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高通量测序鉴定西瓜新病毒

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高通量测序鉴定西瓜新病毒
论文目录
 
摘要第1-6页
abstract第6-10页
英文缩略表第10-11页
第一章 引言第11-19页
  1.1 植物病毒鉴定方法研究进展第11-15页
    1.1.1 生物学检测法第11页
    1.1.2 血清学方法第11-12页
    1.1.3 电子显微镜检测法第12页
    1.1.4 分子生物学方法第12-13页
    1.1.5 高通量测序技术第13-15页
  1.2 西瓜病毒病害研究进展第15-17页
  1.3 研究目的和意义第17-18页
  1.4 技术路线第18-19页
第二章 西瓜标样的RNA-seq和sRNA-seq分析第19-27页
  2.1 材料与方法第19-23页
    2.1.1 样品采集第19页
    2.1.2 试剂与仪器第19-20页
    2.1.3 TRIzol法提取西瓜样品中的总RNA第20页
    2.1.4 小RNA测序及转录组测序第20-21页
    2.1.5 原始数据处理与分析第21页
    2.1.6 RT-PCR检测及验证第21-23页
  2.2 结果与分析第23-25页
    2.2.1 高通量测序结果分析第23-24页
    2.2.2 候选病原物的确定及RT-PCR验证第24-25页
  2.3 小结与讨论第25-27页
第三章 西瓜新病毒的分子鉴定及生物学研究第27-62页
  3.1 材料与方法第27-33页
    3.1.1 样品准备第27页
    3.1.2 试剂及溶液配制第27-28页
    3.1.3 仪器第28页
    3.1.4 西瓜样品总RNA提取第28页
    3.1.5 dsRNA提取第28-29页
    3.1.6 RACE扩增全基因组第29-32页
    3.1.7 病毒粒体形态观察第32页
    3.1.8 生物学测定第32页
    3.1.9 生物信息学分析第32-33页
  3.2 结果与分析第33-59页
    3.2.1 小RNA测序和转录组测序鉴定2种未知的西瓜负单链RNA病毒第33-44页
    3.2.2 小RNA测序和转录组测序鉴定西瓜病毒A(WVA)第44-50页
    3.2.3 小RNA测序鉴定西瓜隐潜病毒(CiLCV)第50-57页
    3.2.4 田间样品多种病毒复合侵染分析第57-59页
  3.3 小结与讨论第59-62页
第四章 全文结论第62-63页
参考文献第63-69页
附录第69-73页
致谢第73-74页
作者简历第74页

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