
3.2.8 亚细胞定位预测分析	第42-44页
3.3 转录组测序结果与蛋白组定量结果关联分析	第44-52页
3.3.1 蛋白组与转录组比较	第44-46页
3.3.2 Go富集分析	第46-49页
3.3.3 KEGG富集分析	第49-50页
3.3.4 蛋白结构域分析	第50-52页
3.4 转录组分析结果中分解酶基因表达与蛋白质含量关联分析	第52-53页
3.5 不同浓度纤维酶与蓝藻细胞作用	第53-55页
4 讨论	第55-58页
5 结论	第58-59页
参考文献	第59-65页
附录	第65-66页
致谢	第66-67页
作者简介	第67页

本篇论文共67页，点击这进入下载页面。

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