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养殖河豚鱼肠道细菌16S rDNA多样性分析

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养殖河豚鱼肠道细菌16S rDNA多样性分析
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 综述第11-23页
  1.1 河豚鱼第11-13页
    1.1.1 河豚鱼概况第11-12页
    1.1.2 河豚鱼的营养价值及药用价值第12-13页
  1.2 肠道菌群第13-15页
    1.2.1 肠道菌群的作用第13-14页
    1.2.2 肠道菌群的研究现状第14-15页
  1.3 菌群多样性的研究方法第15-21页
    1.3.1 细菌常规鉴定法第15-16页
    1.3.2 16S rDNA基因技术第16-17页
    1.3.3 限制性片段长度多态性(RFLP)分析技术第17页
    1.3.4 聚合酶链式反应(PCR)技术第17-20页
      1.3.4.1 PCR反应的基本原理第18-19页
      1.3.4.2 PCR反应的影响因素第19-20页
    1.3.5 基因克隆技术第20-21页
  1.4 本论文的研究内容与意义第21-23页
第二章 养殖河豚鱼肠道可培养细菌的筛选与鉴定第23-30页
  2.1 实验材料第23-25页
    2.1.1 实验样品第23页
    2.1.2 主要培养基第23页
    2.1.3 主要仪器第23-24页
    2.1.4 主要试剂第24-25页
  2.2 实验方法第25-27页
    2.2.1 实验工具及样品的前期准备第25页
    2.2.2 细菌的分离纯化第25页
    2.2.3 细菌的鉴定第25-27页
      2.2.3.1 细菌的形态检测第25页
      2.2.3.2 模板DNA的提取第25-26页
      2.2.3.3 16S rDNA的PCR扩增第26页
      2.2.3.4 16S rDNA的序列分析第26-27页
  2.3 结果与讨论第27-30页
    2.3.1 肠道细菌分离纯化结果第27页
    2.3.2 河豚鱼肠道细菌镜检结果第27-28页
      2.3.2.1 河豚鱼肠道可培养细菌的镜检结果第27-28页
    2.3.3 革兰氏染色结果第28页
    2.3.4 细菌总DNA的提取第28页
    2.3.5 16S rDNA的测序结果第28-30页
第三章 16S rDNA克隆文库法分析养殖河豚鱼肠道细菌多样性第30-47页
  3.1 实验材料第30-32页
    3.1.1 实验样品第30页
    3.1.2 主要培养基第30-31页
    3.1.3 主要仪器第31页
    3.1.4 主要试剂第31-32页
  3.2 实验方法第32-38页
    3.2.1 样品的处理第32-33页
    3.2.2 河豚鱼肠道细菌总DNA的提取第33页
    3.2.3 DNA模板的检测第33-34页
    3.2.4 16S rDNA片段的PCR扩增第34页
    3.2.5 PCR产物的回收纯化第34-35页
    3.2.6 构建细菌16S rDNA克隆文库第35-38页
      3.2.6.1 回收纯化PCR产物与pMD19-T载体的连接第35-36页
      3.2.6.2 转化第36-37页
      3.2.6.3 阳性克隆子的筛选第37-38页
      3.2.6.4 限制性片段长度多态性(RFLP)分析及克隆文库覆盖率检测第38页
    3.2.7 细菌16S rDNA片段测序及菌种鉴定第38页
  3.3 结果与讨论第38-47页
    3.3.1 细菌基因组DNA提取和16S rDNA片段的PCR扩增第38-40页
    3.3.2 构建细菌16S rDNA克隆文库及覆盖率第40-43页
    3.3.3 细菌16S rDNA基因序列分析第43-46页
    3.3.4 测序结果的序列系统发育树分析第46-47页
第四章 结论第47-49页
参考文献第49-52页
致谢第52页

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